сиквенс-тип

Цель. Изучить генетическое разнообразие штаммов K. pneumoniae, выделенных в Национальном медико-хирургическом центре им. Н.И. Пирогова г. Москвы, с помощью секвенирования нового поколения. Материалы и методы. В анализ включено 19 штаммов K. pneumoniae (18 из различного биологического материала и 1 с объектов внутрибольничной среды), выделенных в медико-хирургическом центре в период с 30 января по 9 октября 2017 г., фенотипически проявляющих множественную резистентность к антимикробным препаратам. Секвенирование ДНК штаммов проводилось на приборе Illumina HiSeq1500 с использованием наборов Illumina HiSeq PE Rapid Cluster Kit v2 и Illumina HiSeq Rapid SBS Kit v2.

Цель. Анализ штаммов Streptococcus pneumoniae — ведущего возбудителя острого среднего отита (ОСО) у детей. Изучение чувствительности к антибиотикам, клональной и серотиповой структуры пневмококков, выделенных из жидкости среднего уха (ЖСУ) у детей с ОСО. Материалы и методы. Материал и методы. Образцы ЖСУ у детей ≤5 лет с ОСО собирали в четырёх детских клиниках г. Москвы в 2011–2013 гг. Выделение и идентификацию пневмококка проводили стандартными микробиологическими методами; чувствительность к антибиотикам определяли с помощью диско-диффузионного метода, минимальную подавляющую концентрацию (МПК) пенициллина и амоксициллина оценивали Е-тестом.