<?xml version="1.0" encoding="utf-8" standalone="yes" ?>
<rss version="2.0" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom">
  <channel>
    <title>КМАХ 2026; 28(1) on КМАХ</title>
    <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/</link>
    <description>Recent content in КМАХ 2026; 28(1) on КМАХ</description>
    <generator>Source Themes Academic (https://sourcethemes.com/academic/)</generator>
    <language>ru-ru</language>
    <lastBuildDate>Thu, 28 May 2026 10:18:27 +0000</lastBuildDate>
    
	    <atom:link href="http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/index.xml" rel="self" type="application/rss+xml" />
    
    
    <item>
      <title>Антимутантная активность комбинации колистина и рифаксимина при селективной деконтаминации кишечника: валидация в динамической проточной системе</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p131/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:50:08 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p131/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Введение. Селективная деконтаминация кишечника (СДК) нерезорбируемыми антибиотиками рассматривается как перспективный подход к снижению риска инфекций у критически больных пациентов. Однако широкая циркуляция мультирезистентных микроорганизмов, включая карбапенеморезистентные &lt;em&gt;Klebsiella pneumoniae&lt;/em&gt; и &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt;, существенно снижает эффективность традиционных режимов СДК на основе монотерапии колистином. Ключевой причиной неудач является широкое «окно селекции мутантов» – диапазон концентраций антибиотика, недостаточных для подавления роста резистентных субпопуляций. Использование антимутантных комбинаций нерезорбируемых антибиотиков может открыть новые перспективы для оптимизации СДК. Разработка и валидация динамической проточной системы &lt;em&gt;in vitro&lt;/em&gt; для фармакокинетического/фармакодинамического (ФК/ФД) моделирования клинических режимов СДК и оценка антимутантной активности комбинации нерезорбируемых антибиотиков колистина и рифаксимина в отношении экстремально-антибиотикорезистентных штаммов &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt; и &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;В исследование включены 10 клинических изолятов &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt; (продуценты NDM, KPC, OXA-48, KPC+NDM) и 10 клинических изолятов &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; (в том числе 4 продуцента карбапенемазы VIM). Культуральным методом на плотных питательных средах с антибиотиком определены минимальные концентрации колистина и рифаксимина, предотвращающие селекцию резистентных мутантов (МПКМ). Сконструирована однокамерная проточная система, воспроизводящая фармакокинетику нерезорбируемых антибиотиков при энтеральном введении. Моделировались клинические режимы введения колистина, рифаксимина и их комбинации (каждые 8 ч. в течение 7 суток).&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;МПКМ колистина для штаммов &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt; составляли 64–128 мг/л, для &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; – 8–16 мг/л, что соответственно в 8–256 и 4–16 раз превышало МПК. МПКМ рифаксимина не удалось определить в пределах тестируемых концентраций для подавляющего большинства штаммов (МПКМ ≥ 256 мг/л). В присутствии рифаксимина МПКМ колистина снижалась в 4–8 раз для &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt; и в 2–8 раз для &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;. В статическом эксперименте колистин (70 мг/л) и рифаксимин (200 мг/л) не предотвращали прорывного роста части штаммов в течение 24–48 ч., тогда как комбинация полностью подавляла рост всех штаммов на протяжении 7 суток. В динамической проточной системе при монотерапии наблюдалась адаптация части микроорганизмов к колистину и рифаксимину, комбинация колистина и рифаксимина обеспечивала полное подавление роста всех тестируемых штаммов на протяжении всего 7-суточного периода наблюдения.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Разработанная динамическая проточная система является удобным инструментом для доклинической оценки ФК/ФД параметров антимутантных комбинаций нерезорбируемых антибиотиков. Комбинация колистина и рифаксимина демонстрирует высокую антимутантную активность в условиях, моделирующих режимы СДК, в отношении как &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt;, так и &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;, что открывает перспективы ее клинического применения в регионах с высокой распространенностью антибиотикорезистентных возбудителей.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Микробиом нижних дыхательных путей у пациентов с туберкулезом легких и ВИЧ-инфекцией</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p124/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:47:54 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p124/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Изучить спектр бактериальной и грибковой микробиоты нижних дыхательных путей у больных туберкулезом с ВИЧ-инфекцией, находившихся на стационарном лечении.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Всего выполнено 378 микробиологических исследований мокроты от 147 пациентов ФГБУ «ННИИТ» Минздрава России (2021–2024 гг.). Образцы мокроты собирали в соответствии со стандартизированными протоколами, направленными на минимизацию контаминации микробиотой верхних дыхательных путей и обеспечение репрезентативности материала из нижних отделов респираторного тракта. Биоматериал исследовали на селективных питательных средах. Микроорганизмы идентифицировали методом MALDI-tof с помощью масс-спектрометра Microflex (Bruker Daltonics, Германия). Статистическую обработку данных проводили с использованием программного обеспечения SPSS 19.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Дифференцировали изоляты из нижних отделов респираторного тракта от возможных микроорганизмов-контаминантов путем сравнительного анализа парных образцов (из ротоглотки (зева) и мокроты) с количественной оценкой КОЕ/мл в соответствии с общепринятыми клиническими критериями и поправкой на ВИЧ-инфекцию. Всего выделено 492 патогенных и условно-патогенных микроорганизма, которые принадлежали к 15-ти семействам. Представители грибковой микробиоты составили 44,9%, среди них преобладало семейство Saccharomycetaceae вид &lt;em&gt;C. albicans&lt;/em&gt;, бактерии составили 55,1% (&lt;em&gt;Enterobacteriaceae&lt;/em&gt; – 21,5%, Staphylococcaceae – 9,96%, Pasteurellaceae – 8,94%, Pseudomonadaceae – 5,69%). Спектр микроорганизмов менялся в зависимости от клинических форм туберкулеза и типа лекарственной устойчивости микобактерий.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Микробиом нижних дыхательных путей у пациентов с активным туберкулезом и коинфекцией ВИЧ характеризуется серьезным дисбиозом, в котором преобладают представители грибковой микробиоты и грамотрицательные факультативные анаэробы. Это может быть связано с профилем лекарственной устойчивости микобактерий, длительностью заболевания, проведением полихимиотерапии и иммуносупрессивным действием ВИЧ, что подчеркивает необходимость комплексного подхода к диагностике и лечению больных с сочетанной патологией легочного туберкулеза и ВИЧ-инфекции.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Иммуногенетические предикторы тяжелого течения сепсиса: роль функциональных полиморфизмов</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p108/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:45:55 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p108/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Выявить ассоциации функциональных полиморфизмов генов иммунной, эндотелиальной и коагуляционной систем с тяжестью течения и исходами сепсиса для обоснования генетических предикторов риска.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;В одноцентровое проспективное исследование включено 124 пациента онкогематологического профиля в возрасте от 1 мес. до 28 лет, у которых зарегистрировано 152 эпизода сепсиса. Генотипирование 20 полиморфных вариантов в 16 генах проведено методом капиллярного секвенирования по Сэнгеру. Статистическая обработка включала оценку соответствия распределения генотипов равновесию Харди – Вайнберга, сравнение частот по доминантной модели наследования с расчетом отношения шансов (OR), критерия χ² с поправкой Йейтса и определение двустороннего уровня значимости p.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Наиболее значимый предиктор неблагоприятного течения – полиморфизм -2518A&amp;gt; G гена MCP1, ассоциированный с тяжелым острым почечным повреждением (ОПП) (OR = 3,30; p = 0,001), потребностью в почечно-заместительной терапии (OR = 5,4; p &amp;lt; 0,0001), ИВЛ (p = 0,019) и летальностью (OR = 2,4; p = 0,02). Полиморфизм c.665C &amp;gt; T гена MTHFR связан с сепсис-индуцированной коагулопатией (OR = 2,0; p = 0,049), ДВС-синдромом (OR = 2,9; p = 0,003) и провоспалительным ССВО-фенотипом (OR = 2,17; p = 0,04). Для полиморфизмов гена HAVCR1 выявлена двойственная роль: c.619A&amp;gt; G – протективный при септическом шоке (OR = 0,42; p = 0,02) и ОПП (OR = 0,34; p = 0,007); c.536T &amp;gt; C – ассоциирован с летальностью (OR = 3,7; p = 0,02). Разнонаправленные эффекты полиморфизмов гена IL18: -607C &amp;gt;A – риск почечно-заместительной терапии (OR = 3,3; p = 0,008) и ИВЛ (OR = 2,4; p = 0,009); -137G &amp;gt; C – защита при этих осложнениях (OR = 0,46 и 0,32 соответственно). Установлена контекст-зависимость полиморфизма -308G &amp;gt;A гена TNFα: ассоциирован с коагулопатией (OR = 4,10; p = 0,02) и протективный для хронического критического состояния (OR = 0,18; p = 0,001). Полиморфизмы генов TLR4 (c.296A&amp;gt; G, c.596C &amp;gt; T) и IL18 (-137G &amp;gt; C) ассоциированы с риском рецидивов сепсиса (OR = 4,0; p = 0,03). Вариант c.*1205G &amp;gt;A гена TLR4 связан с септическим шоком (OR = 2,2; p = 0,04). Вариант 4G/5G гена PAI-1 ассоциирован с тяжестью ОПП (OR = 2,62; p = 0,009), а протективный аллельный вариант c.-159C &amp;gt; T гена CD14 – со снижением риска хронического критического состояния (OR = 0,36; p = 0,0054).&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Полученные результаты обосновывают целесообразность генетического тестирования для стратификации риска и персонализации интенсивной терапии у пациентов с сепсисом и сопутствующей онкогематологической патологией.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Мониторинг этиологической структуры внебольничных инфекций мочевых путей и антибиотикорезистентности ведущего уропатогена – *Escherichia coli* у детей и подростков в Красноярском крае</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p103/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:43:50 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p103/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Изучить структуру возбудителей внебольничной инфекции мочевых путей (ИМП) у детского и подросткового населения Красноярского края, а также активность антимикробных препаратов в отношении лидирующего возбудителя с целью оптимизации локальной эмпирической терапии ИМП.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Проанализированы 298 бактериальных изолятов (164 – в 2023 г. и 134 – в 2024 г.), полученных при бактериологическом исследовании мочи детей и подростков с установленным диагнозом внебольничной ИМП, обратившихся в КГБУЗ «Красноярский краевой клинический центр охраны материнства и детства». Использован метод сплошной выборки и ретроспективный анализ.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Ведущим возбудителем внебольничной ИМП в Красноярском крае является &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt;, на 2-3 месте находятся &lt;em&gt;Klebsiella pneumoniae&lt;/em&gt; и &lt;em&gt;Enterococcus&lt;/em&gt; spp. Из парентеральных препаратов резистентость &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; отсутствовала к меропенему, наибольшая чувствительность &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; отмечена к ампициллину-сульбактаму и амикацину. Зафиксирована устойчивость &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; выше 20% к цефепиму, цефалоспоринам 3 поколения, амоксициллину-клавуланату и ко-тримоксазолу. Среди пероральных препаратов в Красноярском крае в отношении &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; сохранена активность фосфомицина и нитрофурантоина.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Согласно данным по резистентности &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; в Красноярском крае в качестве стартовых препаратов для лечения внебольничной ИМП у детей и подростков рассматриваются: ампициллин-сульбактам для парентерального введения, фосфомицин и нитрофурантоин для пероральной терапии. Цефалоспорины 3 поколения и амоксициллин-клавуланат не могут быть рекомендованы в качестве стартовой терапии в связи с выявленным уровнем резистентности, превышающим 20%-ый порог.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Роль мониторинга применения системных антимикробных препаратов в профилактике селекции лекарственной устойчивости</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p92/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:41:16 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p92/</guid>
      <description></description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Методы машинного обучения в прогнозировании антибиотикорезистентности</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p81/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:39:07 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p81/</guid>
      <description></description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Исследования фармакокинетики и фармакодинамики линезолида у недоношенных новорожденных</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p72/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:35:41 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p72/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Изучение фармакокинетики (ФК) и разработка фармакокинетической/ фармакодинамической (ФК/ФД) модели линезолида для недоношенных новорожденных по данным терапевтического лекарственного мониторинга (ТЛМ).&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;В ФК/ФД анализ были включены данные терапевтического лекарственного мониторинга (ТЛМ) 24 недоношенных новорожденных, с учетом повторного проведения процедуры ТЛМ – всего 27 процедур и 54 измерения концентрации линезолида. Пробоподготовка и определение концентраций линезолида в плазме крови пациентов проводились по ранее разработанной методике с использованием метода ВЭЖХ-УФ на базе учебно-научной лаборатории по изучению безопасности лекарственных средств кафедры общей и клинической фармакологии РУДН в ГБУЗ «ГКБ № 24 ДЗМ».&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Оцененные в исследовании значения общего клиренса и объема распределения линезолида у недоношенных новорожденных согласуются с представленными ранее в литературе. Выявлена значительная межиндивидуальная ФК вариабельность (коэффициент вариации 42–89%), приводящая к плохой предсказуемости уровня остаточной и максимальной концентрации в конце инфузии при использовании стандартного режима дозирования линезолида 10 мг/кг 3 р/сут. Возможно, такая выраженная межиндивидуальная вариабельность ФК параметров при относительно ограниченном размере выборки не позволила получить по имеющимся данным ТЛМ многофакторную регрессионную модель, которая могла бы предсказывать с приемлемой точностью для большинства включенных в анализ недоношенных новорожденных индивидуальные значения ФК параметров на основе ковариат.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Наблюдаемые расхождения в режимах дозирования, считающихся в разных ФК/ФД исследованиях оптимальными для недоношенных новорожденных, свидетельствуют в пользу применения стандартных режимов только для индивидуализации начального режима дозирования на основе ковариат пациента. Дальнейшие корректировки желательно проводить с использованием процедуры ТЛМ. Использование специализированного программного обеспечения для байесовского подхода и популяционного моделирования позволит проводить индивидуализацию терапии на основе редких измерений ТЛМ, а также начать измерение концентраций, не дожидаясь достижения стационарного распределения, что важно для популяции недоношенных новорожденных.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Резолюция по итогам круглого стола «Пневмонии. От пенициллина до наших дней: что изменилось за последние сто лет»</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p64/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:30:10 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p64/</guid>
      <description></description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Этиологическая структура инфекций респираторного тракта у пациентов различных возрастных групп с первичной цилиарной дискинезией</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p50/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:27:57 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p50/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Изучить этиологическую структуру инфекций респираторного тракта у пациентов с первичной цилиарной дискинезией (ПЦД) в различных возрастных группах.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Было обследовано 173 пациента с подтвержденным диагнозом ПЦД из различных субъектов Российской Федерации в 2023–2025 гг. Далее все больные были распределены на 4 возрастные группы: дети (0–6 лет) – 42 пациента; дети (7–12 лет) – 42 пациента; подростки (13–17 лет) – 43 пациента; взрослые (18 лет и старше) – 46 пациентов. Для проведения исследования были использованы бактериологические методы (MALDI-TOF масс-спектрометрия для идентификации, диско-диффузионный метод для исследования антибиотикочувствительности), молекулярно-генетические и статистические методы.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Сравнительный анализ этиологической структуры в четырех возрастных группах инфекции респираторного тракта у пациентов с ПЦД показал, что наибольшее разнообразие клинически значимых грибковых и бактериальных патогенов наблюдалось в группе подростков – 28 видов, а наименьшее в группе взрослых – 24 вида. В ходе исследования было выявлено, что среди детей и подростков с наибольшей частотой выявляли &lt;em&gt;S. aureus&lt;/em&gt; в возрастных группах: 0–6 лет – в 47,6% случаев; 7–12 лет – 64,3%; подростки (13–17 лет) – 74,4%. Во взрослой возрастной группе преобладала &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; – в 80,4% случаев. В ходе исследования чувствительности к антибактериальным препаратам было выявлено, что 24,4% изолятов &lt;em&gt;S. aureus&lt;/em&gt; обладают мультирезистентностью, тогда как среди изолятов &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; мультирезистеностью обладали 33,3%. Среди грибковых патогенов в большинстве случаев от обследованных больных выделяли грибы рода Candida и Aspergillus.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Проведенное исследование показало, что у пациентов с ПЦД причиной инфекции респираторного тракта в большинстве случаев становятся условно-патогенные бактерии, среди которых преобладают &lt;em&gt;S. aureus&lt;/em&gt; – 53,8%; &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; – 38,7%; &lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt; – 21,4%; &lt;em&gt;S. pneumoniae&lt;/em&gt; – 17,9%. Было установлено, что хронические инфекции легких встречаются чаще во взрослом возрасте (63%), и что этиологической причиной в 100% случаев является &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Современные представления о роли вирусов как этиологического фактора сепсиса</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p25/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:24:49 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p25/</guid>
      <description></description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Местное лечение раневой инфекции: что нового за последнее десятилетие?</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p13/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:22:21 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p13/</guid>
      <description></description>
    </item>
    
    <item>
      <title>Анализ таксономической структуры рода Stenotrophomonas на основе геномных данных</title>
      <link>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p4/</link>
      <pubDate>Thu, 28 May 2026 10:19:27 +0000</pubDate>
      
      <guid>http://cmac-journal.ru/publication/2026/1/cmac-2026-t28-n1-p4/</guid>
      <description>

&lt;h3 id=&#34;цель&#34;&gt;Цель.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Анализ современной таксономической структуры рода Stenotrophomonas на основе геномных данных с учетом ограничений, связанных с процессом номенклатурной валидации.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;материалы-и-методы&#34;&gt;Материалы и методы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Для формирования референсной базы использовались данные c ресурса LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) и геномы, загруженные из базы данных NCBI. Проводился расчет попарных значений средней нуклеотидной идентичности (ANI) и средней аминокислотной идентичности (AAI). Определение видовой принадлежности осуществлялось с использованием порогового значения ANI ≥ 95%. Иерархическая кластеризация выполнялась методом средней связи по матрицам расстояний.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;результаты&#34;&gt;Результаты.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;На основе таксономической информации, представленной в LPSN, была сформирована исходная референсная база, включающая 36 геномов, соответствующих видам таксонам рода Stenotrophomonas. Попарные значения ANI подтвердили четкое разграничение этих геномов на уровне видов. Анализ на основе рассчитанных попарных значений AAI выявил наличие нескольких геномно обособленных кластеров, соответствующих обновленной таксономической схеме, предполагающей разделение рода Stenotrophomonas на несколько родов. Анализ 2332 геномов, отнесенных к роду Stenotrophomonas в базе данных NCBI, показал, что для 15,7% геномов значения ANI по отношению к референсным геномам видов, представленным в LPSN, были ниже порогового значения 95%, что не позволило отнести их к каким-либо видам. Кластеризация при ANI ≥ 95% выявила 102 геномных кластера, часть из которых не содержала геномов видов, представленных в LPSN. Для классификации таких геномов была сформирована расширенная референсная база, включающая репрезентативные геномы соответствующих ANI-кластеров. Использование данной базы позволило отнести все анализируемые геномы либо к таксонам, представленным в LPSN, либо к отдельным геномным кластерам, не имеющим на данный момент валидного номенклатурного статуса.&lt;/p&gt;

&lt;h3 id=&#34;выводы&#34;&gt;Выводы.&lt;/h3&gt;

&lt;p&gt;Полученные результаты демонстрируют, что даже при наличии геномных данных и четких количественных критериев разграничения таксонов таксономическая интерпретация геномных коллекций остается ограниченной вследствие задержки между геномной идентификацией потенциально новых таксонов и их официальным описанием с закреплением типового штамма. Предложенный аналитический подход позволяет корректно определять принадлежность таких геномов к соответcтвующим генотаксономическим группам и обеспечивает воспроизводимый анализ таксономической структуры рода Stenotrophomonas в условиях продолжающегося уточнения таксономической структуры.&lt;/p&gt;
</description>
    </item>
    
  </channel>
</rss>
