Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacterales в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН 2015–2016

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(2):147-159

​ Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Шайдуллина Э.Р., Азизов И.С., Шек Е.А., Микотина А.В., Кузьменков А.Ю., Дехнич А.В., Козлов Р.С., Семенова Н.В., Слепакова С.А., Шепотайлова Н.В., Стребкова В.В., Рыбина Н.А., Яранцева Н.З., Перевалова Е.Ю., Розанова С.М., Наговицина С.Г., Молдовану М.Г., Насыбуллова З.З., Архипенко М.В., Шахмурадян Р.М., Нижегородцева И.А., Варибрус Е.В., Александрова И.А., Лазарева А.В., Крыжановская О.А., Маркелова Н.Н., Чернявская Ю.Л., Лебедева Е.В., Кириллова Г.Ш., Беккер Г.Г., Попова Л.Д., Елохина Е.В., Смолькова Ю.Е., Зиновьев Д.Ю., Итяева Л.Н., Блинова Г.Ю., Зубарева Н.А., Витязева В.П., Плаксина М.Г., Куцевалова О.Ю., Панова Н.И., Суборова Т.Н., Полухина О.В., Ворошилова Т.М., Чурикова Е.М., Москвитина Е.Н., Кречикова О.И., Петрова Т.А., Мартьянова Н.М., Хохлова К.О., Гудкова Л.В., Быконя С.А., Хохлявина Р.М., Шпилькина Л.В., Бурасова Е.Г., Хребтовская В.А., Молчанова И.В., Звонарева О.В., Корнилова П.А., Крянга В.Г., Портнягина У.С., Шамаева С.Х., Попов Д.А., Вострикова Т.Ю.
10.36488/cmac.2019.2.147-159
нозокомиальные инфекции Enterobacterales антибиотикорезистентность
Раздел
Антибиотикорезистентность
Тип
Оригинальная статья
Публикация
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(2):147-159

Цель.

Определить распространенность устойчивости к антибиотикам и продукции основных приобретенных механизмов резистентности (бета-лактамаз расширенного спектра [БЛРС] и карбапенемаз) у нозокомиальных штаммов Enterobacterales, а также генотипы и принадлежность к «международным клонам высокого риска» карбапенемазопродуцирующих штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных в различных регионах России в рамках многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН 2015–2016».

Материалы и методы.

Всего исследовано 2786 неповторяющихся изолятов энтеробактерий, включая 1316 изолятов Klebsiella pneumoniae и 837 изолятов Escherichia coli, выделенных в 49 стационарах 25 городов России в 2015–2016 гг. Видовую идентификацию изолятов проводили методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Определение чувствительности выполняли референтным методом микроразведений в бульоне. Продукцию БЛРС определяли с помощью фенотипического метода оценки синергизма оксиимино-бета-лактамов с клавулановой кислотой. Наличие генов приобретенных карбапенемаз групп VIM, IMP, NDM, KPC и OXA-48 определяли с помощью ПЦР в реальном времени. Генотипирование K. pneumoniae проводили методом мультилокусного секвенирования-типирования (MLST) согласно схеме, предложенной Институтом Пастера, и по методу Diancourt и соавт.

Результаты.

Энтеробактерии составили в общей сложности 48,2% от всех выделенных бактериальных возбудителей. Наиболее частыми видами были K. pneumoniae (47,2%) и E. coli (30,0%). Большинство исследованных изолятов были резистентными к оксиимино-бета-лактамам: к цефотаксиму – 78,4%, цефтазидиму – 67,2%, цефепиму – 68,4% и азтреонаму – 71,5%. Продукция БЛРС выявлена у 67,8% изолятов. Резистентность к карбапенемам (имипенему, меропенему и эртапенему) проявляли соответственно 6,9%, 6,5% и 23,6% от всех изолятов энтеробактерий. У 14,4% изолятов выявлена продукция карбапенемаз молекулярного класса D группы OXA-48 (11,40%), класса B группы NDM-1 (2,7%) и класса А группы KPC (< 0,1%); у 8 изолятов (0,3%) K. pneumoniae обнаружено одновременное наличие генов OXA-48 и NDM-1, у 1 (< 0,1%) изолята Proteus mirabilis – одновременное наличие генов NDM-1 и VIM. Молекулярное типирование проведено для 57 карбапенемазопродуцирующих изолятов K. pneumoniae, из которых большинство относились к «международным клонам высокого риска»: CG395 (45,6%), CG11 (12,3%), CG147 (10,5%) и CG307 (10,5%). Наиболее высокую активность в отношении нозокомиальных энтеробактерий показали цефтазидим/авибактам (доля резистентных к нему изолятов составила 3,5%) и азтреонам/авибактам (МПК50 и МПК90 составили 0,06 и 0,25 мг/л соответственно). Среди не-бета-лактамных антибиотиков наиболее высокую активность in vitro проявлял колистин, резистентными к которому были 18,6% всех изолятов. Отмечена высокая активность тигециклина в отношении E. coli (3,9% резистентных изолятов) и K. pneumoniae (МПК50 и МПК90 составили 0,5 и 2 мг/л соответственно, что не превышало значения ECOFF (≤ 2 мг/л)).

Выводы.

Результаты проведенного исследования свидетельствуют о чрезвычайно высокой распространенности устойчивости к большинству антибиотиков, включая карбапенемы, и широкое разнообразие детерминант резистентности к карбапенемам у нозокомиальных изолятов энтеробактерий. В связи с этим выбор антибиотиков для эмпирической терапии является крайне затруднительным и требует проведения постоянного микробиологического мониторинга в каждом стационаре.

Сухорукова Марина Витальевна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Эйдельштейн Михаил Владимирович

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Склеенова Елена Юрьевна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Иванчик Натали Владимировна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Шайдуллина Эльвира Расиловна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет», Казань, Россия

Азизов Илья Сулейманович

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Шек Евгений Александрович

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Микотина Анна Владимировна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Кузьменков Алексей Юрьевич

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Дехнич Андрей Владимирович

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Козлов Роман Сергеевич

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Семенова Н.В.

Архангельская областная клиническая больница, Архангельск, Россия

Слепакова С.А.

Амурская областная детская клиническая больница, Благовещенск, Россия

Шепотайлова Н.В.

Амурская областная детская клиническая больница, Благовещенск, Россия

Стребкова В.В.

Воронежская городская клиническая больница скорой медицинской помощи №10, Воронеж, Россия

Рыбина Н.А.

Воронежская городская клиническая больница скорой медицинской помощи №10, Воронеж, Россия

Яранцева Н.З.

Свердловская областная клиническая психиатрическая больница, Екатеринбург, Россия

Перевалова Е.Ю.

Клинико-диагностический центр, Екатеринбург, Россия

Розанова С.М.

Клинико-диагностический центр, Екатеринбург, Россия

Наговицина С.Г.

Городская клиническая больница №9, Ижевск, Россия

Молдовану М.Г.

Городская клиническая больница №9, Ижевск, Россия

Насыбуллова З.З.

Республиканская клиническая больница, Казань, Россия

Архипенко М.В.

Научно-исследовательский институт – Краевая клиническая больница №1 им. проф. С.В. Очаповского, Краснодар, Россия

Шахмурадян Р.М.

Научно-исследовательский институт – Краевая клиническая больница №1 им. проф. С.В. Очаповского, Краснодар, Россия

Нижегородцева И.А.

Краевая клиническая больница №2, Краснодар, Россия

Варибрус Е.В.

Краевая клиническая больница №2, Краснодар, Россия

Александрова И.А.

ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва, Россия

Лазарева А.В.

ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, Москва, Россия

Крыжановская О.А.

ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, Москва, Россия

Маркелова Н.Н.

ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадиологии» Минздрава России, Москва, Россия

Чернявская Ю.Л.

Мурманская областная клиническая больница им. П.А. Баяндина, Мурманск, Россия

Лебедева Е.В.

Мурманская областная клиническая больница им. П.А. Баяндина, Мурманск, Россия

Кириллова Г.Ш.

Больница скорой медицинской помощи, Набережные Челны, Россия

Беккер Г.Г.

Дорожная клиническая больница на ст. Новосибирск-Главный ОАО «РЖД», Новосибирск, Россия

Попова Л.Д.

Областная клиническая больница, Омск, Россия

Елохина Е.В.

Областная клиническая больница, Омск, Россия

Смолькова Ю.Е.

Клиническая больница №6 им. Г.А. Захарьина, Пенза, Россия

Зиновьев Д.Ю.

Клиническая больница №6 им. Г.А. Захарьина, Пенза, Россия

Итяева Л.Н.

Областной онкологический диспансер, Пенза, Россия

Блинова Г.Ю.

Областной онкологический диспансер, Пенза, Россия

Зубарева Н.А.

ФГБОУ ВО «Пермский государственный медицинский университет им. акад. Е.А. Вагнера» Минздрава России, Пермь, Россия

Витязева В.П.

Детская республиканская больница, Петрозаводск, Россия

Плаксина М.Г.

Детская республиканская больница, Петрозаводск, Россия

Куцевалова О.Ю.

ФГБУ «Ростовский научно-исследовательский онкологический институт» Минздрава России, Ростов-на-Дону, Россия

Панова Н.И.

ФГБУ «Ростовский научно-исследовательский онкологический институт» Минздрава России, Ростов-на-Дону, Россия

Суборова Т.Н.

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова» Минобороны России, Санкт-Петербург, Россия

Полухина О.В.

Санкт-Петербург, Россия

Ворошилова Т.М.

ФГБУ «Всероссийский центр экстренной и радиационной медицины им. А.М. Никифорова» МЧС России, Санкт-Петербург, Россия

Чурикова Е.М.

ФГБУ «Всероссийский центр экстренной и радиационной медицины им. А.М. Никифорова» МЧС России, Санкт-Петербург, Россия

Москвитина Екатерина Николаевна

ФГБУ «Сибирский федеральный научно-клинический центр» ФМБА России, Северск, Россия

Кречикова Ольга Ивановна

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия

Петрова Т.А.

Клиническая больница №1, Смоленск, Россия

Мартьянова Н.М.

Тольяттинская городская клиническая больница №5, Тольятти, Россия

Хохлова К.О.

Тольяттинская городская клиническая больница №5, Тольятти, Россия

Гудкова Л.В.

Томская областная клиническая больница, Томск, Россия

Быконя С.А.

Томская областная клиническая больница, Томск, Россия

Хохлявина Р.М.

Областная клиническая больница №1, Тюмень, Россия

Шпилькина Л.В.

Областная клиническая больница №1, Тюмень, Россия

Бурасова Е.Г.

Республиканская клиническая больница им. Н.А. Семашко, Улан-Удэ, Россия

Хребтовская В.А.

Республиканская клиническая больница им. Н.А. Семашко, Улан-Удэ, Россия

Молчанова И.В.

Челябинская областная клиническая больница, Челябинск, Россия

Звонарева О.В.

Челябинская областная клиническая больница, Челябинск, Россия

Корнилова П.А.

Республиканская больница №1 – Национальный центр медицины, Якутск, Россия

Крянга В.Г.

Республиканская больница №1 – Национальный центр медицины, Якутск, Россия

Портнягина У.С.

Республиканская больница №2 – Центр экстренной медицинской помощи, Якутск, Россия

Шамаева С.Х.

Республиканская больница №2 – Центр экстренной медицинской помощи, Якутск, Россия

Попов Дмитрий Александрович

ФГБУ «НМИЦ ССХ им. А.Н. Бакулева» Минздрава России, Москва, Россия

Вострикова Т.Ю.

ФГБУ «НМИЦ ССХ им. А.Н. Бакулева» Минздрава России, Москва, Россия

  • 1. Reshedko G.K., Ryabkova E.L., Kretchikova O.I., et al. Antimicrobial Resistance Patterns of Gram-negative Nosocomial Pathogens in Russian ICUs. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2008;10(2):96-112. Russian. (Решедько Г.К., Рябкова Е.Л., Кречикова О.И. и соавт. Резистентность к антибиотикам грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций в ОРИТ многопрофильных стационаров России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2008;10(2):96-112.)
  • 2. Sukhorukova M., Kozyreva V., Ivanchik N., et al. Five-year trends in the prevalence and types of ESBLs and antimicrobial susceptibility of ESBL-producing nosocomial strains of Enterobacteriaceae in Russia. Proceedings of 20th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID). Vienna, Austria; 2010. Abstr. P716.
  • 3. Skleenova E., Sukhorukova M., Timokhova A., et al. Sharp increase in carbapenem-non-susceptibility and carbapenemase production rates in nosocomial Gram-negative bacteria in Russia over the last decade. Proceedings of 53rd Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC). Denver, CO, USA; 2012. Abstr. C2-1092.
  • 4. Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., Shevchenko O.V., et al. Prevalence and Molecular Epidemiology of Gram-negative Bacteria Producing Metallo-β-lactamases (MBLs) in Russia, Belarus and Kazakhstan. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2012;14(2):132-152. Russian. (Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Шевченко О.В. и соавт. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих металло-β-лактамазы, в России, Беларуси и Казахстане. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2012;14(2):132-152.)
  • 5. Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacteriaceae isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study “MARATHON” 2011-2012. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2014;16(4):254-265. Russian. (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011-2012 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014;16(4):254-265.)
  • 6. Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacteriaceae isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study “MARATHON” 2013-2014. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2017;19(1):49-56. Russian. (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2013-2014 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):49-56.).
  • 7. Edelstein M., Pimkin M., Palagin I., Edelstein I., Stratchounski L. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extendedspectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob Agents Chemother. 2003;47(12):3724-3732. DOI: 10.1128/aac.47.12.3724-3732.2003
  • 8. ISO 20776-1:2006 “Clinical laboratory testing and in vitro diagnostic test systems - Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices. Part 1. Reference method for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing aerobic bacteria involved in infectious diseases”.
  • 9. GOST R ISO 20776-1-2010 Clinical laboratory testing and in vitro diagnostic test systems. Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices. Part 1. Reference method for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing aerobic bacteria involved in infection us diseases. Russian. (Национальный Стандарт ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010 Клинические лабораторные исследования и диагностические тест-системы in vitroю Исследование чувствительности инфекционных агентов и оценка функциональных характеристик изделий для исследования чувствительности к антимикробным средствам. Часть 1. Референтный метод лабораторного исследования активности антимикробных агентов против быстрорастущих аэробных бактерий, вызывающих инфекционные болезни.)
  • 10. European Committee on Antimicrobial Susceptibility testing (EUCAST). Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Ver. 9.0. 2019. Available at: www.eucast.org/clinical_breakpoints/. Accessed June 24, 2019.
  • 11. van der Zwaluw K., de Haan A., Pluister G.N., et al. The Carbapenem Inactivation Method (CIM), a Simple and Low-Cost Alternative for the Carba NP Test to Assess Phenotypic Carbapenemase Activity in Gram-Negative Rods. PLoS One. 2015;10:e0123690. DOI: 10.1371/journal.pone.0123690
  • 12. EUCAST guidelines for detection of resistance mechanisms and specific resistances of clinical and/or epidemiological importance. Ver 2.0. 2017. Available at: www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Resistance_mechanisms/EUCAST_detection_of_resistance_mechanisms_170711.pdf. Accessed June 24, 2019.
  • 13. Diancourt L., Passet V., Verhoef J., Grimont P.A., Brisse S. Multilocus sequence typing of Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates. J Clin Microbiol. 2005;43:4178-4182. DOI: 10.1128/JCM.43.8.4178-4182.2005
  • 14. Tigecycline / Klebsiella pneumoniae International MIC Distribution – Reference Database 2019-07-19. Available at: https://mic.eucast.org/Eucast2/regShow.jsp?Id=41209. Accessed July 19, 2019.
Просмотров
0 Аннотация
0 PDF
0 Цитирования
Поделились