Генетическое разнообразие ванкомицинорезистентных Enterococcus faecium, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2021; 23(3):305-313

Тип
Оригинальная статья

Цель.

Изучить генетическое разнообразие ванкомицинорезистентных Enterococcus faecium (VR-E. faecium), выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови методом мультилокусного секвенирования–типирования (МЛСТ).

Материалы и методы.

Были изучены VR-E. faecium, выделенные из гемокультуры больных, находившихся на стационарном лечении в 6 лечебных учреждениях 4 городов России (2003–2019 гг.). Чувствительность E. faecium к ванкомицину определяли методом серийных микроразведений в бульоне (CLSI 2018). Гены резистентности к ванкомицину vanA и vanB исследовали методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). Генотипирование VR-E. faecium проводили методом МЛСТ.

Результаты.

Всего исследовали 83 штамма VR-E. faecium. Гены vanA были детектированы у 71,1% (n = 59) VR-E. faecium, гены vanB – у 28,9% (n = 24). Всего было выявлено 22 сиквенс-типа (ST), которые принадлежали к эпидемическому клональному комплексу СС17. Доминирующими сиквенс-типами оказались ST17 (19,3%), ST78 (18,1%), ST80 (16,9%) и включали 54,3% VR-E. faecium. Другие сиквенс-типы содержали от 1 до 4 штаммов. Для VR-E. faecium vanA по сравнению с VR-E. faecium vanB достоверно чаще была определена принадлежность к ST78 (23,7% против 4,2%, p = 0,0559 соответственно) и к ST80 (23,7% против 0%, p = 0,0079 соответственно) и реже к ST17 (6,8% против 50% соответственно, р < 0,0001). В течение двух периодов исследования (2003–2011 гг. и 2012–2019 гг.) была обнаружена циркуляция 9 сиквенс-типов, включая клоны «высокого риска» ST17 и ST78.

Выводы.

В ходе исследования было выявлено генетическое разнообразие VR-E. faecium, представленное 22 ST. Все VR-E. faecium принадлежали к эпидемическому клональному комплексу СС17 и включали как клоны «высокого риска» ST17 и ST78, так и менее распространенные ST.

Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились