Практическое применение AMRmap: элементы подхода «от общего к частному» на примере Klebsiella pneumoniae

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(2):181-186

​ Виноградова А.Г., Кузьменков А.Ю.
10.36488/cmac.2019.2.181-186
антибиотикорезистентность мониторинг Enterobacterales Klebsiella pneumoniae статистический анализ метод in silico
Раздел
Опыт работы
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(2):181-186

Аннотация

В обзоре подробно рассматриваются варианты использования вкладки «По группам» онлайн-платформы AMRmap. Описание некоторых функциональных возможностей сопровождается разбором примеров, в качестве объекта исследования выбрана Klebsiella pneumoniae. Элементы анализа дополнены пояснениями.

Виноградова Алина Геннадьевна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Кузьменков Алексей Юрьевич

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

  • 1. Thabit A., Crandon J., Nicolau D. Antimicrobial resistance: impact on clinical and economic outcomes and the need for new antimicrobials. Expert Opin Pharmacother. 2015;16(2):159-177. DOI: 10.1517/14656566.2015.99338
  • 2. WHO. Global antimicrobial resistance surveillance system (GLASS) report: early implementation 2017-2018. Geneva: World Health Organization; 2018. 268 p.
  • 3. Perez F, Villegas M.V. The role of surveillance systems in confronting the global crisis of antibiotic-resistant bacteria. Curr Opin Infect Dis. 2015;28(4):375-383. DOI: 10.1097/QCO.0000000000000182
  • 4. Karp B., Tate H., Plumblee J., et al. National antimicrobial resistance monitoring system: two decades of advancing public health through integrated surveillance of antimicrobial resistance. Foodborne Pathog Dis. 2017;14(10):545-557. DOI: 10.1089/fpd.2017.2283
  • 5. CDDEP. ResistanceMap. Antibiotic Resistance. Available at: https://resistancemap.cddep.org/AntibioticResistance.php. Accessed March 22, 2019.
  • 6. National Nosocomial Infections Surveillance System. National Nosocomial Infections Surveillance (NNIS) System Report, data summary from January 1992 through June 2004, issued October 2004. Am J Infect Control. 2004;32(8):470-485. DOI: 10.1016/S0196655304005425.
  • 7. Public Health England. Second Generation Surveillance System (SGSS). Available at: https://sgss.phe.org.uk/. Accessed March 23, 2019.
  • 8. Pfizer. ATLAS: Antimicrobial Testing Leadership and Surveillance. Available at: https://atlas-surveillance.com. Accessed March 22, 2019.
  • 9. MSD. SMART: Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends. Available at: http://www.globalsmartsite.com/. Accessed March 23, 2019.
  • 10. ECDC. European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net). Available at: http://ecdc.europa.eu/en/healthtopics/antimicrobial-resistance-and-consumption/antimicrobial_resistance/EARS-Net/Pages/EARS-Net.aspx. Accessed March 20, 2019.
  • 11. Kuzmenkov A.Yu, Trushin I.V, Avramenko A.A., et al. AMRmap: an online platform for monitoring antibiotic resistance. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2017;19(2):84-90. Russian. (Кузьменков А.Ю., Трушин И.В., Авраменко А.А. и соавт. AMRmap: Интернет-платформа мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(2):84-90.).
  • 12. Navon-Venezia S., Kondratyeva K., Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: a major worldwide source and shuttle for antibiotic resistance. FEMS Microbiol Rev. 2017;41(3):252-275. DOI: 10.1093/femsre/fux013
  • 13. Hazra A. Using the confidence interval confidently. J Thorac Dis. 2017;9 (10):4125-4130. DOI: 10.21037/jtd.2017.09.14
  • 14. Glantz S. Primer of Biostatistics, 4th ed. New York: McGraw-Hill Education; 1997. 473 p.
  • 15. Holm S. A simple sequentially rejective multiple test procedure. Scandinavian Journal of Statistics. 1979;6(2):65-70.
  • 16. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). New definitions of S, I and R. Available at: www.eucast.org/newsiandr/. Accessed May 2019.
  • 17. Luke D. A User’s guide to network analysis in R, 1st ed. New York: Springer-Verlag; 2015. 238 p. DOI: 10.1007/978-3-319-23883-8
  • 18. Fruchterman T., Reingold E. Graph drawing by force-directed placement. Soft Pract Exp. 1991;21(11):1129-1164.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились