Антибиотикорезистентность | КМАХ

Антибиотикорезистентность

AMRexpert – онлайн-платформа для интерпретации, верификации и валидации результатов определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам

Цель. Рассмотреть ключевые принципы работы и функциональные возможности онлайн-платформы AMRexpert. Материалы и методы. Информационный компонент платформы представлен набором правил, созданных на основе комплекса рекомендаций EUCAST, и различными стандартами для интерпретации результатов определения чувствительности (EUCAST, CLSI версии 2020-2022 гг.). Техническая часть платформы разработана с использованием языка программирования C#, фреймворков Angular и Bootstrap. Для практического представления платформы были проанализированы результаты определения чувствительности к антимикробным препаратам для конкретных изолятов Serratia marcescens, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus saprophyticus, Enterococcus faecium с использованием критериев интерпретации EUCAST v.

Колонизация нестерильных сайтов грамотрицательными бактериями с множественной лекарственной устойчивостью и ее роль в развитии инфекций кровотока у реципиентов аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

Цель. Изучить эпидемиологию колонизации грамотрицательными (Гр-) бактериями с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) у пациентов при проведении аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) и оценить ее влияние на развитие инфекций кровотока. Материалы и методы. В ретроспективное исследование включены 288 пациентов, которым была выполнена первая алло-ТГСК в период с 2018 по 2019 г. в НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачевой. Медиана возраста составила 32 (18–66) года, мужчины – 53% (n = 152). Трансплантация была выполнена в 42% (n = 120) от полностью совместимого неродственного донора, в 26% (n = 75) от гаплоидентичного, в 19% (n = 55) от полностью совместимого родственного донора и в 13% (n = 38) от частично совместимого неродственного донора.

Распространенность мутации A2058G в гене 23S рРНК, определяющей устойчивость к макролидным антибиотикам в российской популяции Treponema pallidum

Цель. Исследовать распространенность мутации A2058G в российской популяции T. pallidum и ее связь с молекулярными субтипами. Материалы и методы. Анализировали ДНК, выделенную из 325 образцов клинического материала, полученного от пациентов лечебно-профилактических учреждений дерматовенерологического профиля 6 федеральных округов России в период с 2014 по 2021 гг. У пациентов был диагностирован первичный сифилис половых органов, первичный сифилис других локализаций или вторичный сифилис кожи и слизистых оболочек. ДНК выделяли с использованием набора реагентов «Проба-НК» (ДНК-технология, Россия) согласно инструкции производителя.

Анализ генов, кодирующих белки семейства MБЛ-подобных металлогидролаз, штамма-деструктора компонентов нефти Pseudomonas putida BS3701

Цель. Определить потенциальную возможность штамма Pseudomonas putida BS3701 быть источником генов устойчивости к бета-лактамным антибиотикам. Материалы и методы. Последовательности 7 генов, аннотированных как «MBL-fold metallohydrolase superfamily», были проанализированы с использованием следующих ресурсов: ResFinder 4.1, ClustalW, IQ-TREE, iTOL. Подбор олигонуклеотидов для проведения ПЦР в реальном времени осуществляли с использованием ресурса Primer-BLAST. Уровень экспрессии генов оценивали с использованием ПЦР в реальном времени. Определение МПК и МБК проводили с использованием цефепима и меропенема.

Распространенность и характеристика БЛРС-продуцирующих штаммов Salmonella enterica, циркулирующих на территории России (2016–2020 гг.)

Цель. Проанализировать частоту встречаемости и определить генетические детерминанты резистентности изолятов нетифоидных сальмонелл (НТС), вырабатывающих бета-лактамазы расширенного спектра (БЛРС), выделенных на территории России в период с 2016 по 2020 г. Материалы и методы. Изоляты сальмонелл, подозрительные на продукцию БЛРС, были отобраны в ходе микробиологического мониторинга на базе Всероссийского референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами. Оценку фенотипической резистентности проводили методом серийных разведений на планшетах G-I и G-II Mikrolatest®SensiLaTest MIC и методом «двойных дисков».

Распространение антимикробной устойчивости среди клинических и пищевых изолятов Listeria monocytogenes, выделенных в Москве в 2019–2021 гг.

Цель. Определить актуальную картину распространения приобретенной устойчивости к антимикробным препаратам среди штаммов L. monocytogenes, связанных со случаями листериоза и контаминирующих продукты питания в г. Москве. Материалы и методы. В работе было использовано 39 штаммов L. monocytogenes, выделенных в Москве в 2019–2021 гг. из клинического материала (n = 24) и продуктов питания (n = 15). Была исследована устойчивость к 12 антибиотикам первой и второй линий защиты. Для определения устойчивости использовали диско-диффузионный метод.

Чувствительность к антибактериальным препаратам нетуберкулезных микобактерий комплекса Mycobacterium avium, выделенных у пациентов Уральского федерального округа

Цель. Проанализировать распределение значений минимальных подавляющих концентраций (МПК) антибактериальных препаратов (АБП) для медленнорастущих нетуберкулезных микобактерий комплекса Mycobacterium avium, выделенных от пациентов Уральского федерального округа. Материалы и методы. Определены МПК 13 АБП для 33 изолятов M. avium и 34 изолятов M. intracellulare, выделенных из клинического материала 67 больных микобактериозом или коинфекцией туберкулеза и микобактериоза в 2018–2021 гг. Определение чувствительности изолятов к 12 АБП (амикацин, стрептомицин, кларитромицин, этамбутол, рифабутин, рифампицин, ципрофлоксацин, этионамид, изониазид, линезолид, моксифлоксацин, доксициклин) проводили на планшетах «SLOMYCO» бактериологической тест-системы Sensititre методом серийных микроразведений.

Mycoplasma genitalium: мониторинг распространения мутаций, связанных с резистентностью к макролидам в России

Цель. Определить спектр и распространенность маркеров резистентности к макролидам у Mycoplasma genitalium в российской популяции пациентов, обратившихся за медицинской помощью в период с 2009 по 2019 г. Материалы и методы. 873 образца ДНК Mycoplasma genitalium из 5 географических регионов России исследовали с помощью разработанной технологии полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, которая позволяет выявлять любые нуклеотидные замены в гене 23S pPHK M. genitalium в позициях 2058, 2059, 2611 (согласно нумерации по E.

Мониторинг мутаций в гене UL97 цитомегаловируса, ассоциированных с резистентностью к ганцикловиру, у детей после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

Цель. Провести генотипирование фосфотрансферазы UL97 цитомегаловируса (ЦМВ) с изучением мутаций, ассоциированных с устойчивостью к ганцикловиру/валганцикловиру (ГЦВ/ ВГЦВ), у детей после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) с подтвержденной ЦМВ-инфекцией. Материалы и методы. В одноцентровое проспективное исследование в период 2020–2021 гг. были включены реципиенты аллогенной ТГСК в возрасте до 18 лет с подтвержденной ЦМВинфекцией, у которых при появлении критериев возможной лекарственной резистентности проводили молекулярно-генетический анализ образцов ДНК ЦМВ. Поиск мутаций резистентности к ГЦВ/ВГЦВ проводили методом секвенирования по Сэнгеру с исследованием участка гена UL97, кодирующего аминокислоты фосфотрансферазы UL97 в пределах 425–670 кодонов.

Опыт внедрения онлайн-платформы AMRcloud для локального мониторинга антибиотикорезистентности в многопрофильном стационаре

Цель. Создать локальную систему мониторинга антибиотикорезистентности с использованием онлайн-платформы AMRcloud для обеспечения доказательного реестра по активности антимикробных препаратов (АМП) и эпидемиологии антимикробной резистентности (АМР). Материалы и методы. Данное исследование выполнено на базе ФГБУ «НМХЦ им. Н.И. Пирогова» Минздрава России (Москва). Исследование носит проспективный характер, с проведением двух оценок локальной системы мониторинга АМР (до и после внедрения онлайн-платформы AMRcloud). Отдельно были оценены эффекты от внедрения платформы AMRcloud и изучены наиболее частые сценарии использования данной системы в стационаре.