Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(3):338-344
Провести филогенетический анализ для оценки изменений, происходящих в популяционной структуре российских клинических изолятов N. gonorrhoeae по протоколу NG-STAR.
Объектом исследования явились 34 клинических изолята N. gonorrhoeae, поступивших из российских медицинских организаций дерматовенерологического профиля в период 2022–2023 гг. Поступившие культуры рассеивали на шоколадный агар с добавлением 1% ростовой добавки ISOVitalex и 1% селективной добавки VCAT (Becton Dickinson, США). Затем проводили MALDI-TOF масс-спектрометрию на приборе MALDI Microflex (Bruker Daltonics, Германия). Определение чувствительности N. gonorrhoeae к 6 антимикробным препаратам – пенициллину, спектиномицину, цефтриаксону, тетрациклину, азитромицину и ципрофлоксацину осуществляли методом серийных разведений в агаре с определением минимальных подавляющих концентраций. Геномную ДНК выделяли из чистых культур N. gonorrhoeae с использованием набора «Проба-НК» (ДНК-Технология, Россия). Молекулярное типирование данных штаммов проводили на платформе MiSeq (Illumina, США). Для молекулярного типирования штаммов N. gonorrhoeae использовали метод Sequence Typing for Antimicrobial Resistance (NG-STAR) для выявления генотипов, ассоциированных с детерминантами антибиотикорезистентности.
По протоколу NG-STAR проведено генотипирование 34 штаммов N. gonorrhoeae, поступивших из 4-х регионов России, с выявлением генотипических детерминант, ассоциированных с антибиотикорезистентностью. Было идентифицировано 19 сиквенс-типов, входящих в 7 уже описанных клональных комплексов (CC). Наиболее представительными СС среди исследованных штаммов явились 199 и 427 (38,2% и 26,5% соответственно). У 44,1% штаммов выявлена резистентность к 6 антибиотикам, ассоциированная с вариабельностью фрагментов генов penA, mtrR, porB, ponA, gyrA, parC и 23S рРНК.
Выявлен ряд молекулярных типов N. gonorrhoeae, ассоциированных с фенотипической мультирезистентностью, что подтверждает важность проведения комплексных лабораторных исследований клинических изолятов для предупреждения распространения резистентности в России.