Типирование MRSA: какие методы являются оптимальными для решения различных задач?

Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2011; 13(2):168-176

​ Романов А.В., Дехнич А.В.
MRSA молекулярные методы типирования SCCmec MLVA MLST spa-типирование
Раздел
Микробиологическая диагностика
Тип
Журнальная статья
Публикация
Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2011; 13(2):168-176

Аннотация

В последние десятилетия наблюдается неуклонный рост распространённости метициллино­резистентных золотистых стафилококков (MRSA). Вызванные ими инфекции характеризуются высокой летальностью и стоимостью лечения, в то время как новые антибактериальные препараты (анти-MRSA цефемы, новые гликопептиды, липопептиды, глицилциклины и др.) только начинают внедряться в клиническую практику. В этой ситуации особое значение имеет контроль за распространением MRSA. В настоящее время с этой целью широко применяются молекулярно-генетические методы типирования, которые приходят на смену фенотипическим методам сравнения микроорганизмов. В статье приведены данные о наиболее распространённых методах молекулярного типирования MRSA и областях их применения. Оптимальным, с нашей точки зрения, для изучения локальной эпидемиологии MRSA является использование комбинации методов анализа множественных тандемных повторов (MLVA) и SCCmec типирования, либо применение пульс-электрофореза макрорестрикционных фрагментов геномной ДНК (PFGE). Для изучения глобальной эпидемиологии и популяционной структуры могут быть рекомендованы такие методы как мультилокусное секвенирование-типирование (MLST) и spa-секвенирование-типирование, которые обеспечивают высокий уровень стандартизации исследования и возможность эффективного обмена данными между лабораториями во всём мире.

  • 1. Dekhnich A., Nikulin A., Ivanchik N., Kretchikova O., Kozlov R.. Susceptibility of Staphylococcus aureus nosocomial isolates in Russia: five-year trends. Abstracts of the 19th ECCMID, Helsinki, Finland, 1619 May 2009, Poster №1076.
  • 2. Feil E.J., and M. C. Enright. Analyses of clonality and the evolution of bacterial pathogens. Curr Opin Microbiol 2004; 7:308–13.
  • 3. van Belkum A, Tassios P.T, Dijkshoorn L, et al. Guidelines for the validation and application of typing methods for use in bacterial epidemiology. Clin Microbiol Infect 2007; 13(Suppl 3):1-46.
  • 4. Prévost G., Pottecher B., Dahlet M., Bientz M., Mantz J.M., Piémont Y. Pulsed field gel electrophoresis as a new epidemiological tool for monitoring methicillin-resistant Staphylococcus aureus in an intensive care unit. J Hosp Infect 1991; 17(4):255-69.
  • 5. Tenover F.C., Arbeit R.D., Goehring R.V., e.a. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing. J Clin Microbiol 1994; 33:2233–9. 4. Anderson E.S, Williams R.E. Bacteriophage typing of enteric pathogens and staphylococci and its use in epidemiology. J Clin Pathol 1956; 9(2):94-127. 5. Trindade P.A., McCulloch J.A., Oliveira G.A., Mamizuka E.M. Molecular techniques for MRSA typing: current issues and perspectives. Braz J Infect Dis 2003; 7(1):32- 43.
  • 6. Enright M.C., Day N.P., Davies C.E., Peacock S.J., Spratt B.G. Multilocus sequence typing for characterization of methicillin-resistant and methicillin-susceptible clones of Staphylococcus aureus. J Clin Microbiol 2000; 38(3):1008- 15.
  • 7. Sabat A., Krzyszton-Russjan J., Strzalka W., e.a. New method for typing Staphylococcus aureus strains: multiple-locus variable-number tandem repeat analysis of polymorphism and genetic relationships of clinical isolates. J Clin Microbiol 2003; 41(4):1801-4.
  • 8. Hardy K.J., Ussery D.W., Oppenheim B.A., Hawkey P.M. Distribution and characterization of staphylococcal interspersed repeat units (SIRUs) and potential use for strain differentiation. Microbiol 2004; 150:4045-52.
  • 9. Ikawaty R., Willems R.J., Box A.T., Verhoef J., Fluit A.C. Novel multiple-locus variable-number tandemrepeat analysis method for rapid molecular typing of human Staphylococcus aureus. J Clin Microbiol 2008; 46(9):3147-51.
  • 10. Frénay H.M., Bunschoten A.E., Schouls L.M., e.a. Molecular typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus on the basis of protein A gene polymorphism. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1996; 15(1):60-4.
  • 11. Chen L., Mediavilla J.R., Oliveira D.C., Willey B.M., de Lencastre H., Kreiswirth B.N. Multiplex real-time PCR for rapid Staphylococcal cassette chromosome mec typing. J Clin Microbiol 2009; 47(11):3692-706.
  • 12. Oliveira D.C., de Lencastre H. Multiplex PCR strategy for rapid identification of structural types and variants of the mec element in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46(7):2155- 61.
  • 13. Milheiriço C., Oliveira D.C., de Lencastre H. Update to the multiplex PCR strategy for assignment of mec element types in Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51(9):3374-7.
  • 14. Kondo Y., Ito T., Ma X.X., e.a. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51:264–74.
  • 15. Lu P.L., Chang J.C., Hsu H.T., e.a. One tube multiplex PCR for simple screening of SCCmec I-V types of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. J Chemother 2008; 20(6):690-6.
  • 16. Valvatne H., Rijnders M.I., Budimir A., e.a. A rapid, 2- well, multiplex real-time polymerase chain reaction assay for the detection of SCCmec types I to V in methicillinresistant Staphylococcus aureus. Diagn Microbiol Infect Dis 2009; 65(4):384-91.
  • 17. Wisplinghoff H., Rosato A.E., Enright M.C., et al. Related clones containing SCCmec type IV predominate among clinically significant Staphylococcus epidermidis isolates. Antimicrob Agent Chemother 2003; 47:3574–79.
  • 18. Miragaia M., Couto I., de Lencastre H. Genetic diversity among methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE). Microb Drug Resist 2005; 11:83–93.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились