полногеномное секвенирование

Цель. Изучить генетические детерминанты резистентности и вирулентности штаммов K. pneumoniae, поступивших в референс-центр по предупреждению распространения биологических угроз ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России. Материалы и методы. В исследование включены 153 штамма Klebsiella pneumoniae, выделенные из биологического материала беременных женщин и новорожденных детей, находящихся в Перинатальных центрах различных регионов Российской Федерации с инфекционно-воспалительными заболеваниями и поступившие в коллекцию условно-патогенных микроорганизмов референс-центра в 2023 г. Для всех штаммов определяли минимальную подавляющую концентрацию (МПК) к основным антимикробным препаратам (АМП) методом микроразведений в бульоне и получали полногеномные данные с помощью технологии высокопроизводительного секвенирования.

Цель. В 2023–2024 году в Москве был отмечен рост заболеваемости пневмонией, вызванной M. pneumoniae. Для изучения молекулярно-генетических особенностей патогена, наибольшей информативностью обладают полногеномные последовательности. Однако, в настоящее время количество геномных данных M. pneumoniae крайне ограничено. Геномные данные актуальных для Российской Федерации изолятов до настоящего исследования в открытых источниках отсутствовали. Таким образом, целью исследования стало получение культур и полногеномных последовательностей изолятов M. pneumoniae, актуальных для РФ, их полная аннотация и изучение молекулярно-генетических характеристик.

Пневмококковые конъюгированные вакцины содержат ограниченное количество серотипов – специфических антигенов S. pneumoniae. Для мониторинга эффективности программ вакцинопрофилактики важно контролировать уровень разнообразия серотипов циркулирующих …

Цель. Представить данные об одном из основных механизмов молекулярной изменчивости P. aeruginosa, вызывающей хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом. Материалы и методы. На протяжении 10 лет исследовано 1800 мазков из зева и образцов мокроты от больных муковисцидозом. Идентификацию P. aeruginosa проводили классическими методами и с помощью тест-системы API 20NE (bioMerieux, Франция). Чувствительность к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом и с помощью АТВТМ PSE 5 (bioMerieux, Франция). Генотипирование проводили методом RAPD-ПЦР и MLST.

С целью определения молекулярного механизма резистентности к ципрофлоксацину были исследованы клинические изоляты Mycoplasma hominis (2 штамма), выделенные у женщин с воспалительными заболеваниями органов малого таза. Проведено …