Распространенность мутации A2058G в гене 23S рРНК, определяющей устойчивость к макролидным антибиотикам в российской популяции Treponema pallidum | КМАХ

Распространенность мутации A2058G в гене 23S рРНК, определяющей устойчивость к макролидным антибиотикам в российской популяции Treponema pallidum

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022; 24(4):369-374

​ Образцова О.А., Шпилевая М.В., Катунин Г.Л., Обухов А.П., Шагабиева Ю.З., Соломка В.С.
10.36488/cmac.2022.4.369-374
Treponema pallidum макролиды мутация A2058G
Раздел
Антибиотикорезистентность
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022; 24(4):369-374

Цель.

Исследовать распространенность мутации A2058G в российской популяции T. pallidum и ее связь с молекулярными субтипами.

Материалы и методы.

Анализировали ДНК, выделенную из 325 образцов клинического материала, полученного от пациентов лечебно-профилактических учреждений дерматовенерологического профиля 6 федеральных округов России в период с 2014 по 2021 гг. У пациентов был диагностирован первичный сифилис половых органов, первичный сифилис других локализаций или вторичный сифилис кожи и слизистых оболочек. ДНК выделяли с использованием набора реагентов «Проба-НК» (ДНК-технология, Россия) согласно инструкции производителя. Присутствие генетического материала T. pallidum подтверждали методом ПЦР с праймерами к видоспецифичному гену polA. Молекулярное типирование проводили на основании анализа полиморфных участков видоспецифичных генов T. pallidum. Первичную расшифровку нуклеотидных последовательностей фрагмента гена 23S рРНК осуществляли в программе Sequencing Analysis 5.3.1. Для выравнивания анализируемых фрагментов использовали программу Mega 5.

Результаты.

В интервале 2014–2021 гг. на территории России идентифицированы 8 молекулярных субтипов T. pallidum – 14d/f, 14d/g, 14b/f, 14c/f, 14i/f, 9d/f, 14b/g и 14e/f с устойчивым доминированием субтипа 14d/f. Выделены три субтипа – 14d/g, 14b/g и 14b/f, несущие ассоциированную с резистентностью к азитромицину мутацию A2058G.

Выводы.

Исследования по молекулярному типированию штаммов T. pallidum на территории России показали значительную гетерогенность популяции. Показано существование трех сублиний, содержащих мутацию A2058G, одна из которых – 14b/f описывается как редкая. Полученные данные подтверждают актуальность непрерывного мониторинга появления резистентных штаммов и развития новых мутаций.

Образцова О.А.

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

Марина Валентиновна Шпилевая

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

Катунин Г.Л.

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

Обухов А.П.

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

Шагабиева Ю.З.

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

Соломка В.С.

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России, Москва, Россия

  • 1. World Health Organization. The global health observatory. Data on syphilis. Available at: www.who.int/data/gho/data/themes/topics/topic-details/GHO/data-on-syphilis. Accessed July 21, 2021.
  • 2. World Health Organization. New study highlights unacceptably high global prevalence of syphilis among men who have sex with men. Available at: www.who.int/news/item/09-07-2021-new-study-highlightsunacceptably-high-global-prevalence-of-syphilis-amongmen-who-have-sex-with-men. Accessed July 9, 2021.
  • 3. Kubanov A.A., Bogdanova E.V. Dermatovenereology of Russian Federation in 2020: working under pandemic. Vestnik dermatologii i venerologii. 2021;97(4):8-32. Russian. (Кубанов А.А., Богданова Е.В. Итоги деятельности медицинских организаций, оказывающих медицинскую помощь по профилю дерматовенерология, в 2020 году: работа в условиях пандемии. Вестник дерматологии и венерологии. 2021;97(4):8-32.) DOI: 10.25208/vdv1261
  • 4. Kotova E.G., Kobyakova O.S., Kubanov A.A., Starodubov V.I., Aleksandrova G.A., Bogdanova E.V., et al. Resources and activities of medical organizations of the dermatovenerological profile. The incidence of sexually transmitted infections, contagious skin diseases and skin diseases in 2021: statistical materials. M.: Russian Research Institute of Health of the Ministry of Health of Russia, 2022; 209 p. Russian. (Котова Е.Г., Кобякова О.С., Кубанов А.А., Стародубов В.И., Александрова Г.А., Богданова Е.В. и соавт. Ресурсы и деятельность медицинских организаций дерматовенерологического профиля. Заболеваемость инфекциями, передаваемыми половым путем, заразными кожными болезнями и болезнями кожи в 2021 году: статистические материалы. М.: ЦНИИОИЗ Минздрава России, 2022; 209 с.)
  • 5. Centers for Disease Control and Prevention. Brief report: azithromycin treatment failures in syphilis infections – San Francisco, California, 2002-2003. MMWR Morb Wkly Rep. 2004;53:197-198. PMID: 15017376.
  • 6. Mitchell S.J., Engelman J., Kent C.K., Lukehart S.A., Godornes C., Klausner J.D. Azithromycin resistant syphilis infection: San Francisco, California, 2000-2004. Clin Infect Dis. 2006;42(3):337-345. DOI: 10.1086/498899
  • 7. Morshed M.G., Jones H.D. Treponema pallidum macrolide resistance in BC. CMAJ. 2006;174(3):349. DOI: 10.1503/cmaj.1050256
  • 8. Martin I.E., Gu W., Yang Y., Tsang R.S. Macrolide resistance and molecular types of Treponema pallidum causing primary syphilis in Shanghai, China. Clin Infect Dis. 2009;49:515-521. DOI: 10.1086/600878
  • 9. Grimes M., Sahi S.K., Godornes B.C., Tantalo L.C., Roberts N., Bostick D., et al. Two mutations associated with macrolide resistance in Treponema pallidum: increasing prevalence and correlation with molecular strain type in Seattle, Washington. Sex Transm Dis. 2012;39:954-958. DOI: 10.1097/OLQ.0b013e31826ae7a8
  • 10. Grillová L., Pĕtrošová H., Mikalová L., Strnadel R., Dastychová E., Kuklová I., et al. Molecular typing of Treponema pallidum in the Czech Republic during 2011 to 2013: increased prevalence of identified genotypes and of isolates with macrolide resistance. J Clin Microbiol. 2014;52:3693-3700. DOI: 10.1128/JCM.01292-14
  • 11. Pillay A., Liu H., Chen C.Y., Holloway B., Sturm A.W., Steiner B., et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum subspecies pallidum. Sex Transm Dis. 1998;25(8):408414. DOI: 10.1097/00007435-199809000-00004
  • 12. Marra C.M., Sahi S.K., Tantalo L.C., Godornes C., Reid T., Behets F., et al. Enhanced molecular typing of Treponema pallidum: geographical distribution of strain types and association with neurosyphilis. J Infect Dis. 2010;202:1380-1388. DOI: 10.1086/656533
  • 13. Stamm L.V. Global challenge of antibiotic-resistant Treponema pallidum. Antimicrob Agents Chemother. 2010;54(2):583-589. DOI: 10.1128/AAC.01095-09
  • 14. Matějková P., Strouhal M., Smajs D., Norris S.J., Palzkill T., Petrosino J.F., et al. Complete genome sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14 determined with oligonucleotide arrays. BMC Microbiol. 2008;8:76. DOI: 10.1186/1471-2180-8-76
  • 15. Arora N., Schuenemann V.J., Jäger G., Peltzer A., Seitz A., Herbig A., et al. Origin of modern syphilis and emergence of a pandemic Treponema pallidum cluster. Nat Microbiol. 2017;2:16245. DOI: 10.1038/nmicrobiol.2016.245
  • 16. Nechvátal L., Pětrošová H., Grillová L., Pospíšilová P., Mikalová L., Strnadel R., et al. Syphilis-causing strains belong to separate SS14-like or Nichols-like groups as defined by multilocus analysis of 19 Treponema pallidum strains. Int J Med Microbiol. 2014;304:645-653. DOI: 10.1016/j.ijmm.2014.04.007
  • 17. Obraztsova O.A., Aleynikova K.A., Obukhov A.P., Kubanov A.A., Deryabin D.G. Genetic antimicrobial resistance determinants and their prevalence in molecular subtypes of Treponema pallidum subsp. pallidum. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2018;20(3):217-221. Russian. (Образцова О.А., Алейникова К.А., Обухов А.П., Кубанов А.А., Дерябин Д.Г. Генетические детерминанты резистентности к антимикробным препаратам и их распространенность у различных молекулярных субтипов Treponema pallidum subsp. pallidum. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2018;20(3):217-221.) DOI: 10.36488/cmac.2018.3.216-221
  • 18. Khairullin R., Vorobyev D., Obukhov A., Kuular U-H., Kubanova A., Kubanov A., et al. Syphilis epidemiology in 1994-2013, molecular epidemiological strain typing and determination of macrolide resistance in Treponema pallidum in 2013-2014 in Tuva Republic, Russia. APMIS. 2016;124:595-602. DOI: 10.1111/apm.12541
  • 19. Liu H., Rodes B., Chen C.Y., Steiner B. New tests for syphilis: rational design of a PCR method for detection of Treponema pallidum in clinical specimens using unique regions of the DNA polymerase I gene. J Clin Microbiol. 2001;39(5):1941-1946. DOI: 10.1128/JCM.39.5.1941-1946.2001
  • 20. Kubanov A.A., Vorob’ev D.V., Obraztsova O.A., Deryabin D.G., Obukhov A.P. Molecular epidemiology of Treponema pallidum in a frontier region of the Russian Federation (Tuva Republic). Molecular genetics, microbiology and virology. 2017;32(1):29-34. Russian. (Кубанов А.А., Воробьев Д.В., Обухов А.П., Образцова О.А., Дерябин Д.Г. Молекулярная эпидемиология Treponema pallidum в приграничном регионе Российской Федерации (республика Тыва). Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2017;1:26-30.) DOI: 10.18821/0208-0613-2017-35-1-26-30
  • 21. Solomka V.S., Komyagina T.M., Chestkov A.V., Obukhov A.P., Deryabin D.G. Molecular typing of T. pallidum clinical isolates and their resistance to macrolides in the Russian Federation during 2018-2019. Vestnik dermatologii i venerologii. 2019;95(6):29-36. Russian. (Соломка В.С., Комягина Т.М., Честков А.В., Обухов А.П., Дерябин Д.Г. Молекулярное типирование и устойчивость к макролидным антибиотикам у российских клинических изолятов Treponema pallidum: данные 2018-2019 гг. Вестник дерматологии и венерологии. 2019;95(6):29-36.) DOI: 10.25208/0042-4609-201995-6-29-36
  • 22. Read P., Tagg K.A., Jeoffreys N., Guy R.J., Gilbert G.L., Donovan B. Treponema pallidum strain types and association with macrolide resistance in Sydney, Australia: new tp0548 gene types identified. J Clin Microbiol. 2016;54(8):2172-2174. DOI: 10.1128/JCM.00959-16
  • 23. Zondag H.C., Cornelissen A.R., van Dam A.P., Bruisten S.M. Molecular diversity of Treponema pallidum subspecies pallidum isolates in Amsterdam, the Netherlands. Sex Transm Infect. 2020;96:223-226. DOI: 10.1136/sextrans-2019-054044
  • 24. Venter J.M.E., Müller E.E., Mahlangu M.P., Kularatne R.S. Treponema pallidum macrolide resistance and molecular epidemiology in Southern Africa, 2008 to 2018. J Clin Microbiol. 2021;59(10):0238520. DOI: 10.1128/JCM.02385-20
  • 25. Tipple C., McClure M.O., Taylor G.P. High prevalence of macrolide resistant Treponema pallidum strains in a London centre. Sex Transm Infect. 2011;87:486-488. DOI: 10.1136/sextrans-2011-050082
  • 26. Matejková P., Flasarová M., Zákoucká H., Bořek M, Křemenová S, Arenberger P., et al. Macrolide treatment failure in a case of secondary syphilis: a novel A2059G mutation in the 23S rRNA gene of Treponema pallidum subsp. pallidum. J Med Microbiol. 2009;58(6):832-836. DOI: 10.1099/jmm.0.007542-0
  • 27. Kirsten S.R., Susan C., Jan G., Helle K., Steen H., Troels B.K., et al. Molecular typing of Treponema pallidum in Denmark: a nationwide study of syphilis. Acta Derm Venereol. 2016;96:202-206. DOI: 10.2340/000155552190
  • 28. Sanjiv K., Melissa J.C., Arvind A., Abhishek D., Kelly L.H., Morgan E.D., et al. Sequence variation of rare outer membrane protein β-barrel domains in clinical strains provides insights into the evolution of Treponema pallidum subsp. pallidum, the syphilis spirochete. mBio. 2018;9(3):01006-18. DOI: 10.1128/mBio.01006-18
  • 29. Koizumi Y., Watabe,Т., Ota Y., Nakayama S., Asai N., Hagihara M., et al. Cerebral syphilitic gumma can arise within months of reinfection: a case of histologically proven Treponema pallidum strain type 14b/f infection with human immunodeficiency virus positivity. Sex Transm Dis. 2018;45(2):1-4. DOI: 10.1097/OLQ.0000000000000701
  • 30. Nishiki S., Arima Y., Kanai M., Shimuta K., Nakayama S., Ohnishi M. Epidemiology, molecular strain types, and macrolide resistance of Treponema pallidum in Japan, 2017-2018. J Infect Chemother. 2020;26(10):10421047. DOI: 10.1016/j.jiac.2020.05.022
  • 31. Xiao Y., Liu S., Liu Z., Xie Y., Jiang C., Xu M., et al. Molecular subtyping and surveillance of resistance genes in Treponema pallidum DNA from patients with secondary and latent syphilis in Hunan, China. Sex Transm Dis. 2016;43(5):310-316. DOI: 10.1097/OLQ.0000000000000445
  • 32. Krasnoselskikh T.V., Sokolovskiy E.V. Current standards for diagnosis of syphilis: comparing the Russian and foreign guidelines (part I). Vestnik dermatologii i venerologii. 2015;91(2):11-22. Russian. (Красносельских Т.В., Соколовский Е.В. Современные стандарты терапии сифилиса: сравнение российских и зарубежных клинических рекомендаций (сообщение II). Вестник дерматологии и венерологии. 2015;2:23-40.) DOI: 10.25208/0042-4609-2015-91-2-11-22
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились