Аннотация
В обзоре представлены основные методы культивирования и индикации микробных биоплёнок, распространённые в настоящее время. С методологической точки зрения эти методы можно разделить на две группы: динамические и статические. Каждый метод имеет свои особенности и ограничения, описанные в настоящем обзоре. Кроме распространённых методов выделения, для биоплёнок имеется ряд способов их индикации. Для основных способов выявления биоплёнок проанализированы области их применения. В работе показана необходимость разработки и стандартизации методов выявления способности формирования биоплёнок для внедрения в микробиологическую практику.
-
1.
Гостев В.В., Сидоренко С.В. Бактериальные биопленки и инфекции. Журнал инфектологии 2010; 2(3):4-15.
-
2.
Christensen G.D, Simpson W.A., Younger J.J., et al. Adherence of coagulase-negative staphylococci to plastic tissue culture plates: a quantitative model for the adherence of staphylococci to medical devices. J Clin Microbiology 1985; 22(6):996-1006.
-
3.
Nedelmann M., Krokotsch A., Schwarzkopf A., Heesemann J., Laufs R. Characterization of transposon mutants of biofilm-producing Staphylococcus epidermidis impaired in the accumulative phase of biofilm production: Genetic identification of a hexosamine-containing polysaccharide intracellular adhesion. Infect. Immun 1994; 62:3244-53.
-
4.
O’Toole G., Pratt L., Watnick P., et al. Genetic approaches to study of biofilms. Methods Enzymol 1999; 310:91- 109.
-
5.
Stepanovic S., Vuković D., Jezek P., Pavlović M., SvabicVlahović M. Influence of dynamic conditions on biofilm formation by staphylococci. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2001; 20:502-4.
-
6.
Danhorn R., Hentzer M., Givskov M., Parsek M.R., Fuqua C. Phosphorus limitation enhances biofilm formation of the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens through the PhoR-PhoB regulatory system. J Bacteriol 2004; 186:4492-501.
-
7.
Seker S., et al. The effects of biofilm thickness on biofilm density and substrate consumption rate in a differential fluidizied bed biofilm reactor (DFBBR). J Biotech 1995; 41:39-47.
-
8.
Coenye T., Nelis H.J. In vitro and in vivo model systems to study microbial biofilm formation. J Microbiol Meth 2010; 83:89-105.
-
9.
Hall-Stoodley L., Rayner J., Stoodley P., Lappin-Scott H. Establishment of experimental biofilms using the modified robbins device and flow cells. Meth Biotechn 1999; 12:307-18.
-
10.
Jakobsen T.H. et al. Qualitative and quantitative determination of quorum sensing inhibition in vitro. Quorum sensing: methods and protocols. Methods in Molecular Biology 2011; 692:253-63.
-
11.
Серегина Н.В. и соавт. Обзор биофизических особенностей микробной адгезии. Вестник новых медицинских технологий 2008; XV(3):175-7.
-
12.
Merritt J.H., et al. Growing and analyzing static biofilms. Current Protocols in Microbiology 2011; 1B.1.1-1B.1.18.
-
13.
Camargo, A.C. Pizzolitto, E.L. Biofilm formation on catheters used after cesarean section as observed by scanning electron microscopy. Intern J Gynecol Obst 2005; 90:148-9.
-
14.
Yerly J., et al. A two-step procedure for automatic and accurate segmentation of volumetric CLSM biofilm images. J Microb Meth 2007; 70:424-33.
-
15.
Jagath L., et al. Bioluminescent imaging of bacterial biofilm infections in vivo. Meth Molecul Biol 2008; 431:225- 39.
-
16.
Nistico L. et al. Fluorescence «in situ» hybridization for the detection of biofilm in the middle ear and upper respiratory tract mucosa. Auditory and Vestibular Research: Methods and Protocols 2008; 493:191-213.
-
17.
Struthers J. K. The Use of a continuous culture system to study the antimicrobial susceptibility of bacteria in biofilm. Meth Molecular Med 2000; 48:215-25.