биоинформатический анализ | КМАХ

биоинформатический анализ

Разработка схемы молекулярного типирования Chlamydia trachomatis на основе анализа высоковариабельных локусов генома

Цель. Разработка схемы молекулярного типирования Chlamydia trachomatis для проведения молекулярно-эпидемиологического мониторинга данного патогена на территории Российской Федерации. Материалы и методы. В данном исследовании был проанализирован набор консервативных и вспомогательных генов у 430 изолятов C. trachomatis различной географической и филогенетической принадлежности с целью выявления локусов, участвующих во внутривидовой кластеризации патогена. Данные полногеномного секвенирования изолятов в формате FASTA и FASTQ были получены из базы данных PubMLST. Для получения генетических профилей исследуемых изолятов C.