Локальный микробиологический мониторинг как основа определения этиологической значимости условных патогенов: результаты анализа данных на примере отделения ожоговой реанимации | КМАХ

Локальный микробиологический мониторинг как основа определения этиологической значимости условных патогенов: результаты анализа данных на примере отделения ожоговой реанимации

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2021; 23(1):100-112

​ Ярец Ю.И., Шевченко Н.И., Еремин В.Ф., Ковалев В.О.
10.36488/cmac.2021.1.100-112
этиология микробные ассоциации ожоговая болезнь антибиотикорезистентность
Раздел
Опыт работы
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2021; 23(1):100-112

Цель.

Оценка таксономической структуры возбудителей инфекций, их ассоциаций и чувствительности к антимикробным препаратам в отделении ожоговой реанимации.

Материалы и методы.

Проведено микробиологическое исследование 1322 биологических образцов от 195 пациентов с ожоговой болезнью – 479 проб крови, 82 пробы отделяемого дыхательных путей, 326 проб мочи из мочевого катетера, 435 проб раневого отделяемого. Для выделенных микроорганизмов выполняли анализ чувствительности к антибиотикам, рассчитывали коэффициенты постоянства и ассоциативности (КА), коэффициент Жаккара.

Результаты.

Виды микроорганизмов, выделенных из биообразцов, были представлены: Pseudomonas aeruginosa – 23%, Acinetobacter baumannii – 19,1%, Enterococcus faecalis – 18,6%, Klebsiella pneumoniae – 8,2%, коагулазонегативные стафилококки (КНС) – 8,2%, Staphylococcus aureus – 7,1%, Candida albicans – 7,1%, Candida non-albicans – 3%, остальные виды высевались с частотой < 2%. Большинство микроорганизмов показывали высокую ассоциативность: неферментирующие бактерии (НФБ), S. aureus, Enterobacterales, E. faecalis, Candida non-albicans образовывали ассоциации в 60,0%, 88,8%, 83,0%, 83,3% и 65% случаев соответственно. Распространенность метициллинорезистентных штаммов S. aureus и КНС была одинаковой – 71% и 81%. КНС демонстрировали более высокую резистентность к фторхинолонам и гентамицину, чем S.aureus: 42% и 23%, 46% и 29% соответственно (χ2 = 6,91; р = 0,086; χ2 = 6,58; р = 0,013). Высокий уровень резистентности к аминогликозидам и фторхинолонам проявляли и E. faecalis (> 60%). К ванкомицину, линезолиду, тигециклину, тейкопланину все грамположительные изоляты были чувствительны. Устойчивость грамотрицательных бактерий (НФБ, K. pneumoniae) к цефалоспоринам, карбапенемам (для НФБ), аминогликозидам была высокой – от 60% до 100%. Наиболее активным против НФБ оставался колистин. Резистентность K. pneumoniae к карбапенемам составляла 23%, другие энтеробактерии характеризовались высокой чувствительностью к этой группе препаратов.

Выводы.

Результаты проведенного микробиологического мониторинга позволили охарактеризовать качественную структуру и фенотипическую резистентность микрофлоры биологических сред пациентов отделения ожоговой реанимации, определить показатели долевого участия, характера ассоциативности микробных таксонов. Полученные данные могут служить основой совершенствования методологических подходов к оценке этиологической значимости и будут использованы для установления приоритетных патогенов для указанной категории пациентов.

Ярец Юлия Игоревна

ГУ «Республиканский научно-практический центр радиационной медицины и экологии человека», Гомель, Республика Беларусь

Шевченко Н.И.

ГУ «Республиканский научно-практический центр радиационной медицины и экологии человека», Гомель, Республика Беларусь

Еремин В.Ф.

ГУ «Республиканский научно-практический центр трансфузиологии и медицинских биотехнологий», Минск, Республика Беларусь

Ковалев В.О.

ГУЗ «Гомельская городская клиническая больница № 1», Гомель, Республика Беларусь

  • 1. Fominykh S.G., Danilov A.I., Gonnoshenko V.N., Kalchenko E.V. Interval prediction of the proportion of dominant wound pathogens in the etiological structure of wound infections and evaluation of the potential effectiveness of antimicrobial agents. Antibiotics and Chemothetapy. 2019;64(7-8):24–30. Russian (Фоминых С.Г., Данилов А.И., Гонношенко В.Н., Кальченко Е.В. Интервальный прогноз величины долей доминирующих раневых патогенов в этиологической структуре раневых инфекций и оценка потенциальной эффективности антимикробных препаратов. Антибиотики и химиотерапия. 2019;64(78):24–30.). DOI: 10.24411/0235-29902019-100040
  • 2. Vorobyova O.N., Denissenko L.I., Shtanova T.N., Sosedova L.M. Microbiological monitoring of nosocomial pathogens in the urgent surgical unit. Bulletin ESSC SB RAMS 2009;68(4):61–67. Russian. (Воробьева О.Н., Денисенко Л.И., Штанова Т.Н., Соседова Л.М. Микробиологический мониторинг возбудителей внутрибольничных инфекций в отделении экстренной хирургии. Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2009;68(4):61–67.)
  • 3. Andreeva S.V., Khaydarshina N.E., Nokhrin D.YU The use of statistical methods in the analysis of the dynamics of the species structure of microbial communities in the case of burn injury. Laboratory Service. 2019;8(1):65–72. https://doi.org/10.17116/labs2019801165 Russian. (Андреева С.В., Хайдаршина Н.Э., Нохрин Д.Ю. Использование статистических методов в анализе динамики видовой структуры микробных сообществ при ожоговой травме. Лабораторная служба. 2019;8(1):65–72.).
  • 4. Clinical recommendations. Susceptibility testing of microorganisms to antimicrobial agents, 2015. Available at: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2018.pdf. Accessed July 17, 2020. Russian. (Клинические рекомендации. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам, 2015. Доступно по адресу: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2018.pdf. Ссылка активна на 17.07.2020 г.).
  • 5. The European Committee on antimicrobial susceptibility testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 10.0, 2020. Available at: http://www. eucast.org Accessed July 17, 2020. Russian. (Европейский комитет по определению чувствительности к антимикробным препаратам. Таблицы пограничных значений для интерпретации значений МПК и диаметров зон подавления роста. Версия 10.0, 2020. http://www.eucast.org. http://www.antibiotic.ru/iacmac/ru/docs/eucast/eucast-clinical-breakpoints-bacteria-10.0-rus.pdf Ссылка активна на 17.07.2020 г.).
  • 6. Kozlov R.S., Menshikov V.V., Michaylova V.S., Shulyak B.F., Dolgich T.I., Kruglov A.N. et al. Clinical recommendations. Bacteriological analysis of urine, 2014. Available at: https://fedlab.ru/upload/medialibrary/d6f/kochetovag.-klin.-rek._-kld.-2014-bakteriologicheskiy-analiz-mochi.pdf Accessed July 17, 2020. Russian. (Козлов Р.С., Меньшиков В.В., Михайлова В.С., Шуляк Б.Ф., Долгих Т.И., Круглов А.Н. и соавт. Клинические рекомендации. Бактериологические анализ мочи, 2014. Доступно по адресу: https://fedlab.ru/upload/medialibrary/d6f/kochetov-ag.-klin.-rek.-kld.-2014bakteriologicheskiy-analiz-mochi.pdf. Ссылка активна на 17.07.2020 г.).
  • 7. Gelfand B.R., Kozlov R.S., Kubyshkin V.A., KhachatryanN.N., eds. Russian national recommendations. Surgical infections of the skin and soft tissues. 2nd ed., rev. – M., 2015. 109 p. Russian. (Под ред. Гельфанда Б.Р., Козлова Р.С., Кубышкина В.А., Хачатряна Н.Н. Российские национальные рекомендации. Хирургические инфекции кожи и мягких тканей. 2-ое изд. допол. – М., 2015. 109 с.).
  • 8. Gelfand B.R., Protsenko D.N., Belotserkovsky B.Z., eds. Russian national recommendations. Nosocomial pneumonia in adults. 2nd ed., rev. and add. – M.: OOO «Izdatel’stvo «Meditsinskoye informatsionnoye agenstvo», 2016, 176 p. Russian. (Под ред. Гельфанда Б.Р. Проценко Д.Н., Белоцерковского Б.З. Российские национальные рекомендации. Нозокомиальная пневмония у взрослых. 2-е изд., перераб. и доп. – М.: ООО «Издательство «Медицинское информационное агентство», 2016. 176 с.).
  • 9. Dmitrieva N.V., Petuchova E.G., Gromova E.G., eds. Sepsis: selected issues of diagnosis and treatment – M.: ID «ABVpress», 2018. 416 p. Russian (под ред. Дмитриевой Н.В., Петуховой И.Н., Громовой Е.Г. Сепсис: избранные вопросы диагностики и лечения – М.: ИД «АБВ-пресс», 2018. 416 с.).
  • 10. Kungurtseva E.A. Darenskaya M.A. Ivanova E.I., Pristavka А.А., Tunik T.V., Nemchenko U.M. et al. Characteristics of nasopharyngeal microbiocenosis and evaluation of the interaction of its associates in women with chronic endometritis. 2018;3(6):29–35. Russian. (Кунгурцева Е.А., Даренская М.А., Иванова Е.И., Приставка А.А., Туник Т.В., Немченко У.М., Григорова Е.В., Лещенко О.Я. и соавт. Характеристика носоглоточного микробиоценоза и оценка взаимодействия его ассоциантов у женщин с хроническим эндометритом. Acta biomedica scientifica. 2018;3(6):29–35.). DOI: 10.29413/ABS.2018-3.6.4
  • 11. Belyaeva E.V., Ermolina G.B., Kichikova V.V., Nikiforov V.A. A study associations in the microbiocenosis of nasopharynx of practically healthy persons. Vestnik of Lobachevsky State University of Nizhni Novgorod. 2012;3(2):20–24. Russian. (Беляева Е.В., Ермолина Г.Б., Кичикова В.В, Никифоров В.А. Исследование ассоциаций бактерий в микробиоценозе слизистой носоглотки практический здоровых людей. Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. 2012;3(2):20–24.).
  • 12. Gostev V.V., Kalinogorskaya O.S., Kruglov A.N., Sidorenko S.V. Antibiotic resistance of coagulasenegative staphylococci isolated at hospitals of St.Peterburg and Moscow. Antibiotics and Chemothetapy. 2015;60(9–10):23–28. Russian (Гостев В.В., Калиногорская О.С., Круглов А.Н., Сидоренко С.В. Антибиотикорезистентность коагулазоотрицательных стафилококков, выделенных в стационарах СанктПетербурга и Москвы. Антибиотики и химиотерапия. 2015;60(9–10):23–28.).
  • 13. Klyasova G.A., Fedorova A.V., Frolova I.N., Khrulnova S.A., Vetokhina A.V., Kaporskaya T.S. et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterococcus spp. isolated from blood culture in patients with hematological malignancies Антибиотикорезистентность госпитальных штаммов Enerococcus spp., выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови: результаты многоцентрового исследования. CMAC. 2018;20(2):142–149. Russian (Клясова Г.А., Федорова А.В., Фролова И.Н., Хрульнова С.А., Ветохина А.В., Капорская Т.С. и соавт. КМАХ. 2018;20(2):142–149.
  • 14. European Сentre for Disease Prevention and Control. Surveillance Atlas of Infectious Disease Stockholm: ECDC; 2017. Available at: https://ecdc.europa.eu/en/surveillance-atlas-infectious-diseases. Accessed: 19.05.2020.
  • 15. Ilykevich G.V., Smirnov V.M., Levshina Antibiotic resistance of gramnegative nosocomial pathogens in Minsk ICUs. Antibiotics and Chemothetapy. 2009;54(11–12):25–31. Russian (Илюкевич Г.В., Смирнов В.М., Левшина Н.Н. Антибиотикорезистентность грамотрицательных возбудителей госпитальных инфекций в ОРИТ многопрофильных стационаров г. Минска. Антибиотики и химиотерапия. 2009;54(11–12):25–31.).
  • 16. Khokhlova O.E., Peryanova O.V., Vladimirov I.V., Matskevich V.A., Potkina N.K., Kapshuk D.N. et al. Microbiological Monitoring of Purulent Complications in Burn Patients and Molecular Genetic Features of MethicillinResistant Staphylococcus Aureus (MRSA). Antibiotics and Chemothetapy. 2017;62(9):27–33. Russian. (Хохлова О.Е., Перьянова О.В., Владимиров И.В., Мацкевич В.А., Поткина Н.К., Капшук Д.Н., и соавт. Микробиологический мониторинг гнойных осложнений у ожоговых больных и молекулярно-генетические особенности метициллинорезистентных Stаphylococcus aureus (MRSA). Антибиотики и химиотерапия. 2017;62(9):27–33.).
  • 17. Samartsev V.A., Encheva Y.A., Kuznetsova M.V., Karpunina T.I. The peculiarities of burn wound contamination. Novosti Khirurgii. 2014;22(2):199–206. Russian (Самарцев В.А., Еньчева Ю.А., Кузнецова М.В., Карпунина Т.И. Особенности инфицирования ожоговых ран. Новости хирургии. 2014;22(2):199–206.).
  • 18. Gordinskaya N.A., Sabirova E.V., Abramova N.V., Dudoreva E.V., Skleenova E.Yu., Nekaeva E.S. Phenotypic and genetic characterisrics of pathogens causing burn wound infections CMAC. 2012;14(4):342–346. Russian (Гординская Н.А., Сабирова Е.В., Абрамова Н.В., Дударева Е.В., Склеенова Е.Ю., Некаева Е.С. Фенотипические и молекулярно-генетические особенности возбудителей раневой ожоговой инфекции. КМАХ. 2012;14(4):342–346.).
  • 19. Fournier A., Voirol P., Krähenbühl M., Bonnemain C.L., Fournier C., Pantet O. et al. Antibiotic consumption to detect epidemics of Pseudomonas aeruginosa in a burn centre: A paradigm shift in the epidemiological surveillance of Pseudomonas aeruginosa nosocomial infections. Burns. 2016;42(3):564–570. DOI: 10.1016/j.burns.2015.10.030
  • 20. Petriuk B.V., Sydorchuk R.I., Khomko O.Y., Sydorchuk L.P., Petriuk T.A., Khomko B.O. The Canges of Burned Wounds Microbiocenosis Under Intratissue Electrophoresis of Antibacterial Remedies. European J. of Medicine. 2015;7(1):29–33. Russian (Петрюк Б.В., Сидорчук Р.И., Хомко О.И., Сидорчук Л.П., Петрюк Т.А., Хомко Б.О. Изменения микробиоценоза ожоговых ран под влиянием внутритканевого электрофореза противомикробных средств. Европейский медицинский журнал. 2015;7(1):29–33.). DOI: 10/13187/ejm.2015.7.29
  • 21. Yang F., Bing X., Feng D.B., Yang K.Lv., Hui S.Z., Lu W., et al. Pathogenic alteration in severe burn wounds. Burns. 2012;38(1):90–94. doi: 10.1016/j.burns.2011.02.006.
  • 22. Fomicheva T.D., Turkutyukov V.B., Sotnichenko S.A., Terekhov S.M., Skurikhina Yu.E., Okrokov V.G. Microbiological monitoring in the epidemiological surveillance system for purulent-septic infections in case of burn ingury. PMJ. 2018;3:72–74. Russian (Фомичева Т.Д., Туркутюков В.Б., Сотниченко С.А., Терехов С.М., Скурихина Ю.Е., Окроков М.В. Микробиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за гнойно-септическими инфекциями при ожоговой травме. ТМЖ. 2018;3:72–74.). DOI: 10.17238/PmJ1609-1175.2018.3.72–74
  • 23. Watkins R.R., David M.Z., Salata R.A. Current concepts on the virulence mechanisms of meticillin-resistant Staphylococcus aureus. J. Med Microbiol. 2012;61:1179– 1193. DOI: 10.1099/jmm.0.043513-0
  • 24. Becker K., Heilmann C., Peters G. Coagulase-negative staphylococci. CMR. 2014;27(4):870–926. DOI: 10.1128/CMR.00109-13
  • 25. Bukharin O.V. Symbiotic interactions of microorganisms during infections. Zh.Mikrobiol. 2013;1:93–97. Russian (Бухарин О.В. Симбиотические взаимоотношения микроорганизмов при инфекции. Журн. Микробиол. 2013;1:93–97.).
  • 26. Bukharin O.V., Pankov A.S., Skachkov M.V. The bacterial associations in microsimbiocenosis of upper respiratory ways of influenza patients. Epidemiologia i vakcinoprofilaktika. 2010;55(6):12–16. Russian (Бухарин О.В. Бактериальные ассоциации в микросимбиоценозе верхних дыхательных путей у больных гриппом. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2010;55(6):12–16.).
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились