высокопроизводительное секвенирование | КМАХ

высокопроизводительное секвенирование

Молекулярно-биологические особенности штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации

Цель. Изучить молекулярно-биологические особенности штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации. Материалы и методы. В исследование включены 205 штаммов S. agalactiae, выделенные у беременных женщин и рожениц в различных регионах Российской Федерации за период 2022–2023 гг. Штаммы были выделены из ректовагинальных мазков беременных женщин при скрининге на 35–37 неделях гестации и из вагинального отделяемого рожениц. Для каждого штамма получены полногеномные данные с помощью технологии высокопроизводительного секвенирования.

Определение серотипов Streptococcus pneumoniae, вызывающих инвазивные и неинвазивные формы инфекций, с использованием высокопроизводительного секвенирования

Цель. Антигенная характеристика полисахарида капсулы штаммов Streptococcus pneumoniae, полученных от больных инвазивными и неинвазивными формами пневмококковой инфекции, циркулирующих на территории России, с использованием высокопроизводительного секвенирования. Материалы и методы. В исследование включено 144 инвазивных и 90 неинвазивных штаммов S. pneumoniae, изолированных в 2002–2023 гг. при проведении Многоцентрового исследования «ПеГАС». Для определения серотипов использовали ПЦР в режиме реального времени и высокопроизводительное секвенирование. ПЦР проводили с использованием методики для определения 16 серотипов. Полногеномное секвенирование осуществлялось на платформе «Illumina».