Применение системы MALDI Biotyper и алгоритма микробиологической диагностики для идентификации неферментирующих микроорганизмов, выделенных из дыхательных путей у больных муковисцидозом

Аннотация

Целью работы было сравнение MALDI Biotyper и алгоритма микробиологической диагностики для идентификации неферментирующих микроорганизмов, выделенных из дыхательных путей у больных муковисцидозом. Использовали разработанный алгоритм идентификации и типирования, включающий бактериологические, биохимические, молекулярно-биологические методы и систему MALDI Biotyper. В результате проведённых исследований удалось идентифицировать 47 видов неферментирующих микроорганизмов и установить, что наиболее трудной является идентификация микроорганизмов, принадлежащих к роду Achromobacter и Burkholderia cepacia complex (Bcc). Она требует применения комплекса бактериологических, биохимических, молекулярно-биологических методов, а также системы MALDI Biotyper, которая позволяет более точно и быстро идентифицировать роды и виды микроорганизмов. Представители рода Achromobacter были выделены от 89 взрослых пациентов и детей с муковисцидозом, среди которых 82,7% принадлежали виду Achromobacter ruhlandii и 10,6% — виду Achromobacter xylosoxidans. Были идентифицированы 60 штаммов Bcc трёх видов, из них 32 штамма Всс от взрослых пациентов и 28 от детей, 83,3% которых принадлежали виду B. cenocepacia. От взрослых пациентов и детей c муковисцидозом из Москвы выделяли B. cenocepacia, из Санкт-Петербурга — B. contaminans, B. cepacia, из Хабаровска — B. cepacia, B. cenocepacia, B. contaminans. От детей и взрослых были выделены 57 штаммов 11 видов рода Pseudomonas, из них 41 изолят (71,9%) был идентифицирован как P. aeruginosa, среди которых было 8 изолятов с атипичным фенотипом. Более простой представляется идентификация другого представителя неферментирующих микроорганизмов — P. aeruginosa, за исключением выделения штаммов с атипичным фенотипом, но и в этом случае использование масс-спектрометрии имеет решающее значение.