Опыт работы

Цель. Разработать и выполнить пилотную проспективную валидацию локально адаптированной педиатрической версии шкалы «СКАТ» для стратификации риска наличия резистентных возбудителей и обоснования выбора стартовой эмпирической антимикробной терапии (АМТ) у госпитализированных детей в условиях многопрофильной детской больницы. Материалы и методы. В период с 15 декабря 2025 г. по 15 февраля 2026 г. на базе ГБУЗ «Морозовская ДГКБ ДЗМ» проведено одноцентровое проспективное наблюдательное исследование, включавшее две последовательные фазы: локальную адаптацию шкалы «СКАТ» для стратификации риска наличия резистентных возбудителей к педиатрической практике и пилотную клиническую валидацию адаптированного варианта.

Цель. Изучить распространенность мутаций, обуславливающих резистентность к макролидам, у Mycoplasma pneumoniae, выделенных у детей с внебольничной пневмонией на территории Смоленской области. Материалы и методы. В исследование было включено 774 положительных на M. pneumoniae образца, выделенных методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ) в соскобах с задней стенки глотки у детей с внебольничной пневмонией в период с 2009 по 2024 г., включающий 3 эпидемических подъема заболеваемости M. pneumoniae (2013–2014, 2018–2019, 2023–2024 гг.

Цель. Изучить распространенность генетических детерминант резистентности к тетрациклинам (tetА, tetB, tetC) у сальмонелл в Красноярском крае и определить эпидемиологически наиболее значимые детерминанты tet-генов. Материалы и методы. Изучены культуры сальмонелл, выделенные на территории Красноярского края при диагностике острых кишечных инфекций, проведении профилактических медицинских осмотров, санитарно-эпидемиологических исследований. Идентификацию проводили с учетом морфо-тинкториальных, культуральных, биохимических, антигенных свойств, фаголизабельности. Чувствительность к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом. Для определения tetА, tetВ и tetС генов использовали полимеразную цепную реакцию с последующей детекцией продуктов амплификации с помощью электрофореза в агарозном геле.

Цель. Проведение полногеномного исследования и биоинформационного анализа штамма Lacticaseibacillus для подтверждения таксономической принадлежности, идентификации генетических детерминант метаболической активности, стрессоустойчивости и продукции бактериоцинов как критерия стандартизации моно- и поликомпонентных пробиотиков. Материалы и методы. Объектом исследования являлся штамм, выделенный от пациента колопроктологического профиля в 2024 г. Культивирование проводилось на среде MRS в микроаэрофильных условиях. Полногеномное секвенирование выполнено на платформе Oxford Nanopore Technologies MinION (ячейки R10.4.1). Сборка генома de novo осуществлена в Flye, оценка качества – QUAST.

Цель. Введение. Селективная деконтаминация кишечника (СДК) нерезорбируемыми антибиотиками рассматривается как перспективный подход к снижению риска инфекций у критически больных пациентов. Однако широкая циркуляция мультирезистентных микроорганизмов, включая карбапенеморезистентные Klebsiella pneumoniae и Pseudomonas aeruginosa, существенно снижает эффективность традиционных режимов СДК на основе монотерапии колистином. Ключевой причиной неудач является широкое «окно селекции мутантов» – диапазон концентраций антибиотика, недостаточных для подавления роста резистентных субпопуляций. Использование антимутантных комбинаций нерезорбируемых антибиотиков может открыть новые перспективы для оптимизации СДК.

Цель. Изучить спектр бактериальной и грибковой микробиоты нижних дыхательных путей у больных туберкулезом с ВИЧ-инфекцией, находившихся на стационарном лечении. Материалы и методы. Всего выполнено 378 микробиологических исследований мокроты от 147 пациентов ФГБУ «ННИИТ» Минздрава России (2021–2024 гг.). Образцы мокроты собирали в соответствии со стандартизированными протоколами, направленными на минимизацию контаминации микробиотой верхних дыхательных путей и обеспечение репрезентативности материала из нижних отделов респираторного тракта. Биоматериал исследовали на селективных питательных средах. Микроорганизмы идентифицировали методом MALDI-tof с помощью масс-спектрометра Microflex (Bruker Daltonics, Германия).

Цель. Выявить ассоциации функциональных полиморфизмов генов иммунной, эндотелиальной и коагуляционной систем с тяжестью течения и исходами сепсиса для обоснования генетических предикторов риска. Материалы и методы. В одноцентровое проспективное исследование включено 124 пациента онкогематологического профиля в возрасте от 1 мес. до 28 лет, у которых зарегистрировано 152 эпизода сепсиса. Генотипирование 20 полиморфных вариантов в 16 генах проведено методом капиллярного секвенирования по Сэнгеру. Статистическая обработка включала оценку соответствия распределения генотипов равновесию Харди – Вайнберга, сравнение частот по доминантной модели наследования с расчетом отношения шансов (OR), критерия χ² с поправкой Йейтса и определение двустороннего уровня значимости p.

Цель. Изучить структуру возбудителей внебольничной инфекции мочевых путей (ИМП) у детского и подросткового населения Красноярского края, а также активность антимикробных препаратов в отношении лидирующего возбудителя с целью оптимизации локальной эмпирической терапии ИМП. Материалы и методы. Проанализированы 298 бактериальных изолятов (164 – в 2023 г. и 134 – в 2024 г.), полученных при бактериологическом исследовании мочи детей и подростков с установленным диагнозом внебольничной ИМП, обратившихся в КГБУЗ «Красноярский краевой клинический центр охраны материнства и детства».

Цель. На основе результатов полногеномного секвенирования дать генетическую характеристику S. aureus, выявленных в реанимационном отделении инфекционного госпиталя в период пандемии COVID-19. Материалы и методы. С помощью полногеномного секвенирования на платформе Illumina MiSeq были получены 20 последовательностей S. aureus, изолированных от пациентов и с объектов внешней среды. Проведен биоинформационный анализ, включающий типирование, определение детерминант резистентности и вирулентности, плазмидных репликонов и филогенетический анализ. Результаты. Выявлено значительное генетическое разнообразие S. aureus, включая четыре клональных комплекса (CC): CC15 – 6⁄20 (30%), CC8 – 3⁄20 (15%), CC22 – 2⁄20 (10%) и CC97 – 2⁄20 (10%), 7⁄20 (35%) изолятов имели неопределенный СС.

Цель. Оценка качества выявляемости бактерий Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp. методом секвенирования гена 16S рРНК с использованием аккредитованных контрольных материалов, предназначенных для проведения внешнего контроля качества ПЦР-исследований. Материалы и методы. Контрольные материалы, полученные в рамках прохождения программы МСИ «ФСВОК»: «Выявление ДНК Mycoplasma hominis, Ureaplasma species, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum ПЦР (ИППП)», были проанализированы методом секвенирования гена 16S рРНК на приборе Illumina MiSeq. Контрольные наборы образцов были представлены лиофилизированными растворами геномной ДНК M.