Особенности штаммов Pseudomonas aeruginosa, вызывающих госпитальные инфекции у пациентов хирургических отделений ФНЦТИО им. В.И. Шумакова

Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2012; 14(2):88-99

​ Воронина О.Л., Кунда М.С., Аветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Габриэлян Н.И., Шагинян И.А., Лунин В.Г.
Pseudomonas aeruginosa MLST генотип интегрон I класса множественная устойчивость
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Журнальная статья
Публикация
Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2012; 14(2):88-99

Аннотация

Изучены причины длительной циркуляции штаммов Pseudomonas aeruginosa определённого генотипа в отделениях интенсивной терапии ФНЦТИО им. акад. В.И. Шумакова. MLST показало, что ведущим генотипом является ST 235. Штаммы этого генотипа характеризует наличие в составе хромосомы мобильных интегронов I класса с кассетами генов blaGES5 и aadA6, определяющих множественную устойчивость к антибиотикам. Интегроны отличаются от обнаруженных ранее у штаммов ST 235 в других лечебных учреждениях. Штаммы P. aeruginosa генотипа 446 близкородственны токсигенному штамму PA-103. Штаммы ST 446, 598 и 966, а также большинство штаммов неферментирующих грамотрицательных бактерий, идентифицированных на основе фено- и генотипирования как Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia и Oceanobacillus spp., содержат функциональную платформу интегрона и могут быть потенциальными акцепторами генов, обеспечивающих адаптацию в стационаре. Показано, что штамм P. aeruginosa, выделенный из системы водоснабжения, не является возбудителем госпитальных инфекций у пациентов.

  • 1. Методические указания по эпидемиологическому надзору за внутрибольничными инфекциями. МУК №28-6/34. М., 1987 г.
  • 2. Bush K., Jacoby G.A. Updated functional classification of-beta-lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2010; 54(3):969-76.
  • 3. Empel J., Filczak K., Mrόwka A., Hryniewicz W., Livermore D.M., Gniadkowski M. Outbreak of Pseudomonas aeruginosa infections with PER-1 extended-spectrum b-lactamase in Warsaw, Poland: further evidence for an international clonal complex. J Clin Microbiol 2007; 45(9):2829-34.
  • 4. Poirel L., Brinas L., Fortineau N., Nordmann P. Integronencoded GES-type extended-spectrum b-lactamase with increased activity to ward aztreonam in Pseudomonas aeruginosa. Antimicrob Agents Chemother 2005; 49(8):3593-7.
  • 5. МУК № 4.2.1890-04 Методические указания. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. М., 2004
  • 6. Curran B., Jonas D., Grundmann H., Pitt T., Dowson C.G. Development of a multilocus sequence typing scheme for the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa. J Clin Microbiol 2004; 42(12):5644-9.
  • 7. Su J., Shi L., Yang L., Xiao Z., Li X., Yamasaki Sh.. Analysis of integrons in clinical isolates of Escherichia coli in China during the last six years. FEMS Microbiol Lett 2006; 254(1):75-80.
  • 8. Stokes H.W., Holmes A.J., Nield B.S., Holley M.P., Nevalainen K. M. H., Mabbut B. C., Gillings M. R. Gene cassette PCR: sequence-independent recovery of entire genes from environmental DNA. Appl Environ Microbiol 2001; 67(11):5240-6.
  • 9. Lévesque C., Piché L., Larose C., Roy P.H. PCR mapping of integrons reveals several novel combinations of resistance genes. Antimicrob Agents Chemother 1995, 39:185-91.
  • 10. Levings R.S., Lightfoot D., Partridge S.R., Hall R.M., Djordjevic S.P. The genomic island SGI1, containing the multiple antibiotic resistance region of Salmonella enterica serovar Typhimurium DT104 or variants of it, is widely distributed in other S. enterica serovars. J Bacteriol 2005; 187:4401-9.
  • 11. Naser S.M., Hagen K.E., Vancanneyt M., Cleenwerck I., Swings J., Tompkins T.A. Lactobacillus suntoryeus Cachat and Priest 2005 is a later synonym of Lactobacillus helveticus (Orla-Jensen 1919) Bergey et al. 1925 (Approved Lists 1980). Intern J System Evoluti Microbiol 2006; 56:355-60.
  • 12. Guan, L.L., Hagen, K.E., Tannock, G.W., Korver, D.R., Fasenko,G.M. & Allison, G.E. Detection and identification of Lactobacillus species in crops of broilers of different ages by using PCR-denaturing gradient gel electrophoresis and amplified ribosomal DNA restriction analysis. Appl Environ Microbiol 2003; 69:6750-7.
  • 13. Birnboim H.C., Doly J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucleic Acids Res 1979; 7(6):1513-23.
  • 14. The Main Site EMBL-EBI, European Bioinformatics Institute (URL:http://www.ebi.ac.uk 12-10-2011)
  • 15. The Main Site PubMLST of the Faculty of Zoology, Oxford University, Great Britain (R/http://pubmlst.org 15.10.2011)
  • 16. Аветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Габриелян Н.И., Ковтун Н.А., Горская Е.М., Шагинян И.А. Генетические особенности штаммов Pseudomonas aeruginosa, циркулирующих в хирургическом стационаре. ЖМЭИ 2009; 5:33-9.
  • 17. Liu P.V. The role of various fractions of Pseudomonas aeruginosa in its pathogenesis. III. Identity of the lethal toxins produced in vitro and in vivo. J Infect Dis 1966; 116:481-9.
  • 18. Viedma E., Juan C., Acosta J., Zamorano L., Otero J.R., Sanz F., Chaves F., Oliver A. Nosocomial spread of colistin-only-sensitive sequence type 235 Pseudomonas aeruginosa isolates producing the extended-spectrum b-lactamases GES-1 and GES-5 in Spain. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53(11):4930-3.
  • 19. Moura A., Soares M., Pereira C., Leitão N., Henriques I., Correia A. INTEGRALL: a database and search engine for integrons, integrases and gene cassettes. Bioinformatics 2009;25:1096-8.
  • 20. Raja C.E., Selvam G.S. Plasmid profile and curing analysis of Pseudomonas aeruginosa as metal resistant. Int J Environ Sci Tech 2009; 6(2):259-66.
  • 21. Mazzariol A., Mammina C., Koncan R, et al. A novel VIMtype metallo-beta-lactamase (VIM-14) in Pseudomonas aeruginosa clinical isolate from a neonatal intensive care unit. Clin Microbiol Infect 2011; 17(5):722-4.
  • 22. Partridge S.R., Tsafnat G., Coiera E., Iredell J.R. Gene cassettes and cassette arrays in mobile resistance integrons. FEMS Microbiol Rev 2009; 33:757-84.
  • 23. Mitsuhashi S., Harada K., Hashimoto H., Egawa R. On the drug resistance of enteric bacteria. Jpn J Exp Med 1961; 31:47-52.
  • 24. Cambray G., Guerout A.-M., Mazel D. Integrons. Annu Rev Genet 2010, 44:141-66.
  • 25. Stokes H.W., Hall R.M. A novel family of potentially mobile DNA elements encoding site-specific geneintegration functions: integrons. Mol Microbiol 1989, 3:1669-83.
  • 26. Moraga R.M., Santander E.P., Arias T.C., Méndez F.A. Integrons y su relacion el fenotipo de Resistencia en bacilos gramnegativos aislados en el hospital Torres Galdames de Iquiqe, Chile. Rev Chil Infect 2007; 24(5):384-90.
  • 27. Шагинян И.А., Чернуха М.Ю. Неферментирующие грамотрицательные бактерии в этиологии внутрибольничных инфекций: клинические, микробиологические и эпидемиологические особенности. Клин микробиол антимикроб химотер 2005; 7(3):271-85.
  • 28. Lu J., Nogi Y., Takami H. Oceanobacillus iheyensis gen. nov., sp. nov., a deep-sea extremely halotolerant and alkaliphilic species isolated from a depth of 1050 m on the Iheya Ridge. FEMS Microbiol Lett 2001; 205(2):291-7.
  • 29. Joss M.J., Koenig J.E., Labbate M., et al. Database ACID: annotation of cassette and integron data. BMC Bioinformatics 2009; 10:118-126 (doi:10.1186/1471- 2105-10-118).
  • 30. Shaver A.C., Sniegowski P.D. Spontaneously arising mutL mutators in evolving Escherichia coli populations are the result of changes in repeat length. J Bacteriol 2003; 185(20):6076-82.
  • 31. Ambler R.P. The structure of b-lactamases. Philos Trans R Soc Lond 1980; B, 289:321-31.
  • 32. Walther-Rasmussen J., Høiby N. Class A carbapenemases. J Antimicrob Chemother 2007; 60:470-82.
  • 33. da Fonseca E.L., Vieira V.V., Cipriano.R., Vicente A.C. Emergence of blaGES-5 in clinical colistin-only-sensitive (COS) Pseudomonas aeruginosa strain in Brazil. J Antimicrob Chemother 2007; 59(3):576-7.
  • 34. Wang C., Cai P., Chang D., Mi Z. A Pseudomonas aeruginosa isolate producing the GES-5 extended-spectrum b-lactamase. J Antimicrob Chemother 2006; 57(6):1261-2.
  • 35. Angelatou F., Litsas S.B., Kontomichalou P. Purification and properties of two gentamicin-modifying enzymes, coded by a single plasmid pPK237 originating from Pseudomonas aeruginosa. J Antibiotics 1982; 35(2):235- 44.
  • 36. Cuttelod M., Senn L., Terlerskiy V., et al. Molecular epidemiology of Pseudomonas aeruginosa in intensive care units over a 10-year period (1998-2007). Clin Microbiol Infect 2011; 17(1):57-62.
  • 37. Blanc D.S., Nahimana I., Petignat C., Wenger A, Bille J, Francioli P. Faucets as a reservoir of endemic Pseudomonas aeruginosa colonization/infections in intensive care units. Intensive Care Med 2004; 30(10):1964-8.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились