Антибиотикорезистентность

Новые мутации в генах, связанных с устойчивостью к цефидероколу, у клинического изолята Pseudomonas aeruginosa

Цель. Проанализировать значимость хромосомных мутаций у клинических изолятов Pseudomonas aeruginosa для формирования резистентности к цефидероколу. Материалы и методы. Дизайн исследования предполагал сравнительный анализ характеристик фенотипической резистентности и особенностей хромосомных мутаций у изолятов P. aeruginosa, которые имеют единое происхождение, но отличаются по уровню чувствительности к цефидероколу. Объектом исследования были два изолята P. aeruginosa, выделенные из одного образца мокроты пациента с муковисцидозом, который ранее не проходил лечение цефидероколом. Методы исследования включали идентификацию при помощи MALDI-TOF масс-спектрометрии с последующим подтверждением на основе данных полногеномного секвенирования.

Оценка эффективности применения стратегии сдерживания антибиотикорезистентности: результаты десятилетнего исследования в многопрофильном стационаре

Цель. Оценить результаты реализации стратегии контроля антимикробной терапии (СКАТ) в многопрофильном стационаре в России. Материалы и методы. Ретроспективное интервенционное исследование выполнено на базе 600-коечного многопрофильного стационара ФГБУ «НМХЦ им. Н.И. Пирогова» Минздрава России (Москва). В рамках настоящего исследования проведен ряд последовательных вмешательств (комплекс подходов и инструментов программы СКАТ), направленных на совершенствование профилактики, диагностики и лечения инфекций, с ретроспективной оценкой следующих показателей в динамике: структура выделяемых микроорганизмов в стационаре, доля устойчивых изолятов к различным антимикробным препаратам (АМП) среди потенциальных возбудителей группы ESKAPE, структура потребляемых АМП, клинические и экономические эффекты изменения уровня антимикробной резистентности (АМР).

Хромосомные гены ESKAPE-патогенов, мутации в которых индуцируют антибиотикорезистентность

Успех экспансии ESKAPE-патогенов во многом определяется способностью быстро приобретать высокие уровни устойчивости к антимикробным препаратам. Общий бактериальный резистом является функцией (1) генов резистентности, которые могут передаваться …

Системная оценка результатов определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам в медицинских организациях Российской Федерации

Цель. Проанализировать агрегированные данные результатов определения чувствительности ключевых микроорганизмов к АМП, полученных в рамках сбора отчетов за 2022 г. главных специалистов по клинической микробиологии и антимикробной резистентности. Материалы и методы. Исследование включало анализ применяемых в лабораториях критериев интерпретации и оценку представленных заключений по результатам определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Данные были получены в рамках системы годовых отчетов специалистов по клинической микробиологии и антимикробной резистентности. Анализ заключений проводился с использованием рекомендаций EUCAST по фенотипам с ожидаемой устойчивостью и чувствительностью.

AMRexpert – онлайн-платформа для интерпретации, верификации и валидации результатов определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам

Цель. Рассмотреть ключевые принципы работы и функциональные возможности онлайн-платформы AMRexpert. Материалы и методы. Информационный компонент платформы представлен набором правил, созданных на основе комплекса рекомендаций EUCAST, и различными стандартами для интерпретации результатов определения чувствительности (EUCAST, CLSI версии 2020-2022 гг.). Техническая часть платформы разработана с использованием языка программирования C#, фреймворков Angular и Bootstrap. Для практического представления платформы были проанализированы результаты определения чувствительности к антимикробным препаратам для конкретных изолятов Serratia marcescens, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus saprophyticus, Enterococcus faecium с использованием критериев интерпретации EUCAST v.

Колонизация нестерильных сайтов грамотрицательными бактериями с множественной лекарственной устойчивостью и ее роль в развитии инфекций кровотока у реципиентов аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

Цель. Изучить эпидемиологию колонизации грамотрицательными (Гр-) бактериями с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) у пациентов при проведении аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) и оценить ее влияние на развитие инфекций кровотока. Материалы и методы. В ретроспективное исследование включены 288 пациентов, которым была выполнена первая алло-ТГСК в период с 2018 по 2019 г. в НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачевой. Медиана возраста составила 32 (18–66) года, мужчины – 53% (n = 152). Трансплантация была выполнена в 42% (n = 120) от полностью совместимого неродственного донора, в 26% (n = 75) от гаплоидентичного, в 19% (n = 55) от полностью совместимого родственного донора и в 13% (n = 38) от частично совместимого неродственного донора.

Распространенность мутации A2058G в гене 23S рРНК, определяющей устойчивость к макролидным антибиотикам в российской популяции Treponema pallidum

Цель. Исследовать распространенность мутации A2058G в российской популяции T. pallidum и ее связь с молекулярными субтипами. Материалы и методы. Анализировали ДНК, выделенную из 325 образцов клинического материала, полученного от пациентов лечебно-профилактических учреждений дерматовенерологического профиля 6 федеральных округов России в период с 2014 по 2021 гг. У пациентов был диагностирован первичный сифилис половых органов, первичный сифилис других локализаций или вторичный сифилис кожи и слизистых оболочек. ДНК выделяли с использованием набора реагентов «Проба-НК» (ДНК-технология, Россия) согласно инструкции производителя.

Анализ генов, кодирующих белки семейства MБЛ-подобных металлогидролаз, штамма-деструктора компонентов нефти Pseudomonas putida BS3701

Цель. Определить потенциальную возможность штамма Pseudomonas putida BS3701 быть источником генов устойчивости к бета-лактамным антибиотикам. Материалы и методы. Последовательности 7 генов, аннотированных как «MBL-fold metallohydrolase superfamily», были проанализированы с использованием следующих ресурсов: ResFinder 4.1, ClustalW, IQ-TREE, iTOL. Подбор олигонуклеотидов для проведения ПЦР в реальном времени осуществляли с использованием ресурса Primer-BLAST. Уровень экспрессии генов оценивали с использованием ПЦР в реальном времени. Определение МПК и МБК проводили с использованием цефепима и меропенема.

Распространенность и характеристика БЛРС-продуцирующих штаммов Salmonella enterica, циркулирующих на территории России (2016–2020 гг.)

Цель. Проанализировать частоту встречаемости и определить генетические детерминанты резистентности изолятов нетифоидных сальмонелл (НТС), вырабатывающих бета-лактамазы расширенного спектра (БЛРС), выделенных на территории России в период с 2016 по 2020 г. Материалы и методы. Изоляты сальмонелл, подозрительные на продукцию БЛРС, были отобраны в ходе микробиологического мониторинга на базе Всероссийского референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами. Оценку фенотипической резистентности проводили методом серийных разведений на планшетах G-I и G-II Mikrolatest®SensiLaTest MIC и методом «двойных дисков».

Распространение антимикробной устойчивости среди клинических и пищевых изолятов Listeria monocytogenes, выделенных в Москве в 2019–2021 гг.

Цель. Определить актуальную картину распространения приобретенной устойчивости к антимикробным препаратам среди штаммов L. monocytogenes, связанных со случаями листериоза и контаминирующих продукты питания в г. Москве. Материалы и методы. В работе было использовано 39 штаммов L. monocytogenes, выделенных в Москве в 2019–2021 гг. из клинического материала (n = 24) и продуктов питания (n = 15). Была исследована устойчивость к 12 антибиотикам первой и второй линий защиты. Для определения устойчивости использовали диско-диффузионный метод.