Основные правила

Перечень документов, направляемых для рассмотрения в редакцию журнала «Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия», должен включать:

  • Сопроводительное письмо
  • Рукопись

Сопроводительное письмо

Сопроводительное письмо следует отправить отдельным файлом. В сопроводительном письме необходимо указать следующую информацию:

  • Рукопись не была ранее опубликована
  • Рукопись не находится на рассмотрении в другом журнале
  • Все авторы ознакомлены и согласны с окончательным вариантом рукописи
  • Авторы несут ответственность за достоверность всех данных, представленных в рукописи
Сопроводительное письмо должно быть заверено руководителем учреждения или заместителем руководителя по научной работе.

Рукопись

1. Шаблоны

  • Шаблон для «Обзорной статьи» в формате .docx вы можете скачать здесь.
  • Шаблон для «Оригинальной статьи» в формате .docx вы можете скачать здесь.

2. Стандарты

При подготовке рукописи авторам следует руководствоваться минимальными принципами отчетности EQUATOR в отношении исследований в области здравоохранения. Титульная страница должна включать:

  • название статьи (на русском и английском языках);
  • фамилию автора(-ов) и инициалы (на русском и английском языках);
  • полные названия учреждений и их адрес с указанием города, страны, почтового индекса (на русском и английском языках).
При отсутствии официального названия учреждения на английском языке, допускается транслитерированный вариант. Если авторы статьи работают в разных учреждениях, надстрочными арабскими цифрами отмечают соответствие учреждений.

Для каждого автора следует указать:

  • идентификатор ORCID (при отсутствии идентификатора ORCID автору рекомендуется зарегистрироваться на сайте orcid.org);
  • контактную информацию автора, ответственного за переписку: фамилию и инициалы, адрес, номер телефона, адрес электронной почты (на русском и английском языках).
Статья должна быть подписана всеми авторами.

На отдельной странице следует указать следующую дополнительную информацию: фамилию, имя и отчество каждого автора (на русском языке и в транслитерации), адрес электронной почты, адрес учреждения

3. Оформление текста

Для оформления рукописи необходимо использовать шрифт Times New Roman или Arial; 12 пунктов; междустрочный интервал – 1.5; интервал после параграфа – 6 пт; по верхнему краю, справа и по нижнему краю - поля по 2 см, по левому краю – 3 см. Все страницы должны быть пронумерованы по центру внизу. Автоматический перенос текста запрещен.

Жирным шрифтом могут выделяться только заголовки/подзаголовки. Курсив может использоваться для заголовков/подзаголовков и является обязательным для названий микроорганизмов (например, Escherichia coli). Сокращенное название микроорганизма должно быть напечатано следующим образом: E. coli. Семейство, порядок и класс микроорганизмов должны быть напечатаны обычным шрифтом (не курсивом).

Статья должна иметь аннотацию как на русском, так и на английском языках. В конце аннотации должно быть от 3 до 5 ключевых слов (относящихся к теме статьи). Аннотация должна быть структурирована. Если статья содержит собственные результаты, то аннотация должна включать следующие разделы: (1) Цель, (2) Материалы и методы, (3) Результаты, (4) Выводы. Если статья представляет собой обзор литературы, клинический случай, аннотация может быть написана произвольно. Рекомендуемый объем аннотации не должен превышать 350 слов.

4. Оформление таблиц

Таблица должна иметь краткое и содержательное название. Сокращения, приведенные в таблице, следует расшифровывать в примечании к таблице, даже если они уже были описаны в тексте статьи. Таблицы размещаются в тексте после пункта, в котором на них делается ссылка. Цифры и проценты должны быть тщательно проверены автором и соответствовать данным из текста.

5. Оформление рисунков, графиков

Все иллюстрации должны быть достаточного качества (не менее 300 dpi, не менее 1500 на 1500 пикселей). Подписи к рисункам оформляются в конце рукописи. Для каждого изображения необходимо указывать заголовок, расшифровку сокращений и пояснения для всех элементов. Подписи к микрофотографиям должны включать название метода окраски и увеличение.

Изображения прикрепляются отдельными файлами в формате: tiff, jpeg или png. Иллюстрации, созданные или обработанные в Microsoft Office (Word, PowerPoint), отсылаются файлом соответствующего формата (DOC, DOCX, PPT, PPTX). Каждый файл должен быть назван по номеру рисунка (Рисунок_1, Рисунок_2a и т.д.). Для отправки все файлы рисунков могут быть объединены в один архив (формат ZIP или RAR).

6. Дополнительная информация

Конфликт интересов

Все авторы должны раскрывать конфликты интересов, которые могут оказывать неправомерное влияние (предвзятость) на их работы. Если не существует противоречий, которые следует признать, авторы должны заявить об этом. Вариант оформления представлен в шаблоне для «Оригинальной статьи» / «Обзорной статьи» см. выше.

Внешнее финансирование

При оказании финансовой поддержки при проведении и/или написании статьи авторам следует указать источники финансирования. Вариант оформления представлен в шаблоне для «Оригинальной статьи» / «Обзорной статьи» см. выше.

В случае отсутствия источников финансирования этот раздел не должен включаться в обзорную статью.

Соответствие принципам этики

(только для «Оригинальных статей», включающих информацию о манипуляциях с пациентами и/или животными). Вариант оформления представлен в шаблоне для «Оригинальной статьи» см. выше

Научно-исследовательские проекты с участием людей должны соответствовать этическим нормам Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации в редакции 2013 года «Этические принципы проведения медицинских исследований с участием человека в качестве субъекта» и «Правилам клинической практики в Российской Федерации», утвержденным приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 01.04.2016 года № 200н. Все исследования на животных должны проводиться в соответствии с директивами Европейского сообщества 2010/63/ЕС и директивами ARRIVE.

Авторы должны пояснить, было ли получено одобрение протокола исследования этическим комитетом с указанием названия организации, местонахождения организации, регистрационного номера и даты заседания комитета.

Выражение признательности

В данном разделе следует выразить признательность всем научным сотрудникам или другим лицам с их согласия, которые оказывали помощь в ходе исследования/внесли значительный вклад в улучшение работы, но не были включены в число авторов.

7. Оформление списка литературы

Ссылки должны быть пронумерованы последовательно в том порядке, в котором они впервые цитируются в тексте, а НЕ в алфавитном порядке.

Ссылки должны быть пронумерованы арабскими цифрами [в квадратных скобках]. Примеры [1], [5-8].

Перечислите ВСЕХ авторов или редакторов в списке литературы. Если их больше ШЕСТИ, перечислите первые шесть и соавт. Инициалы следует располагать после фамилии и разделять точками.

Названия журналов должны быть сокращены в соответствии с Перечнем каталогов NLM (Национальной медицинской библиотеки США). Если журнал не проиндексирован в каталоге, необходимо использовать его полное название.

Названия русскоязычных журналов не сокращаются.

Транслитерация источников не на латинице (в том числе русскоязычных) должно проводиться с использованием официальных кодировок в следующем порядке: авторы транслитерируются с использованием кодировок, название журнала транслитерируется или должно иметь прямой английский перевод (при наличии), название статьи должно иметь прямой английский перевод.

Для литературного источника необходимо указать DOI (при его наличии). Для того чтобы определить DOI для статей, рекомендуется использовать сайт crossref.org.

ВНИМАНИЕ! Ссылки на авторефераты диссертаций или диссертации не принимаются.

За дополнительной информацией по оформлению списка литературы вы можете обратиться к рекомендациям Национальной медицинской библиотеки США.

Примеры оформления ссылок в списках литературы

Журнальная статья

  1. Журнальная ссылка (английский язык)
    • Nordmann P., Poirel L. The difficult-to-control spread of carbapenemaseproducing among Enterobacteriaceae worldwide. Clin Microbiol Infect. 2014;20(9):821-830. DOI: 10.1111/1469-0691.12719
    • Bevan E.R., Jones A.M., Hawkey P.M. Global epidemiology of CTX-M β-lactamases: temporal and geographical shifts in genotype. J Antimicrob Chemother. 2017;72(8):2145-2155. DOI: 10.1093/jac/dkx146
  2. Журнальная ссылка не на латинице (в том числе на русском языке)
    • Kuzmenkov A.Yu, Trushin I.V, Avramenko A.A., Edelstein M.V., Dekhnich A.V., Kozlov R.S. AMRmap: an online platform for monitoring antibiotic resistance. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2017;19(2):84-90. Russian. (Кузьменков А.Ю., Трушин И.В., Авраменко А.А., Эйдельштейн М.В., Дехнич А.В., Козлов Р.С. AMRmap: Интернет-платформа мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(2):84-90.)
    • Vasilieva V.A. Parovichnikova E.N., Drokov M.Yu., Kuzmina L.A., Klyasova G.A., Tikhomirov D.S., et al. Aetiology of hemorrhagic cystitis after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2018;20(3):232 238. Russian. (Васильева В.А., Паровичникова Е.Н., Дроков М.Ю., Кузьмина Л.А., Клясова Г.А., Тихомиров Д.С., и соавт. Этиологические особенности геморрагического цистита после трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2018;20(3):232-238.)
  3. Авторами статьи являются отдельные авторы и группа авторов
    • Reshedko G.K., Ryabkova E.L., Farashchuk A.N., Stratchounski L.S., and ROSNET study group. Non-Fermenting Gram Negative Nosocomial Pathogens in Russian ICUs: Antimicrobial Resistance Problems. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2006;8:243-259. Russian. (Решедько Г.К., Рябкова Е.Л., Фаращук А.Н., Страчунский Л.С, исследовательская группа РОСНЕТ. Неферментирующие грамотрицательные возбудители нозокомиальных инфекций в ОРИТ России: проблемы антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2006;8:243-259.)
    • Hidron A. I., Edwards J. R., Patel J., National Healthcare Safety Network Team. The National Healthcare Safety Network Team and Participating National Healthcare Safety Network Facilities. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: annual summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2006-2007. Infect Control Hosp Epidemiol. 2008;29:996-1011.
  4. Статья в приложении к тому журнала
    • Bassetti M., Peghin M., Timsit J. The current treatment landscape: candidiasis. J Antimicrob Chemother. 2016;71(Suppl. 2):ii13-ii22. DOI: 10.1093/jac/dkw392
    • Lessa F., Gould C., McDonald L. Current Status of Clostridium difficile Infection Epidemiology. Clin Infect Dis. 2012;55(Suppl 2):S65-S70. DOI: 10.1093/cid/cis319

Книги и монографии

  1. Один или несколько авторов (английский язык)
    • Murray P., Rosenthal K., Pfaller M. Medical microbiology. 7th ed. Elsevier Science; 2013. 888 p.
  2. Один или несколько издателей (английский язык)
    • Calderone R., Clancy C., eds. Candida and candidiasis, 2nd ed. Washington: ASM Press; 2012. 309 p. DOI: 10.1128/9781555817176
  3. Книги не на латинице (в том числе на русском языке)
    • Synopalnikov A.I., Kozlov R.S. Community-acquired respiratory tract infections. Guidelines for practitioners — M.: Prem’er MT, Nash Gorod 2007. 352 p. Russian. (Синопальников А.И., Козлов Р.С. Внебольничные инфекции дыхательных путей. Руководство для врачей — М.: Премьер МТ, Наш Город 2007. 352 с.)
    • Otten T.F., Vasil’ev A.V. Mycobacteriosis. SPb: Medicinskaja pressa; 2005. 224 p. Russian. (Оттен Т.Ф., Васильев А.В. Микобактериоз. СПб: Медицинская пресса; 2005. 224 c.)
  4. Глава в книге
    • Kuczynski J., Stombaugh J., Walters W.A., Gonzalez A., Caporaso J.G., Knight R. Using QIIME to analyze 16S rRNA gene sequences from microbial communities. In: Current protocols in bioinformatics; 2011. Chapter 10:Unit 10.7. DOI: 10.1002/0471250953.bi1007s36

Другие материалы

  1. Тезисы конференции
    • Stratchounski L.S., Kozlov R.S., Sivaya O.V., Poupard J.A. Antimicrobial Resistance in Russia among Streptococcus Pneumoniae (SP) Causing Community-Acquired Respiratory Tract Infections (CARTI): PEHASus-I Surveillance Program, 2001-2002. Proceedings of the 41st Infectious Diseases Society of America Meeting. San Diego, USA; 9-12 October 2003. P. 65.
  2. Электронные материалы
    • R Core Team. R: a language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. 2016. Available at: www.R-project.org/. Accessed July 2019.
    • Clinical recommendations. Susceptibility testing of microorganisms to antimicrobial agents, 2018. Available at: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2018.pdf. Accessed June 01, 2019. Russian. (Клинические рекомендации. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам, 2015. Доступно по адресу: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2018.pdf. Ссылка активна на 01 июня 2019 г.)

8. Форматы файлов

  • Рукопись оформляется в форматах: .doc или .docx
  • Все иллюстрации прикрепляются отдельно или в виде архива .zip или .rar
  • Сопроводительное письмо после сканирования прикладывается в виде .pdf или .jpeg файла