Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(3):356-369
Проанализировать распространенность и разнообразие мутаций, ассоциированных с резистентностью к макролидам и фторхинолонам в выборке M. genitalium-положительных клинических образцов, выделенных от пациентов, проходивших обследование в дерматовенерологических клиниках двух мегаполисов России: Москвы и Санкт-Петербурга в 2021–2024 гг.
Проанализировано 530 образцов ДНК M. genitalium, полученных от мужчин и женщин, проходивших обследование в кожно-венерологическом диспансере №11 г. СанктПетербурга и клинических базах Московского научно-практического Центра дерматовенерологии и косметологии Департамента здравоохранения г. Москвы. Скрининг в локальных лабораториях проводился с использованием коммерчески доступных наборов для выделения и выявления ДНК M. genitalium. Первичный скрининг на наличие мутаций, ассоциированных с резистентностью, осуществлялся в лаборатории молекулярной диагностики НИИАХ СГМУ с использованием модифицированного метода ПЦР-РВ с эффектом гашения флюоресценции зонда праймером (P2P), который позволяет выявлять все значимые мутации в специфических локусах, как было описано ранее [1]. Подтверждение всех выявленных вариантов мутаций проводили методом секвенирования по Сэнгеру, как было описано ранее [2]. Анализ и визуализацию полученных данных проводили с помощью онлайн-платформы AMRcloud в рамках открытого многоцентрового проекта DeMaRes (https://amrcloud.net/ru/project/demares/).
185 и 345 положительных образцов M. genitalium из Санкт-Петербурга и Москвы соответственно показали наличие специфического сигнала как в гене 23S рРНК, так и в parC при первичном скрининге. Наличие мутаций, ассоциированных с устойчивостью к макролидам, продемонстрировали 29% (54⁄185) образцов из Санкт-Петербурга и 28% (97⁄345) из Москвы, с преобладанием генотипа A2059G 23S рРНК M. genitalium в 57% (31⁄54) и 68% (66⁄97) соответственно. Вторую по численности долю составили образцы, в которых выявлена нуклеотидная замена A→G в позиции 2058: 23⁄54 (42%) из Санкт-Петербурга и 30⁄97 (30%) из Москвы. Мутации, ассоциированные с устойчивостью к фторхинолонам, выявлены в гене parC в 47⁄185 (25%) и 73⁄345 (21%) случаях из Санкт-Петербурга и Москвы соответственно. В Москве превалирует аминокислотная замена S80I 39% (29⁄73), вторая по численности D84N встречается в 35% (26⁄73), в Санкт-Петербурге аналогичное соотношение S80I 44% (21⁄47), D84N составляет 29% (14⁄47). В Москве семь образцов несут третью по численности мутацию S80N, что составляет 9%, в СанктПетербурге этот показатель в два раза выше и составляет 19% (9⁄47). На долю остальных мутаций в двух городах приходится не более 1% (D84G, D84Y, S81P). В Санкт-Петербурге одновременно с мутациями в 23S рРНК подтверждено также наличие аминокислотных замен в гене parC QRDR, что представляет собой случай сочетанной резистентности к двум группам препаратов, этот уровень в 1,5 раза выше, чем в Москве (40% (39⁄97)) и составляет 61% (33⁄54). Наиболее распространенной комбинацией мутаций является A2059G (23S рРНК) + S80I (parC), она составляет в СанктПетербурге 33% (18⁄54), в Москве 25,7% (25⁄97). Второй по численности генотип – A2058G (23S рРНК) + D84N (parC) составляет 14% (8⁄54) и 10% (10⁄97) соответственно.
Высокий уровень устойчивости к макролидам и фторхинолонам у M. genitalium в двух крупных городах России представляет собой значимую проблему и предполагает внедрение рутинного тестирования на устойчивость к противомикробным препаратам до назначения терапии. Внедрение адаптированных диагностических и терапевтических алгоритмов позволит сократить длительность приема препаратов, повысит эффективность проводимой терапии и уменьшит нагрузку на систему здравоохранения. Использование системы длительного мониторинга за возбудителем позволит улучшить политику назначения антибиотиков и снизить рост устойчивости к антимикробным препаратам и ее распространение на территории России.