Генетическая характеристика Neisseria meningitidis, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Смоленской области | КМАХ

Генетическая характеристика Neisseria meningitidis, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Смоленской области

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020; 22(2):92-95

​ Миронов К.О., Ярыгина Е.А., Чагарян А.Н., Иванчик Н.В.
10.36488/cmac.2020.2.92-95
генерализованные формы менингококковой инфекции Neisseria meningitidis мультилокусное секвенирование-типирование клональный комплекс
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020; 22(2):92-95

Цель.

Антигенная и генетическая характеристика Neisseria meningitidis, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Смоленской области, в сопоставлении с менингококками, циркулирующими на других территориях.

Материалы и методы.

Методом мультилокусного секвенирования-типирования в сочетании с антигенной характеристикой трех вариабельных фрагментов белков наружной мембраны исследовано 14 образцов спинномозговой жидкости, полученных в 2016–2019 гг. и содержащих ДНК N. meningitidis (использовался набор АмплиСенс® Nm-ABCW). Результаты проанализированы с использованием алгоритма кластеризации BURST и программных возможностей интернет-ресурса PubMLST.org (Jolley K. и соавт. 2018).

Результаты.

Определены аллели, сиквенс-типы и клональные комплексы для возбудителей, содержащихся в исследованных биологических образцах. Результаты генотипирования опубликованы в базе данных PubMLST (https://pubmlst.org/neisseria/). Большинство N. meningitidis серогруппы В (n = 6) имеют ранее не описанные сиквенс-типы: ST-14705, ST-14710, ST-14711, ST-14713 и ST-14717; серогруппы С (n = 7) – сиквенс-типы, характерные для штаммов, циркулирующих на территории России, при этом 4 из них имеют сиквенс-тип ST-8416; серогруппы Y (n = 1) – сиквенс-тип ST-11585.

Выводы.

Анализ полученных данных демонстрирует принадлежность большинства найденных сиквенс-типов клональным комплексам и группам генетически близких изолятов, описанным ранее и характерным для N. meningitidis, циркулирующих на территории России. Выявленные антигенные и генетические характеристики не позволяют говорить о циркуляции на наблюдаемой территории эпидемически опасных штаммов N. meningitidis или штаммов с повышенными вирулентными свойствами.

Константин Олегович Миронов

ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Ярыгина Е.А.

ФБУН «ЦНИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Чагарян Аида Нуримановна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Иванчик Натали Владимировна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

  • 1. Pokrovskiy V.I., Favorova L.A., Kostyukova N.N. Meningococcal infection. M.: Meditsina, 1976. 275 p. Russian. (ПокровскийВ.И., Фаворова Л.А., Костюкова Н.Н. Менингококковая инфекция. М.: Медицина, 1976. 275 с.)
  • 2. Meningococcal disease: methods and protocols. Editors: Pollard, Andrew J., Maiden, Martin C.J. (Eds.). Humana Press Inc.; 2001. 721 p.
  • 3. Meningococcal disease and purulent bacterial meningitis in Russian Federation, 2017. Information and analytical review. M.: 2018. 40 p. Russian. (Менингококковая инфекция и гнойные бактериальные менингиты в Российской Федерации, 2017. Информационно-аналитический обзор. М.: 2018. 40 с.)
  • 4. Mironov K.O., Platonov A.E., Dribnokhodova O.P., Kuseva V.I., Shipulin G.A. A method for determination of Neisseria meningitidis serogroup A, B, C and W by real-time PCR. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunologii. 2014;6:35-42. Russian. (Миронов К.О., Платонов А.Е., Дрибноходова О.П., Кусева В.И., Шипулин Г.А. Методика для определения серогрупп A, B, C и W Neisseria meningitidis методом ПЦР в режиме реального времени. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. 2014;6:35-42.)
  • 5. Mironov K.O. Clonal complex of Neisseria meningitidis, circulating in the regions of Russia and their role in epidemic process of meningococcal infection. Epidemiologija i infekcionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2016;6:52-61. Russian. (Миронов К.О. Клональные комплексы Neisseria meningitidis, циркулирующие на территории России, и их роль в эпидемическом процессе менингококковой инфекции. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016;6:52-61.)
  • 6. Jolley K.A., Bray J.E., Maiden M.C.J. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.org website and their applications. Wellcome Open Res. 2018;3:124. DOI: 10.12688/wellcomeopenres.14826.1
  • 7. Mironov K.O. Experience of the use of molecular and biological monitoring in the epidemiological surveillance of meningococcal infection in Russia. Epidemiologija i infekcionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2019;1:93-99. Russian. (Миронов К.О. Опыт использования молекулярно-биологического мониторинга в эпидемиологическом надзоре за менингококковой инфекцией в России. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2019;1:93-99.) DOI: 10.18565/epidem.2019.1.93-99
  • 8. Feil E.J., Li B.C., Aanensen D.M., Hanage W.P., Spratt B.G. eBURST: Inferring patterns of evolutionary descent among clusters of related bacterial genotypes from multilocus sequence typing data. J Bacteriol. 2004;186(5):1518-1530. DOI: 10.1128/JB.186.5.1518-1530.2004
  • 9. Clonal complex designation of Neisseria. Available at: https://pubmlst.org/neisseria/info/complexes.shtml. Accessed December 2019.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились