мутации

Новые мутации в генах, связанных с устойчивостью к цефидероколу, у клинического изолята Pseudomonas aeruginosa

Цель. Проанализировать значимость хромосомных мутаций у клинических изолятов Pseudomonas aeruginosa для формирования резистентности к цефидероколу. Материалы и методы. Дизайн исследования предполагал сравнительный анализ характеристик фенотипической резистентности и особенностей хромосомных мутаций у изолятов P. aeruginosa, которые имеют единое происхождение, но отличаются по уровню чувствительности к цефидероколу. Объектом исследования были два изолята P. aeruginosa, выделенные из одного образца мокроты пациента с муковисцидозом, который ранее не проходил лечение цефидероколом. Методы исследования включали идентификацию при помощи MALDI-TOF масс-спектрометрии с последующим подтверждением на основе данных полногеномного секвенирования.

Mycoplasma genitalium: мониторинг распространения мутаций, связанных с резистентностью к макролидам в России

Цель. Определить спектр и распространенность маркеров резистентности к макролидам у Mycoplasma genitalium в российской популяции пациентов, обратившихся за медицинской помощью в период с 2009 по 2019 г. Материалы и методы. 873 образца ДНК Mycoplasma genitalium из 5 географических регионов России исследовали с помощью разработанной технологии полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, которая позволяет выявлять любые нуклеотидные замены в гене 23S pPHK M. genitalium в позициях 2058, 2059, 2611 (согласно нумерации по E.

Мониторинг мутаций в гене UL97 цитомегаловируса, ассоциированных с резистентностью к ганцикловиру, у детей после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

Цель. Провести генотипирование фосфотрансферазы UL97 цитомегаловируса (ЦМВ) с изучением мутаций, ассоциированных с устойчивостью к ганцикловиру/валганцикловиру (ГЦВ/ ВГЦВ), у детей после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) с подтвержденной ЦМВ-инфекцией. Материалы и методы. В одноцентровое проспективное исследование в период 2020–2021 гг. были включены реципиенты аллогенной ТГСК в возрасте до 18 лет с подтвержденной ЦМВинфекцией, у которых при появлении критериев возможной лекарственной резистентности проводили молекулярно-генетический анализ образцов ДНК ЦМВ. Поиск мутаций резистентности к ГЦВ/ВГЦВ проводили методом секвенирования по Сэнгеру с исследованием участка гена UL97, кодирующего аминокислоты фосфотрансферазы UL97 в пределах 425–670 кодонов.

Оценка влияния мутаций в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae, обуславливающих устойчивость к макролидам, на тяжесть течения внебольничной пневмонии у лиц молодого возраста, находившихся на лечении в Смоленском военном госпитале

Цель. Оценить влияние мутаций в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae, обуславливающих устойчивость к макролидным антибиотикам, на тяжесть течения внебольничной пневмонии (ВП) у иммунокомпетентных лиц молодого возраста. Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ 42 историй болезни пациентов молодого возраста с ВП, находившихся на лечении в Смоленском военном госпитале в период с 25.10.2017 г. по 25.12.2019 г., у которых выявлена M. pneumoniae. Диагноз ВП установлен на основании клинико-лабораторных и рентгенологических данных. До назначения антибактериальной терапии соскобы с задней стенки глотки на наличие ДНК M.

Мутации в гене UL97 цитомегаловируса, ассоциированные с устойчивостью к ганцикловиру, у реципиентов аллогенных гемопоэтических стволовых клеток

Цель. Определение мутаций в гене фосфотрансферазы цитомегаловируса (ЦМВ), ассоциированных с устойчивостью к противовирусным препаратам у пациентов с гемобластозами после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Материалы и методы. В исследование были включены 9 образцов ДНК ЦМВ, выделенных из периферической крови 8 реципиентов алло-ТГСК с ЦМВ-инфекцией, находившихся на лечении в клиниках ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России с 2016 по 2017 г. Для поиска мутаций применяли метод секвенирования по Сэнгеру. Полученную последовательность ДНК анализировали с помощью программ nucleotide BLAST и Genome compiler.

Эпидемиологическая значимость молекулярной изменчивости генома изолятов Pseudomonas aeruginosa, вызывающих хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом

Цель. Представить данные об одном из основных механизмов молекулярной изменчивости P. aeruginosa, вызывающей хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом. Материалы и методы. На протяжении 10 лет исследовано 1800 мазков из зева и образцов мокроты от больных муковисцидозом. Идентификацию P. aeruginosa проводили классическими методами и с помощью тест-системы API 20NE (bioMerieux, Франция). Чувствительность к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом и с помощью АТВТМ PSE 5 (bioMerieux, Франция). Генотипирование проводили методом RAPD-ПЦР и MLST.

Распространенность ассоциированных с устойчивостью к макролидам мутаций у Mycoplasma genitalium среди пациентов с негонококковыми инфекциями, передающимися половым путём, в Смоленске и Туле

Цель. Определить распространенность штаммов Mycoplasma genitalium, устойчивых к макролидам, в период с 2013 по 2017 г. в двух российских городах (Смоленск и Тула). Материалы и методы. В исследование было включено 574 клинических образца (соскобы со слизистых оболочек уретры и цервикального канала), полученных от пациентов с негонококковыми ИППП, в которых была обнаружена ДНК M. genitalium. Образцы выделенной ДНК M. genitalium исследовали с помощью разработанной технологии ПЦР-РВ с эффектом гашения флуоресценции зонда праймером, которая позволяет выявлять любые нуклеотидные замены в гене 23S pPHK в позициях 2058, 2059, 2611 (согласно нумерации для E.

Полногеномное секвенирование штаммов Mycoplasma hominis, устойчивых к ципрофлоксацину

С целью определения молекулярного механизма резистентности к ципрофлоксацину были исследованы клинические изоляты Mycoplasma hominis (2 штамма), выделенные у женщин с воспалительными заболеваниями органов малого таза. Проведено …

Четыре случая выявления мутаций устойчивости в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae, выделенных от военнослужащих с пневмонией, находящихся на лечении в военном госпитале

Mycoplasma pneumoniae — возбудитель заболеваний верхних и нижних дыхательных путей, передается воздушно-капельным путём, вызывая вспышки пневмонии преимущественно в закрытых коллективах. Лечение заболеваний, вызванных M. pneumoniae, в соответствии с …

Оценка распространённости «классических» механизмов устойчивости к фторхинолонам у Chlamydia trachomatis, связанных с мутациями в генах топоизомераз

До настоящего времени мутационная устойчивость C. trachomatis к фторхинолонам, которые используются, наряду с макролидами и тетрациклинами, для лечения хламидийных инфекций, не была описана в клинической практике. Возможность …