Аннотация
Резистентность к антимикробным препаратам является серьезной угрозой для здравоохранения и требует повышенного внимания со стороны медицинского сообщества. Ключевую роль в наблюдении за динамикой чувствительности микроорганизмов играют системы мониторинга антибиотикорезистентности. Большинство существующих систем используют данные глобального масштаба, однако для практического применения первостепенное значение имеют локальные данные. Уникальная онлайн-платформа AMRcloud (http://amrcloud.net) предназначена для обработки пользовательских данных по резистентности к антимикробным препаратам. Структурные модули модифицируются в соответствии с запросами исследователей. Приложение обладает мощными графическими возможностями, системой анализа данных с автоматической интерпретацией результатов определения чувствительности. Геокодирование данных осуществляется двойным способом, а информационный обмен результатами настраивается пользователем. Использование AMRcloud позволяет исследователю создать собственную методологию организации первичных данных и их оценки.
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России, Смоленск, Россия
-
1.
Michael C.A., Dominey-Howes D., Labbate M. The antimicrobial resistance crisis: causes, consequences, and management. Front Public Health. 2014;2:145.
DOI: 10.3389/fpubh.2014.00145
-
2.
Perez F., Villegas M.V. The role of surveillance systems in confronting the global crisis of antibiotic-resistant bacteria. Curr Opin Infect Dis. 2015;28(4):375-383.
DOI: 10.1097/QCO.0000000000000182
-
3.
Watkins R.R., Bonomo R.A. Overview: Global and local impact of antibiotic resistance. Infect Dis Clin North Am. 2016;30(2):313-322.
DOI: 10.1016/j.idc.2016.02.001
-
4.
Ferri M., Ranucci E., Romagnoli P., Giaccone V. Antimicrobial resistance: A global emerging threat to public health systems. Crit Rev Food Sci Nutr. 2017;57(13):2857-2876.
DOI: 10.1080/10408398.2015.1077192
-
5.
Collignon P. Antibiotic resistance: Are we all doomed? Intern Med J. 2015;45(11):1109-1115.
DOI: 10.1111/imj.12902
-
6.
WHO. Global Action Plan on Antimicrobial Resistance. Geneva, Switzerland; 2015. Available at: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/254884/9789244509760-rus.pdf?sequence=1. Accessed August 2019.
-
7.
Tacconelli E., Sifakis F., Harbarth S., et al. Surveillance for control of antimicrobial resistance. Lancet Infect Dis. 2018;18(3):e99-e106.
DOI: 10.1016/S1473-3099(17)30485-1
-
8.
Li Y., Gong Z., Lu Y., et al. Impact of nosocomial infections surveillance on nosocomial infection rates: A systematic review. Int J Surg. 2017;42:164-169.
DOI: 10.1016/j.ijsu.2017.04.065
-
9.
WHO, FAO, OIE. Monitoring and Evaluation of the Global Action Plan on Antimicrobial Resistance: Framework and Recommended Indicators. Geneva, Switzerland; 2019. Available at: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/325006/9789241515665-eng.pdf?sequence=1&isAllowed=y. Accessed July 2019.
-
10.
Freitas A., Curry E. Big Data Curation. In: New Horizons for a Data-Driven Economy. Cham: Springer; 2016:87-118.
-
11.
Heidorn B. Shedding light on the dark data in the long tail of science. Libr Trends. 2008;57(2):280-299.
DOI: 10.1353/lib.0.0036
-
12.
Bowers S. Scientific workflow, provenance, and data modeling challenges and approaches. J Data Semant. 2012;1(1):19-30.
DOI: 10.1007/s13740-012-0004-y
-
13.
Noble W.S. A Quick Guide to Organizing Computational Biology Projects. PLoS Comput Biol. 2009;5(7):e1000424.
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1000424
-
14.
Goodman S.N., Fanelli D., Ioannidis J.P. What does research reproducibility mean? Sci Transl Med. 2016;8(341):341ps12-341ps12.
DOI: 10.1126/scitranslmed.aaf5027
-
15.
Klein M., Van de Sompel H., Sanderson R., et al. Scholarly Context Not Found: One in Five Articles Suffers from Reference Rot. PLoS One. 2014;9(12):e115253.
DOI: 10.1371/journal.pone.0115253
-
16.
Schloss P.D. Identifying and Overcoming Threats to Reproducibility, Replicability, Robustness, and Generalizability in Microbiome Research. MBio. 2018;9(3):e00525-18.
DOI: 10.1128/MBIO.00525-18
-
17.
Casadevall A., Ellis L.M., Davies E.W., McFall-Ngai M., Fang F.C. A Framework for Improving the Quality of Research in the Biological Sciences. MBio. 2016;7(4).
DOI: 10.1128/mBio.01256-16
-
18.
Lammie S.L., Hughes J.M. Antimicrobial Resistance, Food Safety, and One Health: The Need for Convergence. Annu Rev Food Sci Technol. 2016;7(1):287-312.
DOI: 10.1146/annurevfood-041715-033251