Генетическая характеристика московских штаммов Neisseria meningitidis | КМАХ

Генетическая характеристика московских штаммов Neisseria meningitidis

Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2011; 13(2):135-148

​ Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Тагаченкова Т.А., Браславская С.И., Шипулин Г.А.
Neisseria meningitidis московские штаммы генетическая характеристика
Раздел
Болезни и возбудители
Тип
Журнальная статья
Публикация
Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2011; 13(2):135-148

Аннотация

В работе представлена генетическая характеристика бактерий вида Neisseria meningitidis, циркулировавших на территории Москвы в 2001–2010 гг. Использован метод мультилокусного секвенирования-типирования в соответствии с международными требованиями. Проведён ретроспективный анализ генетических особенностей эпидемических штаммов менингококков серогруппы А, выделяемых в разные годы; с помощью базы данных http://pubmlst.org/neisseria/ результаты сопоставлены с данными о штаммах, циркулирующих за рубежом. Выявлены генетические особенности штаммов, циркулирующих на территории Москвы, и проведён комплексный анализ генетического и антигенного разнообразия штаммов эпидемически значимых серогрупп. Продемонстрирована роль молекулярно-биологических методов типирования в комплексном микробиологическом мониторинге штаммов N. meningitidis.

  • 1. Костюкова Н.Н., Бехало В.А. Менингококковая вакцинация и носительство. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2010; 6:67-72.
  • 2. Костюкова Н.Н., Бехало В.А. Менингококковое носительство: загадки и разгадки. Эпидемиология и инфекционные болезни 2010; 1:30-4.
  • 3. Покровский В.И., Фаворова Л.А., Костюкова Н.Н. Ме­нингококковая инфекция. М.: Медицина, 1976. 275 с.
  • 4. Meningococcal disease. Cartwright K. (ed). John Wiley & Sons Ltd, 1995. 316 p.
  • 5. Meningococcal disease: methods and protocols. Pollard A.J., Maiden M.C.J. (eds). Humana Press, 2001. 721 p.
  • 6. Achtman M., van der Ende A., Zhu P., et al. Molecular epidemiology of serogroup A meningitis in Moscow, 1969 to 199
  • 7. Emerg Infect Dis 2001; 7 (3):420-7. 7. Maiden M.C., Bygraves J.A., Feil E. et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95:3140-5.
  • 8. Bart A., Dankert J., van der Ende A. Antigenic variation of the class I outer membrane protein in hyperendemic Neisseria meningitidis strains in the Netherlands. Infect Immun 1999, 67(8):3842-6.
  • 9. Derrick J.P., Urwin R., Suker J., et al. Structural and evolutionary inference from molecular variation in Neisseria porins. Infect Immun 1999, 67(5):2406-13.
  • 10. Feavers I.M., Fox A.J., Gray S., et al. Antigenic diversity of meningococcal outer membrane protein PorA has implications for epidemiological analysis and vaccine design. Clin Diagn Lab Immunol 1996, 3 (4):444-50.
  • 11. Thompson E.A., Feavers I.M., Maiden M.C. Antigenic diver­sity of meningococcal enterobactin receptor FetA, a vaccine component. Microbiology 2003, 149(Pt. 7):1849- 58.
  • 12. Платонов А.Е., Харит С.М., Платонова О.В. Вакцинопрофилактика менингококковой инфекции в мире и в России. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2009, 5:32-46.
  • 13. Koroleva I.S., Platonov A.E., van Der Ende A., et al. Characteristics of pathogenic Neisseria meningitidis in Moscow: prevalence of ‚non-European‘ strains. Clin Microbiol Infect 1998, 4(3):123-8.
  • 14. Fox A.J., Taha M.K., Vogel U. Standardized nonculture techniques recommended for European reference laboratories. FEMS Microbiol Rev 2007, 31 (1):84-8.
  • 15. Jolley K.A., Brehony C., Maiden M.C. Molecular typing of meningococci: recommendations for target choice and nomenclature. FEMS Microbiol Rev 2007, 31(1):89-96.
  • 16. Sacchi C.T., Lemos A.P., Brandt M.E., et al. Proposed standardization of Neisseria meningitidis PorA variableregion typing nomenclature. Clin Diagn Lab Immunol 1998, 5(6):845-55.
  • 17. Jolley K.A., Chan M.S., Maiden M.C. mlstdbNet – distributed multi-locus sequence typing (MLST) databases. BMC Bioinformatics 2004, 5:86.
  • 18. Jolley K.A., Maiden M.C. BIGSdb: Scalable analysis of bacterial genome variation at the population level. BMC Bioinformatics 2010; 11:595.
  • 19. Taha M.K., Fox A. Quality assessed nonculture techniques for detection and typing of meningococci. FEMS Microbiol Rev 2007, 31(1):37-42.
  • 20. Миронов К.О., Шипулин Г.А., Королева И.С., Платонов А.Е. Генотипирование Neisseria meningitidis. Эпидемиология и инфекционные болезни 2009, 4:18-21.
  • 21. Bart A., Schuurman I.G.A., Achtman M., et al. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) genotyping of serogroup A meningococci yields similar results to multilocus enzyme electrophoresis (MEE) and reveals new genotypes. J Clin Microbiol 1998, 36(6):1746-9.
  • 22. Feil E.J., Maiden M.C., Achtman M., et al. The relative contributions of recombination and mutation to the divergence of clones of Neisseria meningitidis. Mol Biol Evol 1999, 16(11):1496-502.
  • 23. Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Платонова О.В. Мультилокусное секвенирование – новый метод генотипирования бактерий и первые результаты его применения. Генетика 2000, 36(5):597-605.
  • 24. Платонов А.Е., Миронов К.О., Яцышина С.Б. и др. Характеристика московских штаммов Haemophilus influenzae типа b методом мультилокусного секвени рованиятипирования. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 2003, 2:21-5.
  • 25. Holmes E.C., Urwin R., Maiden M.C. The influence of recombination on the population structure and evolution of the human pathogen Neisseria meningitidis. Mol Biol Evol 1999, 16(6):741-9.
  • 26. Brehony C., Jolley K.A., Maiden M.C. Multilocus sequence typing for global surveillance of meningococcal disease. FEMS Microbiol Rev 2007, 31(1):15-26.
  • 27. Jolley K.A., Feil E.J., Chan M.S., et al. Sequence type analysis and recombinational tests (START). Bioinformatics 2001, 17(12):1230-1.
  • 28. Миронов К.О., Тагаченкова Т.А., Королева И.С. и др. Генетическая характеристика штаммов Neisseria meningitidis, выделенных от здоровых носителей в очагах менингококковой инфекции. Журн микробиол 2011, 2:22-9.
  • 29. Тагаченкова Т.А., Королева И.С., Миронов К.О. и др. Менингококковое носительство в очагах менингококковой инфекции. Эпидемиология и инфекционные болезни 2009, 4:6-10.
  • 30. Королева И.С., Белошицкий Г.В. Менингококковая инфекция и гнойные бактериальные менингиты: руководство по лабораторной диагностике. Медицинское информационное агентство, 2007. 112 с.
  • 31. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Анализ московской популяции Neisseria meningitidis методом мультилокусного секвенировани ятипирования. Журн. микробиол 2006, 2:31-6.
  • 32. Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Королева И.С. и др. Перспективы диагностики бактериальных менингитов. Журн микробиол 1999, 2:71-6.
  • 33. Платонов А.Е., Королева И.С., Платонова О.В. и др. Заболеваемость гнойными менингитами у детей в возрасте до 5 лет в Москве. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2006, 4:36-43.
  • 34. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., и др. Мониторинг бактерий вида Neisseria meningitidis на основании последовательностей вариабельных фрагментов поверхностных белков FetA и PorA. Журн микробиол 2009, 3:23-7.
  • 35. Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулин Г.А. и др. Генетическое субтипирование Neisseria meningitidis. Эпидемиология и инфекционные болезни 2005, 3:23-8.
  • 36. Feil E.J., Li B.C., Aanensen D.M., et al. eBURST: Inferring patterns of evolutionary descent among clusters of related bacterial genotypes from multilocus sequence typing data. J Bacteriol 2004, 186(5):1518-30.
  • 37. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С. и др. Генетические субгруппы бактерий Neisseria meningitidis серогруппы А, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Москвы в 19692006 гг. Журн микробиол 2008, 1:7-12.
  • 38. Zhu P., van der Ende A., Falush D., et al. Fit genotypes and escape variants of subgroup III Neisseria meningitidis during three pandemics of epidemic meningitis. Proc Natl Acad Sci USA 2001, 98(9):5234-9.
  • 39. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. J Clin Microbiol 1988, 26:2465-6.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились