ANI | КМАХ

ANI

Анализ таксономической структуры рода Stenotrophomonas на основе геномных данных

Цель. Анализ современной таксономической структуры рода Stenotrophomonas на основе геномных данных с учетом ограничений, связанных с процессом номенклатурной валидации. Материалы и методы. Для формирования референсной базы использовались данные c ресурса LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) и геномы, загруженные из базы данных NCBI. Проводился расчет попарных значений средней нуклеотидной идентичности (ANI) и средней аминокислотной идентичности (AAI). Определение видовой принадлежности осуществлялось с использованием порогового значения ANI ≥ 95%.