Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(3):274-284
В 2023–2024 году в Москве был отмечен рост заболеваемости пневмонией, вызванной M. pneumoniae. Для изучения молекулярно-генетических особенностей патогена, наибольшей информативностью обладают полногеномные последовательности. Однако, в настоящее время количество геномных данных M. pneumoniae крайне ограничено. Геномные данные актуальных для Российской Федерации изолятов до настоящего исследования в открытых источниках отсутствовали. Таким образом, целью исследования стало получение культур и полногеномных последовательностей изолятов M. pneumoniae, актуальных для РФ, их полная аннотация и изучение молекулярно-генетических характеристик.
Используя клинический материал от пациентов с подтвержденной микоплазменной инфекцией, были получены культуры M. pneumoniae, для которых было проведено полногеномное секвенирование с последующей сборкой и аннотацией генома патогена.
Мы получили три полные кольцевые последовательности генома M. pneumoniae, содержащие типичный набор генов и факторов вирулентности. Изоляты относились к различным сиквенс-типам ST3 и ST20 и содержали ранее неописанные мутаций в белках цитоадгезии. С использованием всех доступных в открытых источниках геномных данных M. pneumoniae, проведен филогенетический анализ, мультилокусное типирование, а также сравнительный анализ клинически значимых генов.
В этом исследовании мы охарактеризовали первые полногеномные последовательности M. pneumoniae, полученные на территории РФ, а также привели детальные методики культивирования патогена и процесса обработки данных, которые могут быть использованы для дальнейшего расширения объема доступных данных о генетической структуре патогена.