Возможности использования онлайн-регистра AMRcf у пациентов с муковисцидозом | КМАХ

Возможности использования онлайн-регистра AMRcf у пациентов с муковисцидозом

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):417-425

​ Максимова Е.А., Кузьменков А.Ю., Лямин А.В., Козлов А.В., Кондратьева Е.И., Кондратенко О.В.
10.36488/cmac.2024.4.417-425
AMRcf AMRcloud онлайн-платформа мониторинг микробиота муковисцидоз
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):417-425

Цель.

Оценить результаты внедрения платформ AMRcf и AMRcloud для мониторинга микробиологических исследований пациентов с муковисцидозом (МВ) в рутинную практику микробиологической лаборатории.

Материалы и методы.

Исследование выполнено на базе микробиологического отдела клинико-диагностической лаборатории Клиник СамГМУ. В ходе работы в рутинную практику были внедрены программы: AMRcf (онлайн-регистр микроорганизмов для пациентов с МВ) и AMRcloud (онлайн-платформа для анализа собранных данных по антибиотикорезистентности). Результаты проведенных за период с 2018 по 2023 г. микробиологических исследований из 16 регионов РФ были ретроспективно внесены в онлайн-платформу AMRcf.

Результаты.

Всего в базу данных регистра AMRcf для индивидуального анализа внесены результаты о 3052 изолятах, выделенных от пациентов с МВ. Сформированный пул данных в AMRcf был протестирован для автоматизированной выгрузки в платформу AMRcloud, которая в последующем использовалась для анализа накопленных данных на уровне исследуемой популяции. Внедрение платформы AMRcf позволило обеспечить: сохранение и доступ к микробиологическим данным пациентов с МВ; интеграцию данных из различных регионов и источников, индивидуальный микробиологический анамнез для каждого пациента в режиме реального времени, взаимодействие специалистов разных областей, занимающихся проблемой микробиологической диагностики и антимикробной терапии у пациентов с МВ.

Выводы.

Внедрение в работу микробиологической лаборатории онлайн-регистра AMRcf и онлайн-платформы AMRcloud, позволяет проводить индивидуальный ретроспективный микробиологический мониторинг у пациентов с МВ в различных регионах РФ. Данные онлайн-платформ AMRcf и AMRcloud могут использоваться в рутинной практике врачами-микробиологами, клиницистами и эпидемиологами.

Елена Анатольевна Максимова

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Кузьменков Алексей Юрьевич

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Лямин Артем Викторович

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Андрей Владимирович Козлов

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Кондратьева Е.И.

ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. акад. Н.П. Бочкова», Москва, Россия

Ольга Владимировна Кондратенко

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

  • 1. O’Neill J. Antimicrobial resistance: tackling a crisis for the health and wealth of nations. The review on antimicrobial resistance. 2014. Available at: https://amr-review.org/Publications.html. Accessed September 2024.
  • 2. Strachunsky L.S., Andreeva I.V. Self-medication with antibiotics in Russia. Remedium. 2004;12:19-25. Russian. (Страчунский Л.С., Андреева И.В. Самолечение антибиотиками в России. Ремедиум. 2004;12:19-25.)
  • 3. Tamma P.D., Avdic E., Keenan J.F., Zhao Y., Anand G., Cooper J., et al. What is the more effective antibiotic stewardship intervention: pre-prescription authorization or post-prescription review with feedback? Clin Infect Dis. 2017;64(5):537-543. DOI: 10.1093/cid/ciw780
  • 4. Kuzmenkov A.Yu., Vinogradova A.G., Trushin I.V., Kozlov R.S. Practice of local antibiotic resistance monitoring at hospitals in various regions of the Russian Federation. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2022;24(1):31-38. Russian. (Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г., Трушин И.В., Козлов Р.С. Практика локального мониторинга антибиотикорезистентности в стационарах различных регионов РФ. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022; 24(1):31-38.) DOI: 10.36488/cmac.2022.1.31-38
  • 5. Morency-Potvin P., Schwartz D.N., Weinstein R.A. Antimicrobial stewardship: how the microbiology laboratory can right the ship. Clin Microbiol Rev. 2017;30(1):381407. DOI: 10.1128/CMR.00066-16
  • 6. Kuzmenkov A.Yu., Vinogradova A.G. Antimicrobial resistance monitoring: a review of information resources. Bulletin of Siberian Medicine. 2020;19(2):163-170. Russian. (Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г. Мониторинг антибиотикорезистентности: обзор информационных ресурсов. Бюллетень сибирской медицины. 2020;19(2):163-170.) DOI: 10.20538/1682-0363-2020-2-163-170
  • 7. Baranov A.A., Namazova-Baranova L.S., Kutsev S.I., Avdeev S.N., Polevichenko E.V., Belevskiy A.S., et al. Modern approaches in management of children with cystic fibrosis. Pediatric pharmacology. 2022;19(2):153-195. Russian. (Баранов А.А., Намазова-Баранова Л.С., Куцев С.И., Авдеев С.Н., Полевиченко Е.В., Белевский А.С. и соавт. Современные подходы к ведению детей с муковисцидозом. Педиатрическая фармакология. 2022;19(2):153-195.) DOI: 10.15690/pf.v19i2.2417
  • 8. Kondratenko O.V., Zhestkov A.V., Medvedeva E.D., Ermolaeva A.V., Vasileva E.A. Monitoring of the microflora of the paranasal sinuses as a method of early prevention of colonization of the lower respiratory tract of clinically significant strains of microorganisms in patients with сystic fibrosis. Izvestija Samarskogo nauchnogo centra Rossijskoj akademii nauk. 2018;20(5):569-578. Russian. (Кондратенко О.В., Жестков А.В., Медведева Е.Д., Ермолаева А.В., Васильева Е.А. Мониторинг микрофлоры параназальных синусов как способ ранней профилактики колонизации нижних дыхательных путей клинически значимыми штаммами микроорганизмов у пациентов с муковисцидозом. Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2018;20(5):569-578.)
  • 9. Kondratenko OV., Zhestkov A.V., Ljamin A.V., Polikarpova S.V. Microbiota of the respiratory tract in patients with cystic fibrosis. Bjulleten’ Orenburgskogo nauchnogo centra UrO RAN. 2019;3:6. Russian. (Кондратенко О.В., Жестков А.В., Лямин А.В., Поликарпова С.В. Микробиота респираторного тракта у пациентов с муковисцидозом. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2019;3:6.) DOI: 10.24411/2304-9081-2019-13008
  • 10. Lyamin A.V., Zolotov M.O., Kondratenko O.V., Maksimova E.A., Ismatullin D.D., Bochkareva P.V. Prevalence of antimicrobial-resistant Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients with cystic fibrosis. Meditsinskiy sovet. 2023;(20):114-120. Russian. (Лямин А.В., Золотов М.О., Кондратенко О.В., Максимова Е.А., Исматуллин Д.Д., Бочкарева П.В. Распространенность резистентных к антимикробным препаратам штаммов Pseudomonas aeruginosa, выделенных от пациентов с муковисцидозом. Медицинский совет. 2023;(20):114-120.) DOI: 10.21518/ms2023-346
  • 11. Voronina O. L., Ryzhova N. N., Kunda M. S., Aksenova E.I., Sharapova N.E., Amelina E.L., et al. Major tendencies in burkholderia diversity changes, infecting russian patients with cystic fibrosis. Sibirskoe medicinskoe obozrenie. 2019;(2):116. Russian. (Воронина О.Л., Рыжова Н.Н., Кунда М.С., Лосева Э.В., Аксенова Е.И. и соавт. Основные тенденции в изменении разнообразия буркхолдерий, инфицирующих российских больных муковисцидозом. Сибирское медицинское обозрение. 2019;(2):116.) DOI: 10.20333/2500136-2019-2-80-88
  • 12. Kondratenko O.V., Ljamin A.V., Zhestkov A.V. Structure and antibiotic resistance microflora isolated from lower respiratory tract in patients with cystic fibrosis in Samara. Prakticheskaja medicina. 2012;56(1):85-88. Russian. (Кондратенко О.В., Лямин А.В., Жестков А.В. Структура и антибиотикорезистентность микрофлоры, выделенной из нижних дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом в г. Самаре. Практическая медицина. 2012;56(1):85-88.)
  • 13. Polikarpova S.V., Zhilina S.V., Kondratenko O.V., Lyamin A.V., Borzova O.V., Zhestkov A.V. Guidelines for the microbiologic diagnosis of respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis. Triada, 2019. 128 p. Russian. (Поликарпова С.В., Жилина С.В., Кондратенко О.В., Лямин А.В., Борзова О.В., Жестков А.В. Руководство по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. Триада, 2019. 128 с.)
  • 14. Likstanov M.I., Kuzmenko S.A., Mozes V.G., Movshina I.N., Barinova E.V., Kovalivnich O.V., et al. Prevention of infections associated with the provision of medical care in patients with cystic fibrosis in a multidisciplinary hospital in Kuzbass for the period 2020-2021. Medicine in Kuzbass. 2022;21(4):5-9. Russian. (Ликстанов М.И., Кузьменко С.А., Мозес В.Г., Мовшина И.Н., Баринова Е.В., Коваливнич О.В. и соавт. Профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, у больных муковисцидозом в многопрофильном стационаре Кузбасса за период 2020-2021 годы. Медицина в Кузбассе. 2022;21(4):5-9.) DOI: 10.24412/2687-0053-2022-4-5-9
  • 15. Kondratieva E.I., Kashirskaya N.Yu., Kapranov N.I. National consensus “Cystic fibrosis: definition, diagnostic criteria, therapy”. 2016. Russian. (Кондратьева Е.И., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И. Национальный консенсус «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии, терапия». 2016.)
  • 16. Petrova L.V., Kuzmenkov A.Yu., Kamyshova D.A., Vinogradova A.G., Gusarov V.G., Zamyatin M.N. Experience in implementing the AMRcloud online platform for local antimicrobial resistance surveillance in a tertiary care hospital. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2022;24(1):39-46. Russian. (Петрова Л.В., Кузьменков А.Ю., Камышова Д.А., Виноградова А.Г., Гусаров В.Г., Замятин М.Н. Опыт внедрения онлайн-платформы AMRcloud для локального мониторинга антибиотикорезистентности в многопрофильном стационаре. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022;24(1):39-46.) DOI: 10.36488/cmac.2022.1.39-46
  • 17. Kuzmenkov A.Yu., Vinogradova A.G., Trushin I.V., Avramenko A.A., Edelstein M.V., Dekhnich A.V., et al. AMRcloud: a new paradigm in monitoring of antibiotic resistance Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2019;21(2):119-124. Russian. (Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г., Трушин И.В., Авраменко А.А., Эйдельштейн М.В., Дехнич А.В. и соавт. AMRcloud: новая парадигма мониторинга антибиотикорезистентности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):119-124.) DOI: 10.36488/cmac.2019.2.119-124
  • 18. Recommendations “Susceptibility testing of microorganisms to antimicrobial agents. Version 2021-01.” Available at: www.antibiotic.ru/files/321/clrec-dsma2021.pdf. Aссessed September 2024. Russian. (Рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Версия 2021-01». Доступно по адресу: www.antibiotic.ru/files/321/clrec-dsma2021.pdf. Ссылка активна на сентябрь 2024 г.)
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились