Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2025; 27(4):475-484
Определить структуру популяции клинических штаммов P. aeruginosa в стационарах различных регионов России и оценить роль клонов «высокого риска» в распространении карбапенемаз и резистентности к карбапенемам.
В исследование включены последовательные, неповторяющиеся клинические изоляты P. aeruginosa (N = 1379), полученные в 55 стационарах 30 городов России в течение 24 месяцев. Видовую идентификацию изолятов проводили методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Определение чувствительности к антибиотикам выполняли методом микроразведений в бульоне. Наличие генов приобретенных карбапенемаз групп VIM, IMP, NDM, GES-2/-5 определяли с помощью ПЦР в реальном времени. Субвидовое типирование изолятов и определение их принадлежности к известным сиквенс-типам и клональным комплексам проводили путем идентификации однонуклеотидных полиморфизмов в 7 хромосомных локусах, используемых в схеме мультилокусного секвенирования-типирования (MLST). Для выборочных изолятов, относящихся к основным клонам «высокого риска», выполнено полногеномное секвенирование (WGS) с последующей аннотацией генов резистентности.
Все исследованные изоляты P. aeruginosa были отнесены к 264 генетическим линиям, среди которых наибольшее распространение имели четыре клональных комплекса, относящихся к международным «клонам высокого риска»: CC235 (13,05%), CC244 (7,11%), CC654 (5,51%) и CC357 (4,21%). Три из этих линий – CC235, CC357 и CC654 – характеризовались значительно более высокими уровнями устойчивости к большинству антибиотиков, включая карбапенемы, и чаще ассоциировались с нозокомиальными, чем с внебольничными инфекциями. У 14,5% изолятов выявлена продукция карбапенемаз (VIM – 11,02%, GES-5 – 2,61%, IMP – 0,44%, NDM – 0,44%), при этом большинство карбапенемазопродуцирующих штаммов принадлежали к клональным комплексам CC235 (52,0%) и CC654 (35,0%). Изоляты CC235, выделенные в различных регионах России, демонстрировали по данным WGS наибольшее разнообразие детерминант резистентности, включая гены карбапенемаз VIM-2, GES-5 и IMP-1. Напротив, все изоляты CC654 несли ген металло-β-лактамазы VIM-2 и имели сходные генотипы и фенотипы устойчивости к антибиотикам разных классов. По сравнению с результатами предыдущих исследований в России отмечается тенденция к снижению доли CC235, включая карбапенемазопродуцирующие штаммы, при одновременном сохранении стабильной распространенности других клонов «высокого риска» в популяции P. aeruginosa.
Несмотря на выявленное снижение частоты продукции карбапенемаз и уровня устойчивости к карбапенемам, полученные данные свидетельствуют о том, что штаммы, принадлежащие к клонам «высокого риска», остаются основными резервуарами и источниками распространения резистентности, что подчеркивает необходимость поддержания систематического молекулярного надзора и контроля за их циркуляцией.