Полногеномное секвенирование штаммов Mycoplasma hominis, устойчивых к ципрофлоксацину

Аннотация

С целью определения молекулярного механизма резистентности к ципрофлоксацину были исследованы клинические изоляты Mycoplasma hominis (2 штамма), выделенные у женщин с воспалительными заболеваниями органов малого таза. Проведено полногеномное секвенирование на высокопроизводительном секвенаторе MiSeq (Illumina, США). Показано, что штаммы M. hominis M57 и M. hominis М45 обладают характерным для данного вида содержанием ГЦ-оснований — 27,2%. Установлена высокая степень гомологии белковых последовательностей штаммов M. hominis M57 и M.  hominis М45. Филогенетический анализ показал, что штамм M. hominis M57 эволюционно ближе расположен к штамму M. hominis PG21, а M. hominis M45 к M. hominis H34. Анализ аминокислотных последовательностей генов gyrA, gyrB, parC и parЕ изолятов M. hominis М45 и M. hominis М57 выявил, что молекулярный механизм их резистентности к ципрофлоксацину обусловлен наличием мутационного изменения в QRDR области гена gyrA (субъединица А ДНК-гиразы) с заменой серина (Ser) на лейцин (Leu) в позиции 83. Мутаций, затрагивающих кодоны аминокислот в QRDR области генов gyrB, parC и parE, не обнаружено. Анализ структуры генов gyrA, gyrB, parC и parE показал высокую степень полиморфизма, обусловленную высокой частотой спонтанных мутаций. Определено, что в геноме штаммов M. hominis М45 и M. hominis М57 присутствуют гены семейства эффлюксной системы MATE, но на сегодняшний день их роль в развитии резистентности M. hominis экспериментально не доказана.