бактериоцины | КМАХ

бактериоцины

Полногеномный анализ пробиотического штамма Lactocaseibacillus – идентификация генетических детерминант продукции бактериоцинов как основа для стандартизации моно- и поликомпонентных пробиотиков

Цель. Проведение полногеномного исследования и биоинформационного анализа штамма Lacticaseibacillus для подтверждения таксономической принадлежности, идентификации генетических детерминант метаболической активности, стрессоустойчивости и продукции бактериоцинов как критерия стандартизации моно- и поликомпонентных пробиотиков. Материалы и методы. Объектом исследования являлся штамм, выделенный от пациента колопроктологического профиля в 2024 г. Культивирование проводилось на среде MRS в микроаэрофильных условиях. Полногеномное секвенирование выполнено на платформе Oxford Nanopore Technologies MinION (ячейки R10.4.1). Сборка генома de novo осуществлена в Flye, оценка качества – QUAST.