Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2025; 27(3):342-358
Изучить генетические детерминанты резистентности и вирулентности штаммов K. pneumoniae, поступивших в референс-центр по предупреждению распространения биологических угроз ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России.
В исследование включены 153 штамма Klebsiella pneumoniae, выделенные из биологического материала беременных женщин и новорожденных детей, находящихся в Перинатальных центрах различных регионов Российской Федерации с инфекционно-воспалительными заболеваниями и поступившие в коллекцию условно-патогенных микроорганизмов референс-центра в 2023 г. Для всех штаммов определяли минимальную подавляющую концентрацию (МПК) к основным антимикробным препаратам (АМП) методом микроразведений в бульоне и получали полногеномные данные с помощью технологии высокопроизводительного секвенирования. Проведен биоинформатический анализ полногеномных данных: сборка геномов, мультилокусное сиквенс-типирование (MLST), типирование штаммов по капсульным и липополисахаридным локусам, поиск генов резистентности и вирулентности. Штаммы, в геноме которых сочетались пять (iucA, rmpA2, rmpA, peg344, terB) и более генов вирулентности, были условно отнесены к гипервирулентным. Гипермукоидный фенотип у гипервирулентных штаммов выявлялся с помощью стринг-теста.
У всех 153 штаммов K. pneumoniae выполнен поиск генов вирулентности. Гены вирулентности, ассоциированные с гипервирулентным фенотипом, не были обнаружены у 30 штаммов (19,6%) K. pneumoniae. У 18 штаммов (11,8%) в геноме сочетались пять и более генов вирулентности, они отнесены к гипервирулентным. У остальных штаммов количество генов вирулентности варьировалось от 1 до 4. Определены сиквенс-типы штаммов с разными комбинациями генов вирулентности. Для гипервирулентных штаммов K. pneumoniae проведено капсульное типирование, определен спектр устойчивости к основным АМП, выявлены гены резистентности к антимикробным препаратам десяти различных групп, у пяти штаммов выявлен гипермукоидный фенотип.
Обнаружение у пациентов Перинатальных центров гипервирулентных штаммов K. pneumoniae с множественной лекарственной устойчивостью, в большинстве своем относящихся к клонам высокого эпидемического риска, свидетельствует о нарастающей биологической угрозе, связанной прежде всего с горизонтальным переносом плазмид с детерминантами резистентности и вирулентности, что обуславливает сложность терапии заболеваний, вызванных такими бактериями.