Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий, выделенных у пациентов ФГБУ «НМИЦ ФПИ» Минздрава России в «доковидный» период и во время пандемии COVID-19 | КМАХ

Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий, выделенных у пациентов ФГБУ «НМИЦ ФПИ» Минздрава России в «доковидный» период и во время пандемии COVID-19

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):411-416

​ Васильева И.А., Панова А.Е., Грачева А.Н., Байракова А.Л., Казюлина А.А., Елисеев П.И., Самойлова А.Г.
10.36488/cmac.2024.4.411-416
нетуберкулезные микобактерии микобактериоз Mycobacterium
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(4):411-416

Цель.

Сравнить видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий (НТМБ), выделенных у пациентов фтизиопульмонологических учреждений в 2018–2019 гг. («доковидный» период) и в 2020– 2023 гг. (период пандемии COVID-19).

Материалы и методы.

Проведена идентификация 937 клинических изолятов НТМБ, выделенных от пациентов, проходивших дифференциальную диагностику туберкулеза и других заболеваний органов дыхания в ФГБУ «НМИЦ ФПИ» Минздрава России и в других фтизиопульмонологических учреждениях субъектов Российской Федерации в 2018–2019 гг. («доковидный» период, n = 217) и в 2020–2023 гг. (во время пандемии COVID-19, n = 720).

Результаты.

Установлено, что в период пандемии COVID-19 чаще, чем до пандемии встречались быстрорастущие НТМБ (12,64% против 6,91%, p = 0,0268), медленнорастущие НТМБ в период пандемии стали встречаться реже (87,36% против 93,09%, р = 0,0268). Среди медленнорастущих превалирующими видами были M. avium, М. chimaera/intracellulare (Mycobacterium avium complex) и M. kansasii (Mycobacterium kansasii complex). В период пандемии COVID-19 было обнаружено значительно больше видов НТМБ:16 видов медленнорастущих (M. celatum, M. colombiense, M. marselience, M. timonense, M. engbaekii, M. heraklionense, M. nonchromogenicum, M. europaeum, M. mantenii, M. nebraskense, M. branderi, M. conspicuum, M. saskatchewanense, M. scrofulaceum, M. heckeshornense, M. szulgai) и 15 видов быстрорастущих (M. chelonae, M. immunogenum, M. salmoniphilum, M. porcinum, M. senegalense, M. septicum, M. mageritense, M. mucogenicum, M. neoaurum, M. murale/tokaiense, M. arabiense, M. asiaticum, M. chubuense, M. novocastrense, M. stephanolepidis).

Выводы.

В данном исследовании мы показали отличия видового разнообразия НТМБ в 2018– 2019 гг. (в «доковидный» период) и в 2020–2023 гг. (во время пандемии COVID-19). Необходимо проведение дополнительных исследований для оценки влияния пандемии COVID-19 на частоту выделения и видовое разнообразие НТМБ, а также их ассоциацию с микобактериозами, диагностированными у соответствующих пациентов-бактериовыделителей.

Ирина Анатольевна Васильева

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Панова А.Е.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Грачева А.Н.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Байракова А.Л.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Казюлина А.А.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Елисеев П.И.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

Самойлова А.Г.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний» Минздрава России, Москва, Россия

  • 1. Parte A.C., Sardà Carbasse J., Meier-Kolthoff J.P., Reimer L.C., Göker M. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ. Int J Syst Evol Microbiol. 2020;70:5607-5612. DOI: 10.1099/ijsem.0.004332
  • 2. Zimina V.N., Degtyareva S.Yu., Beloborodova E.N., Kulabukhova E. I., Rusakova L.I., Fesenko O.V. Mycobacterioses: current state of the problem. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2017; 19(4):276-282. Russian. (Зимина В.Н., Дегтярёва С.Ю., Белобородова Е.Н., Кулабухова Е.И., Русакова Л.И., Фесенко О.В. Микобактериозы: современное состояние проблемы. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(4):276-282.)
  • 3. Daley C.L., Iaccarino J.M., Lange C., Cambau E., Wallace R.J., Jr., Andrejak C., et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: an official ATS/ERS/ESCMID/IDSA clinical practice guideline. Clin Infect Dis. 2020;71(4):e1-e36. DOI: 10.1093/cid/ciaa241
  • 4. Bryant J.M., Grogono D.M., Greaves D., Foweraker J., Roddick I., Inns T., et al. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013;381(9877):1551-1560. DOI: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7
  • 5. Veselova E.I., Presnyakova O.A., Tinkova V.V., Beloborodova E.N. Etiology of lung lesions in patients with HIV infection at stage 4B. Infectious diseases in the modern world: evolution, current and future threats: materials of the XVI Annual All-Russian congress on infectious diseases named after. acad. V.I. Pokrovsky. M., 2024. P. 47. Russian. (Веселова Е.И., Преснякова О.А., Тинькова В.В., Белобородова Е.Н. Этиология поражений легких у больных ВИЧ-инфекцией на стадии 4В. Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы: материалы XVI ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням им. акад. В.И. Покровского. М., 2024. С. 47)
  • 6. Parolina L., Pshenichnaya N., Vasilyeva I., Lizinfed I., Urushadze N., Guseva V., et al. Clinical characteristics of COVID-19 in patients with tuberculosis and factors associated with the disease severity. Int J Infect Dis. 2022;124(Suppl. 1):82-89. DOI: 10.1016/j.ijid.2022.04.041
  • 7. TB/COVID-19 Global Study Group. Tuberculosis and COVID-19 co-infection: description of the global cohort. Eur Respir J. 2022;59(3):2102538. DOI: 10.1183/13993003.02538-2021
  • 8. Petrov I.V., Amirova T.Kh., Petrova L.V., Petrova F.S., Sevastyanova E.V., Valiev R.I. Microbiological and epidemiological features of mycobacteriosis. Epidemiology and vaccinal prevention. 2020;19(3):89-94. Russian. (Петров И.В., Амирова Т.Х., Петрова Л.В., Петрова Ф.С., Севастьянова Э.В., Валиев Р.И. Микробиологические и эпидемиологические особенности микобактериозов. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2020;19(3):89-94.) DOI: 10.31631/2073-3046-2020-19-3-89-94
  • 9. Starkova D.A., Zhuravlev V.Yu., Vyazovaya A.A., Solovieva N.S., Kulikova O.N., Narvskaya O.V. Species diversity of non-tuberculous mycobacteria in patients with mycobacteriosis in the North-Western Federal District of Russia. Tuberculosis and Lung Diseases. 2019;97(6):16-22. Russian. (Старкова Д.А., Журавлев В.Ю., Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Куликова О.Н., Нарвская О.В. Видовое разнообразие нетуберкулезных микобактерий у больных микобактериозом на территориях Северо-Западного федерального округа России. Туберкулез и болезни легких. 2019;97(6):16-22.) DOI: 10.21292/2075-1230-2019-97-6-16-22
  • 10. Panteleev A.M., Dracheva M.S., Nikulina O.V., Sokolova O.S., Zonova A.V. Clinical and laboratory features of atypical mycobacteriosis in HIV-patients. Journal infectology. 2016;8(3):40-45. Russian. (Пантелеев А.М., Драчева М.С., Никулина О.В., Соколова О.С., Зонова А.В. Клинико-лабораторные особенности микобактериоза у больных вич-инфекцией. Журнал инфектологии. 2016;8(3):40-45.)
  • 11. Panteleev A.M., Nikulina O.V., Khristusev A.S., Dracheva M.S., Sokolova O.S., Zonova A.V. Differential diagnostics of tuberculosis and mycobacteriosis in HIV patients. Tuberculosis and lung diseases. 2017;95(10):47-52. Russian. (Пантелеев А.М., Никулина О.В., Христусев А.С., Драчева М.С., Соколова О.С., Зонова А.В. Дифференциальная диагностика туберкулеза и микобактериоза у больных вич-инфекцией. Туберкулез и болезни легких. 2017;95(10):47-52.) DOI: 10.21292/2075-1230-2017-95-10-47-52
  • 12. Fomenkova N.V., Leonova O.N., Vinogradova T.N., Otten T.F. Atypical mycobacteriosis is an opportunistic disease in patients with HIV infection. Medical-biological and socio-psychological problems of safety in emergency situations. 2011;(3):52-57. Russian. (Фоменкова Н.В., Леонова О.Н., Виноградова Т.Н., Оттен Т.Ф. Атипичный микобактериоз-оппортунистическое заболевание у больных с ВИЧ-инфекцией. Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях. 2011;(3):52-57.)
  • 13. Steens A., Knol M.J., Freudenburg-de Graaf W., de Melker H.E., van der Ende A., van Sorge N.M. Pathogenand type-specific changes in invasive bacterial disease epidemiology during the first year of the COVID-19 pandemic in the Netherlands. Microorganisms. 2022;10(5):972. DOI: 10.3390/microorganisms10050972
  • 14. Stefanini I., De Renz, G., Foddai E., Cordani E., Mognetti B. Profile of bacterial infections in COVID-19 patients: antimicrobial resistance in the time of SARS-CoV-2. Biology. 2021;10(9):822. DOI: 10.3390/biology10090822
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились