Микробиологическое исследование при коклюше и влияние состава питательной среды на белковое профилирование Bordetella spp. | КМАХ

Микробиологическое исследование при коклюше и влияние состава питательной среды на белковое профилирование Bordetella spp.

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):514-521

​ Видманова М.В., Жестков А.В., Лямин А.В., Исматуллин Д.Д., Шеститко Е.Ю., Решетникова В.П.
10.36488/cmac.2024.4.514-521
коклюш Bordetella профилирование белков идентификация масс-спектрометрия
Раздел
Опыт работы
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):514-521

Цель.

Провести сравнительный анализ данных по белковому профилированию Bordetella spp., подготовленных на различных питательных средах.

Материалы и методы.

В рамках проспективного открытого одноцентрового исследования изучены белковые профили культур B. pertussis, B. parapertussis, B. bronchiseptica, полученных на питательных средах с рецептурными комбинациями. В качестве основы питательной среды были использованы казеиново-угольный агар, агар Борде-Жангу, угольный агар Реган-Лоу. В качестве кровяного компонента использовались дефибринированная лошадиная, баранья, человеческая донорская кровь и человеческая донорская эритроцитарная масса. В качестве антимикробного препарата (АМП) были использованы бензилпенициллин, бензатина бензилпенициллин, цефалексин и рецептура без добавления антибиотиков. Всего протестировано 48 рецептурных комбинаций. Идентификация протеомных профилей Bordetella spp. проводилась на MALDI-TOF масс-спектрометре в режиме Standard по показателю Score.

Результаты.

Значения показателя Score подвергались сравнительному анализу в зависимости от используемой основы, крови, АМП и от комбинаций отдельных компонентов. Наиболее достоверная идентификация Bordetella spp. по показателю Score отмечалась при использовании основы агара Борде-Жангу (статистически значимые различия, p = 0,035, критерий Краскела-Уоллиса). Влияние других компонентов на профилирование Bordetella spp. было статистически незначимым.

Выводы.

Использование основы агара Борде-Жангу является оптимальным для проведения масс-спектрометрической идентификации Bordetella spp.

Мария Владимировна Видманова

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Жестков А.В.

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Лямин Артем Викторович

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Исматуллин Д.Д.

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Шеститко Е.Ю.

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Решетникова В.П.

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

  • 1. Popova O.P., Skirda T.A., Fyodorova I.M., Petrova M.S., Borisova O.Yu., Kombarova S.Yu., et al. The diagnostic value of ELISA method for pertussis in children. Children infections. 2016;15(2):36-40. Russian. (Попова О.П., Скирда Т.А., Федорова И.М., Петрова М.С., Борисова О.Ю., Комбарова С.Ю. и соавт. Диагностическая ценность метода ИФА при коклюше у детей. Детские инфекции. 2016;15(2):36-40.) DOI: 10.22627/2072-8107-2016-15-2-36-40
  • 2. Babachenko I.V., Harit S.M., Kurova N.N., Tseneva G.Y. Pertussis in children. Moscow: Kommentarij, 2014. 176 с. Russian. (Бабаченко И.В., Харит С.М., Курова Н.Н., Ценева Г.Я. Коклюш у детей. М.: Комментарий, 2014. 176 с.)
  • 3. Patent No. 2299908 C1 Russian Federation, MPC C12Q 1/68. Method of differentiation of Bordetella pertussis strains: No. 2005140623/13. 27.05.2007. Borisova O.Y., Kombarova S.Y., Mazurova I.K., Aleshkin V.A. Federal State Institution of Science “Moscow Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky” Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare. Russian. (Патент № 2299908 C1 Российская Федерация, МПК C12Q 1/68. Способ дифференциации штаммов Bordetella pertussis: № 2005140623/13. 27.05.2007 г. Борисова О.Ю., Комбарова С.Ю., Мазурова И.К., Алешкин В.А. Федеральное государственное учреждение науки «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.)
  • 4. Pimenova A.S., Borisova A.B., Gadua N.T., Borisova O.Yu., Afanasiev S.S., Petrova M.S., et al. PCR-based diagnosis of whooping cough in the Russian Federation. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2021;66(1):52-58. Russian. (Пименова А.С., Борисова А.Б., Гадуа Н.Т., Борисова О.Ю., Афанасьев С.С., Петрова М.С. и соавт. Применение метода ПЦР для видовой идентификации возбудителя коклюша в Российской Федерации. Клиническая лабораторная диагностика. 2021;66(1):52-58.) DOI: 10.18821/0869-2084-2021-66-1-52-58
  • 5. Usova E.E., Akhmedova A.I., Averchenko Y.A., Setyamina U.S. Possibilities of MOLDI-TOF identification of microorganisms in a large multidisciplinary hospital in Krasnoyarsk. Trumplin in science: Collection of abstracts of student scientific and practical conference, Krasnoyarsk, May 15-26, 2023. Krasnoyarsk: Krasnoyarsk State Medical University named after Prof. V.F. Voyno-Yasenetsky, 2023. Р. 58-59. Russian. (Усова Е.Е., Ахмедова А.И., Аверченко Ю.А., Сетямина У.С. Возможности MALDITOF идентификации микроорганизмов в крупном многопрофильном стационаре г. Красноярска. Трамплин в науку: Сборник тезисов студенческой научно-практической конференции, Красноярск, 15-26 мая 2023 года. Красноярск: Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого, 2023. С. 58-59.)
  • 6. Order of the Ministry of Health of the Russian Federation of May 18, 2021 No. 464n “On Approval of the Rules of Laboratory Research” with amendments. Supplement No. 8. Russian. (Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 18 мая 2021 г. № 464н «Об утверждении Правил проведения лабораторных исследований» с изменениями. Приложение №8.)
  • 7. Ferreira L., Sánchez-Juanes F., Muñiz M.C., GonzálezBuitrago J.M., Vega S., González M., et al. Identifying bacteria using a matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometer. Comparison with routine methods used in clinical microbiology laboratories. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2010;28(8): 492-497. DOI: 10.1016/j.eimc.2009.12.009
  • 8. World Health Organization. Laboratory Manual for the diagnosis of whooping cough caused by Bordetella pertussis/Bordetella parapertussis: update 2014. Available at: www.who.int/publications/i/item/WHO-IVB-14.03. Accessed June 2024.
  • 9. Borisova O.Y., Popova O.P., Petrova M.S., Donskikh E.E., Alyoshkin V.A. Dynamics of serotype landscape of Bordetella pertussis strains circulating in Russia. Medical almanac. 2014;32(2):48-51. Russian. (Борисова О.Ю., Попова О.П., Петрова М.С., Донских Е.Е., Алешкин В.А. Динамика серотипового пейзажа штаммов Bordetella pertussis, циркулирующих в России. Медицинский альманах. 2014;32(2):48-51.)
  • 10. Alyoshkin V.A., Borisova O.Y., Alyoshkin A.V., Ivashinnikova G.A., Mazurova I.K., Kafarskaya L.I., et al. Clonal composition of the population of Bordetella pertussis strains isolated in Russia. Infectious diseases. 2013;11(1):103-109. Russian. (Алешкин В.А., Борисова О.Ю., Алешкин А.В., Ивашинникова Г.А., Мазурова И.К., Кафарская Л.И. и соавт. Клональный состав популяции штаммов Bordetella pertussis, выделенных в России. Инфекционные болезни. 2013;11(1):103-109.)
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились