молекулярное типирование

Цель. Разработка схемы молекулярного типирования Chlamydia trachomatis для проведения молекулярно-эпидемиологического мониторинга данного патогена на территории Российской Федерации. Материалы и методы. В данном исследовании был проанализирован набор консервативных и вспомогательных генов у 430 изолятов C. trachomatis различной географической и филогенетической принадлежности с целью выявления локусов, участвующих во внутривидовой кластеризации патогена. Данные полногеномного секвенирования изолятов в формате FASTA и FASTQ были получены из базы данных PubMLST. Для получения генетических профилей исследуемых изолятов C.

Цель. Исследовать генетические детерминанты устойчивости к антимикробным препаратам, рекомендуемым для терапии сифилиса, с анализом их распространённости у отдельных молекулярных субтипов Treponema pallidum subsp. pallidum, циркулирующих в Российской Федерации в 2014-2017 гг. Материалы и методы. В исследование был включён 161 клинический изолят T. pallidum, полученный из Республики Тыва, Ставропольского края, Иркутской, Калужской, Новосибирской и Омской областей. Присутствие генетического материала T. pallidum подтверждалось методом ПЦР с праймерами к гену polA. Поиск детерминант резистентности к пенициллинам (tromp1, tp47), тетрациклинам (16S рРНК) и макролидам (23S рРНК) проводился по результатам секвенирования перечисленных генов.

За последние годы достигнут качественный прогресс в диагностике и профилактике легионеллеза, основанный на внедрении в практику современных стандартов лабораторной диагностики и количественном мониторинге возбудителя в потенциально опасных объектах …