Молекулярно-биологические особенности штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации

Цель.

Изучить молекулярно-биологические особенности штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации.

Материалы и методы.

В исследование включены 205 штаммов S. agalactiae, выделенные у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации за период 2022–2023 гг. Штаммы были выделены из ректовагинальных мазков беременных женщин при скрининге на 35–37 неделях гестации и из вагинального отделяемого рожениц. Для каждого штамма получены полногеномные данные с помощью технологии высокопроизводительного секвенирования. Проведен биоинформатический анализ полученных результатов: сборка геномов, мультилокусное сиквенс-типирование (MLST), серотипирование штаммов по полногеномным данным, поиск генов устойчивости к антимикробным препаратам, поиск плазмид и анализ плазмидного профиля, поиск и анализ мобильных генетических элементов.

Результаты.

Получены полные геномы 205 штаммов S. agalactiae, выделенных у беременных женщин и рожениц различных регионов Российской Федерации, и проведен их биоинформатический анализ. В ходе серотипирования выявлено 7 различных серотипов: Ia, Ib, II, III, IV, V, VI. Чаще всего выявлялись серотипы V (30,7%), III (28,3%), Ia (15,6%), реже встречались серотипы II (9,8%), Ib (7,8%), IV (5,9%) и VI (1,9%). Выявлено 28 различных сиквенс-типов, чаще встречались следующие сиквенс-типы: ST17 (14,6%), ST1 (12,7%), ST890 (11,2%), ST23 (7,3%), ST28 (5,9%), ST88 (5,4%), составляя в совокупности более 55% всех изученных штаммов. В основном выявлялись штаммы с сиквенс-типами, принадлежащими к пяти клональным комплексам: СС19 (18,5%), СС1 (17,1%), СС23 (16,1%), СС17 (15,1%) и СС452 (14,1%). У 51 штамма обнаружено два разных гена резистентности к аминогликозидам – ant(6)-Ia, aph(3’)-III; у 119 штаммов – пять генов резистентности к макролидам и/или линкозамидам – ermA, ermB, msrD, lsaC, mefA; у 188 штаммов – два гена резистентности к тетрациклину – tetM и tetO и у 13 штаммов – два гена резистентности к хлорамфениколу – cat, catQ, гены резистентности к ванкомицину не обнаружены. В результате анализа плазмидного профиля у штаммов S. agalactiae была выявлена одна плазмида – repUS43, частота встречаемости которой составила 38,0%. С разной частотой обнаружено 27 разных типов мобильных генетических элементов.

Выводы.

Штаммы S. agalactiae, выделенные у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации, имеют различные серотипы и сиквенс-типы, встречающиеся с разной частотой, а также обладают набором генов резистентности к антимикробным препаратам и мобильных генетических элементов.