Опыт работы

Цель. Введение. Селективная деконтаминация кишечника (СДК) нерезорбируемыми антибиотиками рассматривается как перспективный подход к снижению риска инфекций у критически больных пациентов. Однако широкая циркуляция мультирезистентных микроорганизмов, включая карбапенеморезистентные Klebsiella pneumoniae и Pseudomonas aeruginosa, существенно снижает эффективность традиционных режимов СДК на основе монотерапии колистином. Ключевой причиной неудач является широкое «окно селекции мутантов» – диапазон концентраций антибиотика, недостаточных для подавления роста резистентных субпопуляций. Использование антимутантных комбинаций нерезорбируемых антибиотиков может открыть новые перспективы для оптимизации СДК.

Цель. Изучить спектр бактериальной и грибковой микробиоты нижних дыхательных путей у больных туберкулезом с ВИЧ-инфекцией, находившихся на стационарном лечении. Материалы и методы. Всего выполнено 378 микробиологических исследований мокроты от 147 пациентов ФГБУ «ННИИТ» Минздрава России (2021–2024 гг.). Образцы мокроты собирали в соответствии со стандартизированными протоколами, направленными на минимизацию контаминации микробиотой верхних дыхательных путей и обеспечение репрезентативности материала из нижних отделов респираторного тракта. Биоматериал исследовали на селективных питательных средах. Микроорганизмы идентифицировали методом MALDI-tof с помощью масс-спектрометра Microflex (Bruker Daltonics, Германия).

Цель. Выявить ассоциации функциональных полиморфизмов генов иммунной, эндотелиальной и коагуляционной систем с тяжестью течения и исходами сепсиса для обоснования генетических предикторов риска. Материалы и методы. В одноцентровое проспективное исследование включено 124 пациента онкогематологического профиля в возрасте от 1 мес. до 28 лет, у которых зарегистрировано 152 эпизода сепсиса. Генотипирование 20 полиморфных вариантов в 16 генах проведено методом капиллярного секвенирования по Сэнгеру. Статистическая обработка включала оценку соответствия распределения генотипов равновесию Харди – Вайнберга, сравнение частот по доминантной модели наследования с расчетом отношения шансов (OR), критерия χ² с поправкой Йейтса и определение двустороннего уровня значимости p.

Цель. Изучить структуру возбудителей внебольничной инфекции мочевых путей (ИМП) у детского и подросткового населения Красноярского края, а также активность антимикробных препаратов в отношении лидирующего возбудителя с целью оптимизации локальной эмпирической терапии ИМП. Материалы и методы. Проанализированы 298 бактериальных изолятов (164 – в 2023 г. и 134 – в 2024 г.), полученных при бактериологическом исследовании мочи детей и подростков с установленным диагнозом внебольничной ИМП, обратившихся в КГБУЗ «Красноярский краевой клинический центр охраны материнства и детства».

Цель. На основе результатов полногеномного секвенирования дать генетическую характеристику S. aureus, выявленных в реанимационном отделении инфекционного госпиталя в период пандемии COVID-19. Материалы и методы. С помощью полногеномного секвенирования на платформе Illumina MiSeq были получены 20 последовательностей S. aureus, изолированных от пациентов и с объектов внешней среды. Проведен биоинформационный анализ, включающий типирование, определение детерминант резистентности и вирулентности, плазмидных репликонов и филогенетический анализ. Результаты. Выявлено значительное генетическое разнообразие S. aureus, включая четыре клональных комплекса (CC): CC15 – 6⁄20 (30%), CC8 – 3⁄20 (15%), CC22 – 2⁄20 (10%) и CC97 – 2⁄20 (10%), 7⁄20 (35%) изолятов имели неопределенный СС.

Цель. Оценка качества выявляемости бактерий Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp. методом секвенирования гена 16S рРНК с использованием аккредитованных контрольных материалов, предназначенных для проведения внешнего контроля качества ПЦР-исследований. Материалы и методы. Контрольные материалы, полученные в рамках прохождения программы МСИ «ФСВОК»: «Выявление ДНК Mycoplasma hominis, Ureaplasma species, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum ПЦР (ИППП)», были проанализированы методом секвенирования гена 16S рРНК на приборе Illumina MiSeq. Контрольные наборы образцов были представлены лиофилизированными растворами геномной ДНК M.

Цель. Сопоставить профили микробиоты мокроты и бронхиальных смывов у пациентов с туберкулезом легких, полученные с использованием метода ПЦР, и дать оценку клинической значимости полученных микробных профилей. Материалы и методы. Проведено сопоставление результатов исследования мокроты и бронхиальных смывов с использованием ПЦР тест-систем «Бакскрин УПМ» и «Фемофлор 16» (ООО «ДНКТехнология», Россия) у 51 пациента с туберкулезом легких. Результаты. Проведенные исследования показали, что как в мокроте, так и в бронхиальных смывах у большинства пациентов выявлялись следующие доминирующие таксоны микроорганизмов: представители родов Streptococcus, Veillonella, Prevotella, Haemophilus.

Цель. Создание и оценка эффективности комплексной системы для автоматической валидации микробиологических заключений и мониторинга антимикробной резистентности (АМР) в режиме реального времени на региональном уровне в Ямало-Ненецком автономном округе (ЯНАО). Материалы и методы. Проспективное исследование проводилось с октября 2023 г. по июнь 2025 г. на базе Медицинского информационно-аналитического центра и пяти крупнейших больниц ЯНАО. Дизайн исследования включал сравнительный анализ состояния мониторинга АМР до и после внедрения цифровой платформы. Объекты исследования – данные 11728 микробиологических заключений и 12216 изолятов, а также результаты опроса 53 врачей.

Цель. Разработать и провести первый этап валидации ПЦР-теста для выявления ключевых мутаций в V домене гена 23S рРНК M. pneumoniae (A2058G, A2059G, A2062C), позволяющего определять мутации, опосредующие устойчивость к макролидам у M. pneumoniae в образцах нативного биоматериала. Материалы и методы. В исследование включена панель образцов ДНК M. pneumoniae (n = 107) из коллекции многоцентрового исследования DeMaRes (https://amrcloud.net/ru/project/demares/), а также использован нативный биоматериал (n = 52): орофарингеальные мазки (n = 45), трахеальный аспират (n = 4) и бронхоальвеолярный лаваж (n = 3), полученный за период с марта по апрель 2025 г.

Цель. Определение антимикобактериальной эффективности композиционного материала, импрегнированного серебром, в отношении M. tuberculosis. Материалы и методы. В НИЦ «Курчатовский институт» были получены образцы внешней оболочки объемных пористых композиционных материалов с включенными в структуру антимикобактериальными веществами (наночастицами серебра, а также серебра протеинатом). Всего было получено два типа образцов с различным содержанием частиц: «хитозан Ag» и «хитозан Ag2». Для получения внешней оболочки с импрегнированным в структуру комплексом протеината серебра из хитозана Primex 43040 с глутаровым альдегидом добавляли водный раствор протеината серебра с различными концентрациями («хитозан Пр» и «хитозан Пр2»).