серотипирование | КМАХ

серотипирование

Генетическое разнообразие Chlamydia trachomatis на территории России

Цель. Изучить генетическое разнообразие российской популяции Chlamydia trachomatis. Материалы и методы. Проанализировано 42 клинических изолята C. trachomatis, полученных в 2024 г. Проведено MLST-типирование по схеме Uppsala (гены CT058, CT144, CT172, hctB, pbpB) и секвенирование гена ompA для определения серотипов. Результаты. Выявлено 8 серотипов (доминирует E – 50,0%) и 26 сиквенс-типов (ST), включая 8 новых (19,0% изолятов). Преобладающий ST56 (33,3%) отличается от глобальных тенденций (ST3). Обнаружен редкий серотип B (трахома) в урогенитальных образцах, что может свидетельствовать о рекомбинации между биоварами.

Определение серотипов Streptococcus pneumoniae, вызывающих инвазивные и неинвазивные формы инфекций, с использованием высокопроизводительного секвенирования

Цель. Антигенная характеристика полисахарида капсулы штаммов Streptococcus pneumoniae, полученных от больных инвазивными и неинвазивными формами пневмококковой инфекции, циркулирующих на территории России, с использованием высокопроизводительного секвенирования. Материалы и методы. В исследование включено 144 инвазивных и 90 неинвазивных штаммов S. pneumoniae, изолированных в 2002–2023 гг. при проведении Многоцентрового исследования «ПеГАС». Для определения серотипов использовали ПЦР в режиме реального времени и высокопроизводительное секвенирование. ПЦР проводили с использованием методики для определения 16 серотипов. Полногеномное секвенирование осуществлялось на платформе «Illumina».

Современные методы капсульного типирования Streptococcus pneumoniae: возможности и доступность для практической лаборатории

Пневмококковые конъюгированные вакцины содержат ограниченное количество серотипов – специфических антигенов S. pneumoniae. Для мониторинга эффективности программ вакцинопрофилактики важно контролировать уровень разнообразия серотипов циркулирующих …

Чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей города Красноярска

Проведено исследование резистентности к антибактериальным препаратам и серотиповой принадлежности 30 штаммов Streptococcus pneumoniae, выделенных от детей г. Красноярска. Полирезистентные штаммы составили 16,7% и характеризовались резистентностью к …

Идентификация и серотипирование российских штаммов Streptococcus pneumoniae с применением методик, основанных на ПЦР

Основанные на ПЦР методики идентификации и серотипирования Streptococcus pneumoniae оптимизированы для использования в российской эпидемической ситуации. Протестировано 113 штаммов, изолированных в 15 городах РФ от детей …