сиквенс-типы

Цель. Изучить генетическое разнообразие российской популяции Chlamydia trachomatis. Материалы и методы. Проанализировано 42 клинических изолята C. trachomatis, полученных в 2024 г. Проведено MLST-типирование по схеме Uppsala (гены CT058, CT144, CT172, hctB, pbpB) и секвенирование гена ompA для определения серотипов. Результаты. Выявлено 8 серотипов (доминирует E – 50,0%) и 26 сиквенс-типов (ST), включая 8 новых (19,0% изолятов). Преобладающий ST56 (33,3%) отличается от глобальных тенденций (ST3). Обнаружен редкий серотип B (трахома) в урогенитальных образцах, что может свидетельствовать о рекомбинации между биоварами.

Цель. Определить виды и сиквенс-типы изолятов Achromobacter spp., выделенных от пациентов с муковисцидозом (МВ) в России, а также выявить среди этих изолятов носительство и интегронную организацию генов вирулентности и адаптивной резистентности. Материалы и методы. В качестве объекта исследования использовали штаммы рода Achromobacter, выделенные из мокроты и верхних дыхательных путей 168 пациентов с МВ. Все изоляты были подвергнуты полногеномному секвенированию на платформе MGISEQ-2000, MGI с последующей биоинформатической обработкой при помощи стандартных программ.