Опыт работы

Цель. На основе результатов полногеномного секвенирования дать генетическую характеристику S. aureus, выявленных в реанимационном отделении инфекционного госпиталя в период пандемии COVID-19. Материалы и методы. С помощью полногеномного секвенирования на платформе Illumina MiSeq были получены 20 последовательностей S. aureus, изолированных от пациентов и с объектов внешней среды. Проведен биоинформационный анализ, включающий типирование, определение детерминант резистентности и вирулентности, плазмидных репликонов и филогенетический анализ. Результаты. Выявлено значительное генетическое разнообразие S. aureus, включая четыре клональных комплекса (CC): CC15 – 6⁄20 (30%), CC8 – 3⁄20 (15%), CC22 – 2⁄20 (10%) и CC97 – 2⁄20 (10%), 7⁄20 (35%) изолятов имели неопределенный СС.

Цель. Оценка качества выявляемости бактерий Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp. методом секвенирования гена 16S рРНК с использованием аккредитованных контрольных материалов, предназначенных для проведения внешнего контроля качества ПЦР-исследований. Материалы и методы. Контрольные материалы, полученные в рамках прохождения программы МСИ «ФСВОК»: «Выявление ДНК Mycoplasma hominis, Ureaplasma species, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum ПЦР (ИППП)», были проанализированы методом секвенирования гена 16S рРНК на приборе Illumina MiSeq. Контрольные наборы образцов были представлены лиофилизированными растворами геномной ДНК M.

Цель. Сопоставить профили микробиоты мокроты и бронхиальных смывов у пациентов с туберкулезом легких, полученные с использованием метода ПЦР, и дать оценку клинической значимости полученных микробных профилей. Материалы и методы. Проведено сопоставление результатов исследования мокроты и бронхиальных смывов с использованием ПЦР тест-систем «Бакскрин УПМ» и «Фемофлор 16» (ООО «ДНКТехнология», Россия) у 51 пациента с туберкулезом легких. Результаты. Проведенные исследования показали, что как в мокроте, так и в бронхиальных смывах у большинства пациентов выявлялись следующие доминирующие таксоны микроорганизмов: представители родов Streptococcus, Veillonella, Prevotella, Haemophilus.

Цель. Создание и оценка эффективности комплексной системы для автоматической валидации микробиологических заключений и мониторинга антимикробной резистентности (АМР) в режиме реального времени на региональном уровне в Ямало-Ненецком автономном округе (ЯНАО). Материалы и методы. Проспективное исследование проводилось с октября 2023 г. по июнь 2025 г. на базе Медицинского информационно-аналитического центра и пяти крупнейших больниц ЯНАО. Дизайн исследования включал сравнительный анализ состояния мониторинга АМР до и после внедрения цифровой платформы. Объекты исследования – данные 11728 микробиологических заключений и 12216 изолятов, а также результаты опроса 53 врачей.

Цель. Разработать и провести первый этап валидации ПЦР-теста для выявления ключевых мутаций в V домене гена 23S рРНК M. pneumoniae (A2058G, A2059G, A2062C), позволяющего определять мутации, опосредующие устойчивость к макролидам у M. pneumoniae в образцах нативного биоматериала. Материалы и методы. В исследование включена панель образцов ДНК M. pneumoniae (n = 107) из коллекции многоцентрового исследования DeMaRes (https://amrcloud.net/ru/project/demares/), а также использован нативный биоматериал (n = 52): орофарингеальные мазки (n = 45), трахеальный аспират (n = 4) и бронхоальвеолярный лаваж (n = 3), полученный за период с марта по апрель 2025 г.

Цель. Определение антимикобактериальной эффективности композиционного материала, импрегнированного серебром, в отношении M. tuberculosis. Материалы и методы. В НИЦ «Курчатовский институт» были получены образцы внешней оболочки объемных пористых композиционных материалов с включенными в структуру антимикобактериальными веществами (наночастицами серебра, а также серебра протеинатом). Всего было получено два типа образцов с различным содержанием частиц: «хитозан Ag» и «хитозан Ag2». Для получения внешней оболочки с импрегнированным в структуру комплексом протеината серебра из хитозана Primex 43040 с глутаровым альдегидом добавляли водный раствор протеината серебра с различными концентрациями («хитозан Пр» и «хитозан Пр2»).

Цель. Оценить влияние пандемии COVID-19 на структуру возбудителей перипротезной инфекции (ППИ) и динамику их антибиотикорезистентности. Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ 379 штаммов микроорганизмов, выделенных у пациентов с ППИ коленного и тазобедренного суставов, получивших хирургическое лечение в Федеральном центре травматологии и ортопедии в 2018–2024 гг. Биологическим материалом для исследования были образцы синовиальной жидкости, тканевые биоптаты, аспираты с удаленных имплантатов после ультразвуковой обработки. Выделенные возбудители идентифицировали биохимическим методом с помощью анализаторов VITEC 2 Сompact или Multiscan FC.

Цель. Определить распространенность M. pneumoniae и C. pneumoniae у пациентов с обострением хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) в осенне-зимний период 2022–2023 гг. в Смоленской области. Материалы и методы. В исследовании приняли участие 53 пациента с обострением ХОБЛ, обратившихся к пульмонологу ОГБУЗ «КБ № 1» г. Смоленска за медицинской помощью. Включены больные от легкого до тяжелого течения, получавшие базисную противовоспалительную терапию согласно клиническим рекомендациям по ведению пациентов с ХОБЛ. Всем пациентам было проведено стандартное клинико-лабораторное обследование, выполнена оценка функции внешнего дыхания и рентгенография.

Цель. Сравнить антибактериальную активность макроцидинов А и Z в отношении стафилококков, а также оценить их влияние на биопленки. Материалы и методы. Антибактериальную активность макроцидинов A и Z, продуцируемых Didymella baileyae VIZR 1.53, изучали методом серийных разведений в отношении 120 культур стафилококков, выделенных от пациентов ортопедического профиля. Влияние макроцидинов на биопленкообразование 60 клинических культур S. aureus оценивали по методу O’Toole путем совместной инкубации активных веществ с бактериями и дальнейшего расчета показателей MBIC50/90.

Ralstonia insidiosa не принято считать этиологически значимым микроорганизмом, способным вызывать инфекционные осложнения. В данной статье представлен ретроспективный анализ серии внутрибольничных инфекций, вызванных R. insidiosa, у 8 коморбидных …