Этиология внебольничной пневмонии у взрослых в стационарах РФ после пандемии COVID-19: результаты многоцентрового проспективного исследования | КМАХ

Этиология внебольничной пневмонии у взрослых в стационарах РФ после пандемии COVID-19: результаты многоцентрового проспективного исследования

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(2):141-147

​ Рачина С.А., Купрюшина О.А., Стрелкова Д.А., Авдеев С.Н., Власенко А.Е., Яснева А.С., Юданова Т.А., Трофименко И.Н., Антонов В.Н., Агибалова М.Н., Мержоева З.М., Яцышина С.Б., Тихонова М.А., Елькина М.А., Ананичева Н.А., Бурмистрова Е.Н., Сухорукова М.В.
10.36488/cmac.2024.2.141-147
внебольничная пневмония COVID-19 этиология взрослые
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(2):141-147

Цель.

Изучить структуру возбудителей внебольничной пневмонии (ВП) у взрослых госпитализированных пациентов после завершения пандемии COVID-19.

Материалы и методы.

В проспективное многоцентровое исследование включали пациентов 18 лет и старше, госпитализированных в 6 многопрофильных стационаров разных регионов России с июля по ноябрь 2023 г. Для установления этиологии ВП выполнялось культуральное исследование образца из нижних дыхательных путей (мокрота, трахеальный аспират) и крови (тяжелая ВП), экспресс-тесты на пневмококковую и легионеллезную антигенурию. Дополнительно образец из нижних дыхательных путей или комбинированный респираторный мазок исследовали методом ПЦР в режиме реального времени для выявления ДНК Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, ДНК/РНК наиболее распространенных респираторных вирусов.

Результаты.

Из 152 включенных больных клинически значимые возбудители ВП выявлены в 96 (63%) случаях, медиана возраста больных с верифицированной этиологией ВП составила 45 [34,8; 66] лет, индекс коморбидности 0,5 (0; 3,0) балла. Среди возбудителей наиболее часто выявлялись M. pneumoniae – 42 (44%), риновирус – 23 (24%), S. pneumoniae – 17 (18%) и SARS-CoV-2 – 13 (14%) пациентов. Коинфекция зарегистрирована в 22% случаев, наиболее часто встречаемыми ассоциациями были M. pneumoniae + риновирус – 5 (3,3%), S. pneumoniae + риновирус – 3 (2%). У 1 пациента выявлена пневмококковая бактериемия. У большинства пациентов отмечалось нетяжелое течение ВП, 17 (18%) больным потребовалась госпитализация в ОРИТ. Госпитальная летальность составила 7%.

Выводы.

Наиболее частыми возбудителями ВП у взрослых госпитализированных пациентов с ВП в первые месяцы после завершения пандемии COVID-19 являлись M. pneumoniae, респираторные вирусы (преимущественно риновирус и SARS-CoV-2) и S. pneumoniae. Использование комплексного подхода к этиологической диагностике позволяет существенно увеличить долю больных ВП с установленным этиологическим диагнозом.

Рачина Светлана Александровна

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Купрюшина О.А.

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Дарья Александровна Стрелкова

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Авдеев С.Н.

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Власенко А.Е.

ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

Яснева А.С.

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Юданова Т.А.

ОГБУЗ «Смоленская областная клиническая больница», Смоленск, Россия

Трофименко И.Н.

Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО РМАНПО Минздрава России, Иркутск, Россия

Антонов В.Н.

ФГБОУ ВО «Южно-Уральский государственный медицинский университет» Минздрава России, Челябинск, Россия
ГАУЗ «Областная клиническая больница №3» Челябинский областной пульмонологический центр, Челябинск, Россия

Агибалова М.Н.

ГБУЗ Архангельской области «Котласская центральная больница им. св. Луки (В.Ф. Войно-Ясенецкого), Котлас, Россия

Мержоева З.М.

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия

Яцышина С.Б.

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Тихонова М.А.

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Елькина М.А.

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Ананичева Н.А.

ГБУЗ «Городская клиническая больница им. С.С. Юдина Департамента здравоохранения города Москвы», Москва, Россия

Бурмистрова Е.Н.

ГБУЗ «Городская клиническая больница им. С.С. Юдина Департамента здравоохранения города Москвы», Москва, Россия

Сухорукова Марина Витальевна

ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва, Россия

  • 1. Torres A., Peetermans W.E., Viegi G., Blasi F. Risk factors for community-acquired pneumonia in adults in Europe: a literature review. Thorax. 2013;68(11):1057-1065. DOI: 10.1136/thoraxjnl-2013-204282
  • 2. Feldman C., Shaddock E. Epidemiology of lower respiratory tract infections in adults. Expert Rev Respir Med. 2019;13(1):63-77. DOI: 10.1080/17476348.2019.1555040
  • 3. Rachina S.A., Sinopalnikov A.I. Infectious diseases of the lower respiratory tract. In: Fundamentals of internal medicine. In 2 vol. Vol. 1. Revised supplemented, ed. by V.S. Moiseev, J.D. Kobalava, I.V. Maev et al. M.: MIA, 2020; p. 145-169. Russian. (Рачина С.А., Синопальников А.И. Инфекционные заболевания нижних дыхательных путей. В кн.: Основы внутренней медицины. В 2 томах. Том 1. Перераб. доп., под ред. В.С. Моисеева, Ж.Д. Кобалава, И.В. Маева и др. M.: МИА, 2020; c. 145-169.)
  • 4. Rachina S.A., Sinopalnikov A.I. Community-acquired pneumonia in the book: Manual of Respiratory Diseases. Edited by S.N. Avdeev. OOO Advertising Agency Re Media, Moscow, 2023. Russian. (Рачина С.А., Синопальников А.И. Внебольничная пневмония в кн.: Руководство по болезням органов дыхания. Под редакцией С.Н. Авдеева. ООО Рекламное агентство Ре Медиа, Москва, 2023 г.)
  • 5. Yan Y., Tomooka K., Naito T., Tanigawa T. Decreased number of inpatients with community-acquired pneumonia during the COVID-19 pandemic: a large multicenter study in Japan. J Infect Chemother. 2022;28(5):709-713. DOI: 10.1016/j.jiac.2022.01.013
  • 6. Avdeev S.N., Dekhnich A.V., Zaytsev A.A., Kozlov R.S., Rachina S.A., Rudnov V.A., et al. Federal guidelines on diagnosis and treatment of community-acquired pneumonia. Pulmonologiya. 2022;32(3):295-355. Russian. (Авдеев С.Н., Дехнич А.В., Зайцев А.А., Козлов Р.С., Рачина С.А., Руднов В.А. и соавт. Внебольничная пневмония: федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению. Пульмонология. 2022;32(3):295355.) DOI: 10.18093/0869-0189-2022-32-3-295-35
  • 7. Chuchalin A.G., Sinopal’nikov A.I., Kozlov R.S., Tyurin I.E, Rachina S.A. Community-acquired pneumonia in adults: practical guidelines for diagnosis, necessity, and prevention: a guide for physicians. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2010;12(3):186225. Russian. (Чучалин А.Г., Синопальников А.И., Козлов Р.С., Тюрин И.Е., Рачина С.А. Внебольничная пневмония у взрослых: практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике: пособие для врачей). Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010;12(3):186-225.)
  • 8. Ezhlova E.B., Melnikova A.A., Frolova N.V., Maleev V.V., Akimkin V.G., Ploskireva A.A., et al. Epidemiological surveillance of out-of-hospital pneumonia. Methodological guidelines MU 3.1.2/4.2. 397323. Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare. Moscow, 2023. Russian. (Ежлова Е.Б., Мельникова А.А., Фролова Н.В., Малеев В.В., Акимкин В.Г., Плоскирева А.А. и соавт. Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями. Методические указания МУ 3.1.2/4.2. 397323. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Москва, 2023 г.)
  • 9. Yamamoto T., Komiya K., Fujita N., Okabe E., Hiramatsu K., Kadota J.I. COVID-19 pandemic and the incidence of community-acquired pneumonia in elderly people. Respir Investig. 2020;58(6):435-436. DOI: 10.1016/j.resinv.2020.09.001
  • 10. Oster Y., Michael-Gayego A., Rivkin M., Levinson L., Wolf D.G., Nir-Paz R. Decreased prevalence rate of respiratory pathogens in hospitalized patients during the COVID-19 pandemic: possible role for public health containment measures? Clin Microbiol Infect. 2021;27(5):811-812. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.12.007
  • 11. Huang Q.S., Wood T., Jelley L., Jennings T., Jefferies S., Daniells K., et al. Impact of the COVID-19 nonpharmaceutical interventions on influenza and other respiratory viral infections in New Zealand. Nat Commun. 2021;12(1):1001. DOI: 10.1038/s41467-02121157-9
  • 12. Jain S., Self W.H., Wunderink R.G., Fakhran S., Balk R., Bramley A.M., et al. Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S. adults. N Engl J Med. 2015;373(5):415-427. DOI: 10.1056/NEJMoa1500245
  • 13. Cilloniz C., Ewig S, Polverino E., Marcos M.A., Prina E., Sellares J., et al. Community-acquired pneumonia in outpatients: aetiology and outcomes. Eur Respir J. 2012;40(4):931-938. DOI: 10.1183/09031936.00168811
  • 14. Musher D.M., Abers M.S., Bartlett J.G. Evolving understanding of the causes of pneumonia in adults, with special attention to the role of pneumococcus. Clin Infect Dis. 2017;65(10):1736-1744. DOI: 10.1093/cid/cix549
  • 15. Gadsby N.J., Russell C.D., McHugh M.P., Mark H., Morris A.C., Laurenson I.F., et al. Comprehensive molecular testing for respiratory pathogens in communityacquired pneumonia. Clin Infect Dis. 2016;62(7):817823. DOI: 10.1093/cid/civ1214
  • 16. Markussen D.L., Serigstad S., Ritz C., Knoop S.T., Ebbesen M.H., Faurholt-Jepsen D., et al. Diagnostic stewardship in community-acquired pneumonia with syndromic molecular testing. JAMA Netw Open. 2024;7(3):e240830. DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2024.0830
  • 17. Rachina S.A., Bobylev A.A. Atypical pathogens of community-acquired pneumonia: epidemiology, diagnosis, and treatment. Practical pulmonology. 2016;2:20-28. Russian (Рачина С.А., Бобылев А.А. Атипичные возбудители внебольничной пневмонии: от эпидемиологии к особенностям диагностики и лечения. Практическая пульмонология. 2016;2:20-28.)
  • 18. Meyer Sauteur P.M., Beeton M.L.; European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Study Group for Mycoplasma and Chlamydia Infections (ESGMAC), and the ESGMAC Mycoplasma pneumoniae Surveillance (MAPS) study group. Mycoplasma pneumoniae: delayed re-emergence after COVID-19 pandemic restrictions. Lancet Microbe. 2024;5(2):e100-e101. DOI: 10.1016/S2666-5247(23)00344-0
  • 19. Zayet S., Poloni S., Plantin J., Hamani A., Meckert Y., Lavoignet C-E., et al. Outbreak of Mycoplasma pneumoniae pneumonia in hospitalized patients: who is concerned? Nord Franche-Comte Hospital, France, 20232024. Epidemiol Infect. 2024;152:e46. DOI: 10.1017/S0950268824000281
  • 20. What to know about Mycoplasma, the bacteria behind recent spikes in pneumonia cases in Ohio and overseas. Available at: https://edition.cnn.com/2023/12/01/health/mycoplasma-pneumonia/index.html. Accessed December 22, 2023.
  • 21. Rospotrebnadzor recorded cases of mycoplasma infection in Russia. Available at: www.vedomosti.ru/society/news/2023/12/05/1009494-mikoplazmennoi-infektsii?ysclid=lqjxjf3o3h244398811. Accessed August 20, 2024. Russian. (Роспотребнадзор зафиксировал случаи микоплазменной инфекции в России. Доступно на сайте: www.vedomosti.ru/society/news/2023/12/05/1009494-mikoplazmennoi-infektsii?ysclid=lqjxjf3o3h244398811. Ссылка активна на 20 августа 2024 г.)
  • 22. Welte T., Torres A., Nathwani D. Clinical and economic burden of community-acquired pneumonia among adults in Europe. Thorax. 2012;67(1):71-79 DOI: 10.1136/thx.2009.129502
  • 23. Braeken D.C.W., Essig A., Panning M., Hoerster R., Nawrocki M., Dalhoff K., et al. Shift in bacterial etiology from the CAPNETZ cohort in patients with community­acquired pneumonia: data over more than a decade. Infection. 2021;49:533-537. DOI: 10.1007/s15010-021-01605-w
  • 24. Elkina M.A., Yatsyshina S.B., Tronza T.V., Rachina S.A., Spichak T.V., Akimkin V.G. Efficiency of molecular genetic methods of diagnostics of infections caused by S. pneumoniae and H. influenzae. Epidemiology and infectious diseases. Current issues. 2023;13(2):56-62. Russian. (Елькина М.А., Яцышина С.Б., Тронза Т.В., Рачина С.А., Спичак Т.В., Акимкин В.Г. Эффективность молекулярно-генетических методов диагностики инфекций, вызванных S. pneumoniae и H. influenzae. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2023;13(2):56-62.) DOI: 10.18565/epidem.2023.13.2.56-62
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились